More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2466 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1412  sugar transferase  88.24 
 
 
510 aa  923    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2659  sugar transferase  81.26 
 
 
509 aa  815    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.155014 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2682  sugar transferase  77.43 
 
 
514 aa  810    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115082  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2694  sugar transferase  79.84 
 
 
509 aa  808    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.335678  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2466  sugar transferase  100 
 
 
510 aa  1017    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.569757  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4607  putative sugar transferase family protein  81.02 
 
 
508 aa  822    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.512572  normal  0.0960232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3089  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  76.83 
 
 
518 aa  806    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.411544  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5211  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  58.64 
 
 
506 aa  560  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2955  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  56.8 
 
 
506 aa  535  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622356  normal  0.0348556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2191  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  54.14 
 
 
518 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.894429  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2712  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  57 
 
 
505 aa  534  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.104173 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1856  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  57.73 
 
 
536 aa  535  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.726353 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1807  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  57.3 
 
 
517 aa  530  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1154  sugar transferase  52.65 
 
 
510 aa  509  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0781  sugar transferase  49.12 
 
 
512 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0775  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  48.54 
 
 
512 aa  489  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2509  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  50.83 
 
 
516 aa  491  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0851  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  50.72 
 
 
547 aa  487  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.985925  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1222  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  50.92 
 
 
521 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.957103  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1310  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  50.51 
 
 
520 aa  465  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1663  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  50.41 
 
 
516 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4288  sugar transferase  46.73 
 
 
477 aa  355  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.222096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3301  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  44.21 
 
 
478 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3529  capsular polysaccharide biosynthesis protein PslA  44.68 
 
 
478 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988428  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3176  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.04 
 
 
483 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3010  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.55 
 
 
478 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1925  sugar transferase  36.95 
 
 
506 aa  280  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.962484 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2083  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.56 
 
 
472 aa  277  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2258  putative sugar transferase  38.42 
 
 
471 aa  263  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2371  sugar transferase  39.8 
 
 
488 aa  263  4.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.640414 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0822  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  37.62 
 
 
460 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0660  putative sugar transferase  37.62 
 
 
460 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0646  putative sugar transferase  37.62 
 
 
460 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1698  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.83 
 
 
460 aa  259  8e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0279884  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0496  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.41 
 
 
467 aa  258  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0046  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  37.38 
 
 
460 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2514  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.38 
 
 
460 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545923  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2193  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.38 
 
 
461 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2892  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.38 
 
 
460 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0535  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  37.35 
 
 
461 aa  256  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4056  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.16 
 
 
471 aa  256  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6023  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.99 
 
 
471 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  0.176572 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1070  sugar transferase  31.78 
 
 
469 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4919  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.62 
 
 
477 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  hitchhiker  0.00190784 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02480  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  33.69 
 
 
484 aa  252  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0746534  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1065  polysaccharide biosythesis protein, putative  39.09 
 
 
464 aa  251  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0461  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.21 
 
 
466 aa  249  6e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323165  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0543  hypothetical protein  37.18 
 
 
460 aa  249  7e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001326  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsA sugar transferase  36.52 
 
 
466 aa  247  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183257  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1539  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.99 
 
 
506 aa  247  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1610  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  33.33 
 
 
464 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000013392  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01953  predicted UDP-glucose lipid carrier transferase  33.33 
 
 
464 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00395931  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2339  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  33.33 
 
 
464 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01942  hypothetical protein  33.33 
 
 
464 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2572  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  34.57 
 
 
473 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  33.33 
 
 
464 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2485  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.97 
 
 
460 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399777  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2981  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  33.4 
 
 
464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341548 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1015  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  33.12 
 
 
464 aa  244  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.742651  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0918  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  36.97 
 
 
460 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2623  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.97 
 
 
460 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2661  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  34.68 
 
 
464 aa  244  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0848752  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1185  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  33.54 
 
 
464 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2276  sugar transferase  36.67 
 
 
457 aa  243  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.162354 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3691  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.79 
 
 
445 aa  243  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0458  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.69 
 
 
465 aa  243  7e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3142  sugar transferase, putative  34.57 
 
 
473 aa  243  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5835  UDP-sugar lipid carrier transferase  33.69 
 
 
468 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  32.71 
 
 
464 aa  242  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.250613  normal  0.0594432 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1955  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.85 
 
 
465 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233038  normal  0.963876 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2246  undecaprenyl- phosphate galactosephosphotransferase  36.15 
 
 
465 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.357334  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0786  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.57 
 
 
506 aa  240  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.21233  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2903  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35 
 
 
472 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2713  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.14 
 
 
473 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.821002 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1057  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  33.26 
 
 
465 aa  239  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0510  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  37.53 
 
 
475 aa  239  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0147  polysaccharide biosythesis protein, putative  38.37 
 
 
464 aa  238  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4532  sugar transferase  36.45 
 
 
505 aa  237  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3704  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.43 
 
 
457 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546481  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2163  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.5 
 
 
498 aa  236  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3866  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  34.94 
 
 
461 aa  236  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4543  sugar transferase  36.43 
 
 
478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01394  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumD  32.72 
 
 
484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3820  sugar transferase  36.43 
 
 
478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2028  sugar transferase  34.77 
 
 
461 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.619807  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0818  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.35 
 
 
461 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1125  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.04 
 
 
393 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3829  sugar transferase  38.27 
 
 
464 aa  233  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3724  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.05 
 
 
458 aa  233  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794366  normal  0.218244 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1480  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  32.98 
 
 
484 aa  232  1e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0810813  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1382  sugar transferase  35.04 
 
 
466 aa  232  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.254818  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1536  GumD protein  32.76 
 
 
484 aa  232  1e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0239  sugar transferase  36.82 
 
 
472 aa  231  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1675  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  34.32 
 
 
465 aa  230  4e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1729  putative sugar transferase  35.08 
 
 
459 aa  230  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00601292  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1681  sugar transferase  39.26 
 
 
525 aa  229  8e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.895795  normal  0.0521671 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6264  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.46 
 
 
471 aa  229  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3127  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  32.6 
 
 
501 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.526829  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3291  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.49 
 
 
454 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2459  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.18 
 
 
498 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721842  normal  0.253971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>