More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24090 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_24090  permease  100 
 
 		 484 aa  927    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1382  Xanthine/uracil/vitamin C permease  72.41 
 
 		 488 aa  617  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0835214  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2925  Xanthine/uracil/vitamin C permease  62.96 
 
 		 491 aa  594  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703881  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3928  xanthine/uracil/vitamin C permease  65.7 
 
 		 491 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0864  Xanthine/uracil/vitamin C permease  64.6 
 
 		 517 aa  575  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214606  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30830  permease  64.03 
 
 		 494 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.896956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3290  xanthine/uracil/vitamin C permease  61.65 
 
 		 506 aa  569  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1996  Xanthine/uracil/vitamin C permease  62.27 
 
 		 518 aa  560  1e-158  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0025  Xanthine/uracil/vitamin C permease  58.98 
 
 		 515 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13510  permease  58.94 
 
 		 502 aa  521  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8894  xanthine/uracil/vitamin C transporter  57.8 
 
 		 487 aa  518  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0817  Xanthine/uracil/vitamin C permease  59.33 
 
 		 507 aa  491  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1251  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.53 
 
 		 491 aa  479  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.481719  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0416  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.38 
 
 		 490 aa  475  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0380  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.02 
 
 		 480 aa  475  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0504  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.25 
 
 		 490 aa  475  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0601  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.17 
 
 		 481 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000948435 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0240  putative xanthine/uracil permease  54.34 
 
 		 493 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8411  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.68 
 
 		 463 aa  464  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3203  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.8 
 
 		 521 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0138  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.93 
 
 		 486 aa  453  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33970  permease  54 
 
 		 488 aa  449  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114648  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3423  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.17 
 
 		 498 aa  449  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0488  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.77 
 
 		 479 aa  433  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3129  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.88 
 
 		 475 aa  428  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337954  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2543  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.5 
 
 		 483 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0284041  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2567  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.31 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.390928 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17840  permease  53.56 
 
 		 496 aa  405  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457216  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4178  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.59 
 
 		 484 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0392  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.79 
 
 		 470 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0353  xanthine/uracil/vitamin C permease  50 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.457935  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0342  xanthine/uracil/vitamin C permease  50 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0363  xanthine/uracil/vitamin C permease  50 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.92632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0346  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.67 
 
 		 470 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.16 
 
 		 465 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3345  xanthine/uracil/vitamin C transporter  47.37 
 
 		 456 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0597  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.97 
 
 		 496 aa  352  1e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2228  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.01 
 
 		 480 aa  351  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  0.0422886 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.17 
 
 		 456 aa  350  4e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3490  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.17 
 
 		 456 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534774  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3412  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.73 
 
 		 460 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.992629  normal  0.11074 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  38.45 
 
 		 444 aa  301  1e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.11 
 
 		 444 aa  296  6e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.11 
 
 		 444 aa  296  6e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0766  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.18 
 
 		 438 aa  293  5e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.383073  normal  0.743941 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.62 
 
 		 442 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38 
 
 		 441 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2962  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.35 
 
 		 452 aa  290  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.610327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.87 
 
 		 460 aa  288  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03550  permease  39.11 
 
 		 437 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0299819 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.16 
 
 		 433 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.34 
 
 		 440 aa  284  3.0000000000000004e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.35 
 
 		 441 aa  282  9e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.78 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.53 
 
 		 433 aa  280  3e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.65 
 
 		 433 aa  279  9e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.18 
 
 		 463 aa  278  2e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.11 
 
 		 433 aa  277  3e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.6 
 
 		 429 aa  276  8e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.17 
 
 		 462 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.81 
 
 		 441 aa  272  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.81 
 
 		 429 aa  271  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0295  xanthine/uracil permease family protein  37.95 
 
 		 441 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0302  xanthine/uracil permease family protein  37.74 
 
 		 441 aa  270  5e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00487612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0255  xanthine/uracil permease family protein  37.74 
 
 		 441 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0241  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  37.74 
 
 		 441 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.864417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0321  xanthine/uracil permease family protein  37.74 
 
 		 441 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000181359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0270  xanthine/uracil permease family protein  37.74 
 
 		 441 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0137601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0248  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.53 
 
 		 441 aa  269  7e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000150063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0293  xanthine/uracil permease family protein  37.74 
 
 		 441 aa  269  8e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.903242  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0244  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  37.74 
 
 		 441 aa  269  8e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242401  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.92 
 
 		 457 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5022  xanthine/uracil permease family protein  37.1 
 
 		 441 aa  268  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000757996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2607  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.45 
 
 		 466 aa  267  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2522  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.18 
 
 		 438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.013559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.21 
 
 		 446 aa  267  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.02 
 
 		 429 aa  266  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.91 
 
 		 433 aa  266  5e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.84 
 
 		 435 aa  266  7e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.49 
 
 		 471 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.81 
 
 		 429 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.39 
 
 		 467 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.81 
 
 		 429 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.74 
 
 		 429 aa  265  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.17 
 
 		 429 aa  264  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.85 
 
 		 453 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0254  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.66 
 
 		 441 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000390188  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.11 
 
 		 430 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.6 
 
 		 429 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.71 
 
 		 431 aa  263  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.38 
 
 		 429 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.92 
 
 		 446 aa  262  8e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  35.96 
 
 		 429 aa  263  8e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.81 
 
 		 429 aa  262  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.38 
 
 		 429 aa  262  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  33.69 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  36.81 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.38 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.5 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.38 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0168268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>