More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0013 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0013  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  100 
 
 
466 aa  907  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.256638  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3194  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  49.77 
 
 
467 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  1.49665e-06  hitchhiker  0.000297481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0418  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  45.85 
 
 
495 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3524  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.86 
 
 
470 aa  337  2e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  1.71122e-05  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2271  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.37 
 
 
453 aa  272  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2211  sugar transferase  37.41 
 
 
502 aa  240  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645155  normal  0.401902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4131  sugar transferase  35.25 
 
 
525 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0135201  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3584  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  39.94 
 
 
504 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.356209  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3589  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.94 
 
 
504 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3657  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.94 
 
 
504 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1950  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  41.16 
 
 
470 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.756109  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4475  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36 
 
 
463 aa  223  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0062  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  32.61 
 
 
457 aa  223  7e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2948  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.59 
 
 
476 aa  221  2e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1637  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.79 
 
 
475 aa  221  2e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0272  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.51 
 
 
477 aa  217  3e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3443  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  33.74 
 
 
471 aa  206  5e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.649798  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1796  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.51 
 
 
478 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3542  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.89 
 
 
473 aa  204  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1774  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.49 
 
 
483 aa  201  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2026  glycosyltransferase  35.74 
 
 
467 aa  195  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.910937  normal  0.952991 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02480  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  33.54 
 
 
484 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0746534  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1487  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  33.41 
 
 
477 aa  190  6e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1125  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.93 
 
 
393 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0147  polysaccharide biosythesis protein, putative  38.41 
 
 
464 aa  188  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1807  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.98 
 
 
517 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2191  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.38 
 
 
518 aa  187  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.894429  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1856  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.38 
 
 
536 aa  186  9e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.726353 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0535  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  34.13 
 
 
461 aa  185  1e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1065  polysaccharide biosythesis protein, putative  34.45 
 
 
464 aa  185  2e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1070  sugar transferase  30.65 
 
 
469 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4288  sugar transferase  35.54 
 
 
477 aa  182  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.222096 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  31.61 
 
 
464 aa  181  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.250613  normal  0.0594432 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3510  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.33 
 
 
469 aa  179  8e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3578  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  32.18 
 
 
512 aa  179  9e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001326  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsA sugar transferase  31.5 
 
 
466 aa  179  9e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183257  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0660  putative sugar transferase  37.97 
 
 
460 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0646  putative sugar transferase  37.97 
 
 
460 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3829  sugar transferase  36.62 
 
 
464 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0822  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  37.97 
 
 
460 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2193  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.97 
 
 
461 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2514  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.97 
 
 
460 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2892  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.97 
 
 
460 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0046  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  37.97 
 
 
460 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1310  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.93 
 
 
520 aa  176  1e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2661  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  35.34 
 
 
464 aa  175  1e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0848752  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2319  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.82 
 
 
496 aa  175  2e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3089  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  32.54 
 
 
518 aa  174  3e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.411544  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2860  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  33.45 
 
 
468 aa  174  3e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2981  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  33.53 
 
 
464 aa  174  4e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  3.41548e-05 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3291  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.47 
 
 
454 aa  174  4e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1999  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  47.34 
 
 
465 aa  174  4e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.267796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1610  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  33.62 
 
 
464 aa  173  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.3392e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1979  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.67 
 
 
457 aa  173  6e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0160004 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1222  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.13 
 
 
521 aa  173  6e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.957103  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05207  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  33.22 
 
 
466 aa  172  9e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  33.43 
 
 
464 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2339  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  33.43 
 
 
464 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2509  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  32.99 
 
 
516 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4607  putative sugar transferase family protein  34.19 
 
 
508 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.512572  normal  0.0960232 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01953  predicted UDP-glucose lipid carrier transferase  33.43 
 
 
464 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00395931  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01942  hypothetical protein  33.43 
 
 
464 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1698  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  33.63 
 
 
460 aa  172  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0279884  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4388  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.66 
 
 
468 aa  172  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1412  sugar transferase  32.13 
 
 
510 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2715  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  33.44 
 
 
464 aa  171  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190611 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1597  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  33.49 
 
 
461 aa  171  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1015  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  33.14 
 
 
464 aa  171  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.742651  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2083  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  32.42 
 
 
472 aa  170  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2466  sugar transferase  35.46 
 
 
510 aa  171  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.569757  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2713  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.33 
 
 
473 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.821002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2682  sugar transferase  33.17 
 
 
514 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115082  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0458  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  33.14 
 
 
465 aa  170  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3529  capsular polysaccharide biosynthesis protein PslA  33.99 
 
 
478 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988428  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3301  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  33.62 
 
 
478 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2479  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  32.23 
 
 
459 aa  169  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1382  sugar transferase  33.23 
 
 
466 aa  169  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.254818  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1951  sugar transferase  32.97 
 
 
472 aa  169  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal  0.0120821 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1057  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.1 
 
 
465 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3010  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.4 
 
 
478 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1185  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  33.14 
 
 
464 aa  169  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1801  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  34.06 
 
 
460 aa  169  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4994  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  30.77 
 
 
470 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13272  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3721  sugar transferase  34.95 
 
 
362 aa  168  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.243024  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0851  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  34.52 
 
 
547 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.985925  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2371  sugar transferase  37.55 
 
 
488 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.640414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3142  sugar transferase, putative  36.65 
 
 
473 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2712  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.81 
 
 
505 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.104173 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2673  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  33.11 
 
 
463 aa  168  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.502401  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0402  sugar transferase  37.12 
 
 
494 aa  167  3e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597497  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2223  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  32.68 
 
 
458 aa  167  3e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604433  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2276  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  27.15 
 
 
456 aa  167  3e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.04182e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1801  sugar transferase  35.33 
 
 
471 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3449  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.5 
 
 
469 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0781  sugar transferase  30.07 
 
 
512 aa  167  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0199  putative glycosyltransferase  34.91 
 
 
464 aa  167  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.954488  normal  0.493075 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3231  sugar transferase  34.82 
 
 
469 aa  166  7e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143756  normal  0.890863 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5835  UDP-sugar lipid carrier transferase  34.92 
 
 
468 aa  166  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0143  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  30.48 
 
 
499 aa  166  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.381728  normal  0.0528776 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3176  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  33.63 
 
 
483 aa  166  9e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>