More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_17840 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
166 aa  319  9.999999999999999e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  41.06 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  35.33 
 
 
172 aa  107  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  37.76 
 
 
163 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  34.15 
 
 
164 aa  104  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  36.18 
 
 
178 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  32.68 
 
 
165 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  32.45 
 
 
167 aa  101  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  37.16 
 
 
181 aa  100  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  36.05 
 
 
173 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  36.05 
 
 
173 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  29.94 
 
 
176 aa  98.2  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  39.07 
 
 
156 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  38.82 
 
 
179 aa  95.1  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  39.07 
 
 
156 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  34.87 
 
 
168 aa  94.4  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  38.41 
 
 
156 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  38.41 
 
 
156 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3740  ATP synthase F0, B subunit  35.62 
 
 
194 aa  94  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  38.41 
 
 
156 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  37.75 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 
168 aa  92  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 
168 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  35.95 
 
 
189 aa  91.7  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 
168 aa  91.7  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  37.75 
 
 
156 aa  91.7  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 
168 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
165 aa  90.9  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  34.48 
 
 
173 aa  90.9  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  33.77 
 
 
175 aa  90.9  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 
168 aa  90.9  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 
168 aa  90.9  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 
168 aa  90.9  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 
168 aa  90.9  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 
168 aa  90.9  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  38.1 
 
 
168 aa  90.5  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  34.27 
 
 
171 aa  90.5  9e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 
168 aa  90.5  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  34 
 
 
164 aa  90.5  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  36.71 
 
 
156 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  32.5 
 
 
175 aa  88.6  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  36.71 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  36.08 
 
 
156 aa  88.6  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  35.04 
 
 
166 aa  88.2  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
174 aa  87  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  31.58 
 
 
164 aa  86.3  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  34.03 
 
 
165 aa  86.3  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3078  F0F1 ATP synthase subunit B  35.95 
 
 
156 aa  85.1  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0404416  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  30.52 
 
 
175 aa  84.7  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0133  ATP synthase F0, B subunit  34.23 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  34.04 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  33.77 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  29.7 
 
 
163 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  31.03 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0018  ATP synthase F0, B subunit  35.76 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000004073  hitchhiker  0.000421111 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  31.33 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0079  ATP synthase F0, B subunit  37.11 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  33.11 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  30.77 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  32.67 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  32.67 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  32.67 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  32.69 
 
 
200 aa  79  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  32 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  32.69 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  31.01 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  29.87 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  32.69 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_002936  DET0560  ATP synthase F0, B subunit  37.58 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0558474  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0534  ATP synthase F0, B subunit  36.91 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0141265  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  28.86 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  31.33 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  27.22 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  28.76 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  27.89 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  26.92 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  28.76 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  30.72 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_499  ATP synthase F0, B subunit  36.91 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000743335  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  27.44 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  30.67 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  29.22 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  28.67 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  31.65 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  30.57 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>