54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0063 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0063  SpoOM family protein  100 
 
 
259 aa  496  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.656988  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2353  SpoOM family protein  67.05 
 
 
259 aa  320  1e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174228  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2907  SpoOM  57.36 
 
 
259 aa  293  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2305  SpoOM family protein  56.98 
 
 
259 aa  293  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.983136  normal  0.530714 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2575  SpoOM family protein  53.25 
 
 
261 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0270  SpoOM family protein  42.86 
 
 
262 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1250  hypothetical protein  46.77 
 
 
324 aa  208  8e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2980  putative SpoOM-related protein  43.02 
 
 
257 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.771223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1589  SpoOM family protein  40.93 
 
 
317 aa  204  8e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.724743  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1549  SpoOM family protein  40.93 
 
 
316 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0376095  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4556  SpoOM family protein  44.98 
 
 
330 aa  201  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20360  sporulation control protein  47.66 
 
 
256 aa  197  2e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585813  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3762  SpoOM family protein  43.63 
 
 
376 aa  194  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.548375  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1597  SpoOM family protein  40.93 
 
 
261 aa  189  3e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0951  SpoOM family protein  42.92 
 
 
397 aa  185  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.779484  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0409  SpoOM family protein  44.14 
 
 
335 aa  183  2e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311537  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5804  Sporulation control protein-like protein  43.16 
 
 
323 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0466499  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4403  SpoOM family protein  42.02 
 
 
256 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294565  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4399  SpoOM family protein  39.45 
 
 
270 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4400  SpoOM family protein  38.14 
 
 
254 aa  153  3e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3153  SpoOM family protein  33.07 
 
 
254 aa  127  1e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0145478  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02077  hypothetical protein  34.25 
 
 
247 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003718  putative SpoOM-related protein  34.15 
 
 
247 aa  122  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1236  SpoOM family protein  34.2 
 
 
254 aa  120  2e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2416  putative sporulation-control protein Spo0M  28.12 
 
 
251 aa  115  9e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2125  SpoOM family protein  28.12 
 
 
251 aa  114  1e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.359088  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2087  sporulation-control protein  27.73 
 
 
251 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2091  sporulation-control protein  27.73 
 
 
251 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00354659  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1506  SpoOM family protein  34.1 
 
 
318 aa  112  7e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118009  hitchhiker  0.00241219 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1337  SpoOM family protein  33.47 
 
 
241 aa  111  1e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2308  sporulation-control protein Spo0M  27.63 
 
 
252 aa  110  2e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2153  sporulation-control protein Spo0M  27.63 
 
 
252 aa  110  2e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0500171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2333  putative sporulation-control protein Spo0M  27.34 
 
 
251 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2289  putative sporulation-control protein Spo0M  29.87 
 
 
251 aa  108  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3034  putative sporulation-control protein Spo0M  27.73 
 
 
251 aa  108  8e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1458  SpoOM family protein  31.48 
 
 
246 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2662  SpoOM family protein  33.33 
 
 
246 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2729  SpoOM family protein  33.33 
 
 
246 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.863876  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2836  SpoOM family protein  33.33 
 
 
246 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2848  SpoOM-related protein  31.94 
 
 
246 aa  106  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1761  putative sporulation-control protein  30.14 
 
 
248 aa  104  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0034341  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3245  SpoOM family protein  34.55 
 
 
250 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00398  sporulation control protein  34.67 
 
 
268 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1370  SpoOM family protein  31.45 
 
 
305 aa  99.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1070  SpoOM family protein  34.42 
 
 
327 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002050  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1411  SpoOM family protein  29.18 
 
 
312 aa  97.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.271045 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0420  SpoOM family protein  29.55 
 
 
321 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  1.32469e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0048  putative sporulation-control protein  31.9 
 
 
261 aa  93.2  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0812821  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2480  SpoOM-related protein  29.6 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0185  SpoOM family protein  29.37 
 
 
318 aa  80.9  2e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1266  SpoOM family protein  30.34 
 
 
132 aa  68.6  9e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  3.50591e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2148  SpoOM family protein  32.62 
 
 
133 aa  63.9  2e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0764  hypothetical protein  32.99 
 
 
228 aa  42.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>