48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4822 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4822  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  467  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.75667 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1558  hypothetical protein  40.97 
 
 
237 aa  204  7e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0437869  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0547  hypothetical protein  41.41 
 
 
231 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0522  hypothetical protein  40.97 
 
 
231 aa  198  6e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3792  hypothetical protein  40.97 
 
 
231 aa  198  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0552  hypothetical protein  40.97 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2453  hypothetical protein  37 
 
 
231 aa  195  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5161  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1991  hypothetical protein  42.92 
 
 
232 aa  176  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1897  hypothetical protein  38.43 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1174  hypothetical protein  40.43 
 
 
237 aa  160  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.58275  normal  0.922982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1107  hypothetical protein  37.5 
 
 
249 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2922  hypothetical protein  36.8 
 
 
247 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625248  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4521  hypothetical protein  40.17 
 
 
244 aa  155  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2269  hypothetical protein  37.83 
 
 
230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2549  hypothetical protein  36.36 
 
 
247 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0480  hypothetical protein  39.13 
 
 
230 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4153  hypothetical protein  40.17 
 
 
243 aa  151  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.386846  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4909  hypothetical protein  38.53 
 
 
246 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  0.108673 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0007  hypothetical protein  35.29 
 
 
248 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00581263  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4635  hypothetical protein  39.17 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5898  hypothetical protein  35.42 
 
 
239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  39 
 
 
544 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6868  hypothetical protein  35.17 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1551  hypothetical protein  28.98 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4494  hypothetical protein  28.51 
 
 
232 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1815  hypothetical protein  28.74 
 
 
245 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.668291  normal  0.837266 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04711  conserved hypothetical protein  30.65 
 
 
269 aa  92.8  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5398  hypothetical protein  46.46 
 
 
178 aa  79  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44673  predicted protein  25.3 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.173616  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3059  hypothetical protein  30.43 
 
 
415 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.788767  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9586  predicted protein  38.57 
 
 
70 aa  61.6  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44556  predicted protein  28.47 
 
 
484 aa  60.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4530  hypothetical protein  31.08 
 
 
397 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.355101 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_3566  predicted protein  27.46 
 
 
342 aa  53.1  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0529465  normal  0.0506785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0221  hypothetical protein  25.31 
 
 
400 aa  52  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00105596  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44864  predicted protein  26.06 
 
 
492 aa  52.4  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2362  hypothetical protein  27.27 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2384  hypothetical protein  27.95 
 
 
400 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72172  predicted protein  23.02 
 
 
275 aa  45.8  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.143035 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30636  predicted protein  24.39 
 
 
483 aa  45.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0819532  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0024  hypothetical protein  26.38 
 
 
396 aa  45.8  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.750506 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37092  predicted protein  25.33 
 
 
389 aa  45.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.307269  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4748  hypothetical protein  25.66 
 
 
393 aa  45.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4908  hypothetical protein  28.57 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18359  predicted protein  22.56 
 
 
439 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.523729  normal  0.0221416 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4531  hypothetical protein  30.53 
 
 
271 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.889024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0074  hypothetical protein  26.9 
 
 
402 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0072  hypothetical protein  26.9 
 
 
402 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>