More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17380 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  100 
 
 		 86 aa  166  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  67.44 
 
 		 86 aa  113  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  67.9 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  71.08 
 
 		 86 aa  104  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  65.12 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  66.67 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  73.33 
 
 		 86 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  66.28 
 
 		 86 aa  102  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  64.2 
 
 		 86 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  65.12 
 
 		 86 aa  100  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  62.96 
 
 		 86 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  63.95 
 
 		 88 aa  99.4  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  68.6 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  65.85 
 
 		 88 aa  96.7  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  64.63 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  65.43 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  66.25 
 
 		 86 aa  94.4  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  60.47 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  61.25 
 
 		 86 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  61.25 
 
 		 86 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  61.25 
 
 		 86 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  60.47 
 
 		 88 aa  93.6  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  60.47 
 
 		 88 aa  93.2  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  65.12 
 
 		 86 aa  92  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  61.73 
 
 		 86 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  61.63 
 
 		 95 aa  90.9  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  63.95 
 
 		 86 aa  90.5  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  63.29 
 
 		 95 aa  90.1  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12430  SSU ribosomal protein S20P  66.28 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0372924  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  61.63 
 
 		 86 aa  89  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  58.75 
 
 		 86 aa  88.2  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  60.47 
 
 		 86 aa  87.4  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  60.76 
 
 		 86 aa  87  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  57.83 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  56.98 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  56.79 
 
 		 87 aa  84.7  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  58.44 
 
 		 151 aa  84  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  60.47 
 
 		 86 aa  83.6  9e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1614  ribosomal protein S20  70.93 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1654  ribosomal protein S20  56.96 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.158748  hitchhiker  0.00316633 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0854  ribosomal protein S20  65 
 
 		 86 aa  80.1  0.000000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  54.88 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  51.9 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  53.66 
 
 		 89 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07740  ribosomal protein S20  59.26 
 
 		 172 aa  73.9  0.0000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.603346 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  48.78 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0583  30S ribosomal protein S20  62.5 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  45.35 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1281  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000755686  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  50.63 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  46.67 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  53.57 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  45.12 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 89 aa  67  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  48.78 
 
 		 88 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  48.05 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  49.38 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  48.15 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0582  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000160392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00027  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000413778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000429038  normal  0.540603 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000506786  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000013085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3462  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000449993  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000579115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  45.45 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000313857  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  48.15 
 
 		 84 aa  62  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7677  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 92 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1184  ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0850  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000116553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>