More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0128 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0128  Chloride peroxidase  100 
 
 		 275 aa  562  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00372982  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1384  alpha/beta hydrolase fold protein  73.57 
 
 		 280 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291568  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34740  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  71.94 
 
 		 280 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0253397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  63.67 
 
 		 277 aa  357  9.999999999999999e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  61.65 
 
 		 277 aa  352  2.9999999999999997e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3996  alpha/beta hydrolase fold  62.59 
 
 		 277 aa  351  7e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3228  alpha/beta hydrolase fold protein  63.8 
 
 		 278 aa  328  6e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  59.14 
 
 		 294 aa  328  8e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2691  alpha/beta hydrolase fold protein  55.04 
 
 		 276 aa  288  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  50.18 
 
 		 277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  49.13 
 
 		 286 aa  286  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  47.84 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  47.31 
 
 		 279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  47.12 
 
 		 281 aa  266  4e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  46.95 
 
 		 279 aa  261  6e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4189  chloride peroxidase  59.62 
 
 		 257 aa  254  8e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.766696 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0261  alpha/beta hydrolase fold protein  48.19 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.812291  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  44.36 
 
 		 273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  39.15 
 
 		 276 aa  209  3e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  41.99 
 
 		 278 aa  208  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  40.21 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  41.64 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  41.64 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  41.64 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  41.64 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3158  bromoperoxidase  41.64 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00429075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  43.06 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  42.16 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  42.32 
 
 		 272 aa  201  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  39.24 
 
 		 278 aa  198  7e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  42.26 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  41.51 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  42.34 
 
 		 273 aa  195  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  43.23 
 
 		 278 aa  191  8e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  41.06 
 
 		 278 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  40.45 
 
 		 273 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  39.85 
 
 		 272 aa  188  8e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 		 272 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  40.82 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  37.83 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  39.85 
 
 		 272 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  39.85 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  38.15 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  39.86 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3028  alpha/beta hydrolase fold protein  41.15 
 
 		 278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.821303 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  38.2 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 		 273 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  40.23 
 
 		 290 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  40.3 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  40.38 
 
 		 334 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  40.82 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  40.82 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  38.58 
 
 		 273 aa  175  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  36.88 
 
 		 281 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  38.01 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 		 297 aa  173  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  35.94 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  37.78 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  35.58 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  40.15 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  36.98 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  36.09 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  37.12 
 
 		 273 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  38.77 
 
 		 277 aa  168  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.3 
 
 		 273 aa  168  8e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  35.32 
 
 		 276 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  37.28 
 
 		 274 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  35.23 
 
 		 324 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  38.97 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  36.49 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  36.43 
 
 		 275 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 		 328 aa  165  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 274 aa  165  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  40.3 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  36.3 
 
 		 338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  40.3 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  38.15 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  37.97 
 
 		 273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6690  alpha/beta hydrolase fold  38.38 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  34.52 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3320  alpha/beta hydrolase fold protein  37.01 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  36.3 
 
 		 274 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4668  non-heme chloroperoxidase  37.13 
 
 		 276 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  35.34 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 		 273 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5825  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 		 276 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0224159  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7030  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  32.85 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37 
 
 		 281 aa  155  7e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.270497  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1465  chloride peroxidase  34.88 
 
 		 326 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6363  chloride peroxidase  34.88 
 
 		 326 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.669549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0603  non-heme chloroperoxidase  37.08 
 
 		 273 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>