More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0332 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  100 
 
 		 386 aa  763    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  60.94 
 
 		 362 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1501  folate-binding protein YgfZ  58.76 
 
 		 384 aa  446  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119461  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  59.42 
 
 		 375 aa  441  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  27.49 
 
 		 367 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.46 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  29.19 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  27.96 
 
 		 356 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  27.96 
 
 		 356 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  27.67 
 
 		 375 aa  106  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.11 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  27.85 
 
 		 371 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.06 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  29.26 
 
 		 366 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  29.47 
 
 		 370 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.18 
 
 		 363 aa  97.1  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.18 
 
 		 363 aa  97.1  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  31.29 
 
 		 322 aa  96.7  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  29.43 
 
 		 364 aa  96.3  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.66 
 
 		 337 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.39 
 
 		 403 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.26 
 
 		 366 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.22 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  31.25 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.92 
 
 		 349 aa  94.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.66 
 
 		 366 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.32 
 
 		 364 aa  93.2  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.27 
 
 		 409 aa  93.6  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.66 
 
 		 366 aa  92.8  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.66 
 
 		 366 aa  92.8  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2474  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.15 
 
 		 347 aa  92.8  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.66 
 
 		 366 aa  92.8  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.66 
 
 		 366 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.73 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.01 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  28.15 
 
 		 371 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1627  glycine cleavage system T protein  24.85 
 
 		 357 aa  90.9  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.26 
 
 		 366 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03590  folate-binding protein YgfZ  29.04 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.663588 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.26 
 
 		 366 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  27.15 
 
 		 325 aa  90.5  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.26 
 
 		 366 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.22 
 
 		 352 aa  90.1  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  30.66 
 
 		 369 aa  89.7  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4387  glycine cleavage system T protein  29.43 
 
 		 369 aa  89.4  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.26 
 
 		 366 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01654  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.91 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  29.25 
 
 		 339 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  28.42 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4046  glycine cleavage system T protein  29.19 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00578846  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  30.42 
 
 		 440 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  30.42 
 
 		 442 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.98 
 
 		 369 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.98 
 
 		 364 aa  88.6  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.84 
 
 		 368 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.27 
 
 		 369 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.27 
 
 		 369 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  25.96 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.63 
 
 		 430 aa  87.4  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.64 
 
 		 441 aa  87  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25 
 
 		 363 aa  87  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  27.34 
 
 		 363 aa  87  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3357  glycine cleavage system T protein  29.26 
 
 		 372 aa  87  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380294  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  28.57 
 
 		 369 aa  86.7  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.62 
 
 		 369 aa  86.7  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.66 
 
 		 366 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3316  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.01 
 
 		 387 aa  86.3  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0709071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  28.79 
 
 		 361 aa  86.3  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1881  folate-binding protein YgfZ  27.8 
 
 		 348 aa  86.3  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  24.71 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3617  glycine cleavage system T protein  26.04 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  29.51 
 
 		 354 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  27.22 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.46 
 
 		 359 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  25.4 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.19 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.12 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.42 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.12 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 		 801 aa  84  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  27.3 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.98 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.48 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  23.8 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0882  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.19 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  27.81 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  28.65 
 
 		 389 aa  82.8  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.87 
 
 		 362 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.22 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  28.92 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  30.06 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  29.52 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.07 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  26.72 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  24.69 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  27.3 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.13 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  27.44 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.26 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>