273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6017 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6017  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  100 
 
 
301 aa  622  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0955  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.32 
 
 
303 aa  182  7e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.3545  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  33.22 
 
 
308 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10098  oxidoreductase  34.27 
 
 
289 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.594688 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  32.16 
 
 
295 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  32.23 
 
 
302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  32.23 
 
 
302 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  30.8 
 
 
287 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  32.98 
 
 
291 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.45 
 
 
298 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  32.63 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  32.25 
 
 
298 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  30.74 
 
 
299 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  31.42 
 
 
308 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  31.42 
 
 
308 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  30.66 
 
 
308 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  30.74 
 
 
299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  33.33 
 
 
301 aa  135  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  30.04 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  30.04 
 
 
299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  30.74 
 
 
299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  30.43 
 
 
304 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  29.82 
 
 
308 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  29.82 
 
 
308 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  31.84 
 
 
273 aa  132  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  32.38 
 
 
305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  32.33 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  33.06 
 
 
300 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  29.62 
 
 
306 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  31.42 
 
 
315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0988  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.46 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.534798 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0908  TauD/TfdA family dioxygenase  29.08 
 
 
283 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0747691  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.71 
 
 
321 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0816  TauD/TfdA family dioxygenase  28.72 
 
 
283 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  29.08 
 
 
276 aa  109  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2171  TauD/TfdA family dioxygenase  28.37 
 
 
292 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0808968  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0297  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.28 
 
 
282 aa  106  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.849984  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  30.69 
 
 
318 aa  105  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  30.69 
 
 
309 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0690  TauD/TfdA family dioxygenase  28.47 
 
 
297 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0776  TauD/TfdA family dioxygenase  28.47 
 
 
297 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2415  TauD/TfdA family dioxygenase  28.47 
 
 
297 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1740  TauD/TfdA family dioxygenase  28.47 
 
 
297 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1800  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  25.77 
 
 
287 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971023  normal  0.0172073 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1139  TauD/TfdA family dioxygenase  28.47 
 
 
297 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1214  TauD/TfdA family dioxygenase  28.47 
 
 
297 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.631548  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  31.25 
 
 
315 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  30.53 
 
 
308 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9237  taurine dioxygenase  24.73 
 
 
279 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  32.02 
 
 
315 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  32.02 
 
 
315 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  30.74 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  29.92 
 
 
315 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  28.24 
 
 
315 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  28.24 
 
 
295 aa  96.3  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2770  taurine dioxygenase  30.71 
 
 
323 aa  95.9  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  30.2 
 
 
315 aa  95.9  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  27.11 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2123  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.57 
 
 
293 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  28.63 
 
 
304 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  28.51 
 
 
315 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  26.24 
 
 
277 aa  92.8  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  24.71 
 
 
314 aa  92.8  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  29.62 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  26 
 
 
270 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53191  predicted protein  27.44 
 
 
378 aa  91.7  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  26.25 
 
 
277 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  27.31 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  26.22 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  34.81 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  26.25 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  27 
 
 
296 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  28.57 
 
 
301 aa  90.1  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  26.74 
 
 
335 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  26.22 
 
 
283 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  26.74 
 
 
277 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  26.22 
 
 
283 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  26.22 
 
 
283 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  26.22 
 
 
283 aa  89.4  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  26.22 
 
 
283 aa  89.4  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  24.46 
 
 
283 aa  89  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  26.22 
 
 
283 aa  89.4  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  26.22 
 
 
283 aa  89.4  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  25.26 
 
 
285 aa  89  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39554  alpha-ketoglutarate catabolism dioxygenase  25.08 
 
 
386 aa  88.6  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.470371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  27.54 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  25.98 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  34.36 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4976  taurine dioxygenase  30 
 
 
305 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141478 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1161  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  27.56 
 
 
281 aa  88.2  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00427132  normal  0.195503 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04108  conserved hypothetical protein  29.84 
 
 
363 aa  86.7  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  27.4 
 
 
322 aa  86.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  26.36 
 
 
277 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1640  TauD/TfdA family dioxygenase  26.14 
 
 
327 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1559  TauD/TfdA family dioxygenase  26.14 
 
 
327 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0131  TauD/TfdA family dioxygenase  26.14 
 
 
327 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  26.9 
 
 
305 aa  85.9  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2152  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  34.36 
 
 
301 aa  85.5  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0829  taurine dioxygenase  26.62 
 
 
289 aa  85.5  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.464747 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  28.02 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>