More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2371 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2371  sugar transferase  100 
 
 
488 aa  982    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.640414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2712  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.75 
 
 
505 aa  295  9e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.104173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2955  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  43.11 
 
 
506 aa  280  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622356  normal  0.0348556 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3089  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  43.42 
 
 
518 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.411544  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5211  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.51 
 
 
506 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4607  putative sugar transferase family protein  43.06 
 
 
508 aa  272  9e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.512572  normal  0.0960232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2682  sugar transferase  42.22 
 
 
514 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115082  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0781  sugar transferase  38.23 
 
 
512 aa  267  2.9999999999999995e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1154  sugar transferase  41.76 
 
 
510 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0775  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.97 
 
 
512 aa  266  5e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2509  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.52 
 
 
516 aa  266  7e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1807  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.05 
 
 
517 aa  265  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1856  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.68 
 
 
536 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.726353 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2191  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.68 
 
 
518 aa  264  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.894429  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2466  sugar transferase  39.8 
 
 
510 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.569757  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2659  sugar transferase  41.18 
 
 
509 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.155014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4288  sugar transferase  42.05 
 
 
477 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.222096 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2694  sugar transferase  40.33 
 
 
509 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.335678  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1222  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.1 
 
 
521 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.957103  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1412  sugar transferase  39.29 
 
 
510 aa  258  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1663  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  39.4 
 
 
516 aa  256  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1310  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.48 
 
 
520 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3529  capsular polysaccharide biosynthesis protein PslA  42.86 
 
 
478 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988428  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3010  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.32 
 
 
478 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2083  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.24 
 
 
472 aa  247  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3301  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  41.53 
 
 
478 aa  246  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4532  sugar transferase  41.18 
 
 
505 aa  243  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0851  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.59 
 
 
547 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.985925  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0786  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  33.33 
 
 
506 aa  241  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.21233  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3176  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.83 
 
 
483 aa  239  9e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1925  sugar transferase  36.4 
 
 
506 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.962484 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3829  sugar transferase  41.07 
 
 
464 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0842  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.5 
 
 
471 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.390574  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2860  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  38.62 
 
 
468 aa  232  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1951  sugar transferase  38.17 
 
 
472 aa  226  9e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal  0.0120821 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1185  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  36.09 
 
 
464 aa  223  8e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01953  predicted UDP-glucose lipid carrier transferase  36.09 
 
 
464 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00395931  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2339  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  36.09 
 
 
464 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  36.09 
 
 
464 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01942  hypothetical protein  36.09 
 
 
464 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2981  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  35.99 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341548 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1070  sugar transferase  33.97 
 
 
469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1015  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  35.81 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.742651  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3560  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.18 
 
 
468 aa  221  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0584  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.53 
 
 
468 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1610  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.81 
 
 
464 aa  219  7e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000013392  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16230  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  42.76 
 
 
459 aa  219  7e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3172  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  43.73 
 
 
474 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.247578  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1065  polysaccharide biosythesis protein, putative  40.59 
 
 
464 aa  219  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02480  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  34.62 
 
 
484 aa  218  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0746534  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2028  sugar transferase  38.19 
 
 
461 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.619807  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1125  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.84 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2276  sugar transferase  41.48 
 
 
457 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.162354 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2661  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  34.64 
 
 
464 aa  213  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0848752  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0461  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  31.72 
 
 
466 aa  213  9e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323165  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  32.97 
 
 
464 aa  212  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.250613  normal  0.0594432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5198  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.94 
 
 
465 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3291  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.02 
 
 
454 aa  209  8e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1539  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.47 
 
 
506 aa  209  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3721  sugar transferase  38.77 
 
 
362 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.243024  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2713  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.83 
 
 
473 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.821002 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2485  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.34 
 
 
460 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399777  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0147  polysaccharide biosythesis protein, putative  39.87 
 
 
464 aa  207  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0918  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  36.34 
 
 
460 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2623  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.34 
 
 
460 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0458  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  36.47 
 
 
465 aa  207  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1675  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  37.3 
 
 
465 aa  207  4e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2572  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.21 
 
 
473 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001326  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsA sugar transferase  33.33 
 
 
466 aa  207  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183257  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4919  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40 
 
 
477 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  hitchhiker  0.00190784 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1801  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  35.46 
 
 
460 aa  206  8e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3142  sugar transferase, putative  35.83 
 
 
473 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0496  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.5 
 
 
467 aa  206  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2258  putative sugar transferase  35.28 
 
 
471 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5835  UDP-sugar lipid carrier transferase  36.51 
 
 
468 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2816  sugar transferase  39.47 
 
 
463 aa  203  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1382  sugar transferase  31.19 
 
 
466 aa  203  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.254818  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2715  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.99 
 
 
464 aa  203  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190611 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3704  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.37 
 
 
457 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546481  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4543  sugar transferase  40.37 
 
 
478 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3820  sugar transferase  40.37 
 
 
478 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4388  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.34 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1698  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.85 
 
 
460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0279884  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3866  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  39.93 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1693  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  38.87 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000262579  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0062  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  33.86 
 
 
457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01394  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumD  38.6 
 
 
484 aa  200  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4990  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.57 
 
 
491 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0818  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.57 
 
 
461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0543  hypothetical protein  39.47 
 
 
460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2903  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.21 
 
 
472 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4994  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.4 
 
 
470 aa  198  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13272  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2228  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  34.16 
 
 
464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0995309  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2319  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.07 
 
 
496 aa  198  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4056  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.9 
 
 
471 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3724  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  32.66 
 
 
458 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794366  normal  0.218244 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2443  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  33.88 
 
 
464 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346759 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2336  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  33.88 
 
 
464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0266242  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2285  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  33.88 
 
 
464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2329  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  33.88 
 
 
464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.0477885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>