More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1862 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  100 
 
 
432 aa  837    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  39.18 
 
 
438 aa  264  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  41.81 
 
 
463 aa  263  6e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  39.51 
 
 
434 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  31.16 
 
 
1833 aa  232  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  34.8 
 
 
445 aa  227  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  38 
 
 
432 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  38 
 
 
432 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  36.25 
 
 
1816 aa  220  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  35.82 
 
 
449 aa  203  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  28.74 
 
 
448 aa  200  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  35.1 
 
 
449 aa  199  9e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 
438 aa  189  9e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  28.3 
 
 
439 aa  182  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  32.74 
 
 
495 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  29.68 
 
 
414 aa  175  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 
499 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  27.25 
 
 
441 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.87 
 
 
1839 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  32.12 
 
 
2720 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  30.7 
 
 
454 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 
433 aa  159  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 
448 aa  153  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.54 
 
 
1876 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  32.9 
 
 
1776 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  32.49 
 
 
1769 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.28 
 
 
1829 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 
434 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 
434 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.41 
 
 
1864 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1647  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  31.59 
 
 
927 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0697  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  31.59 
 
 
927 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0616  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  31.59 
 
 
927 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1732  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  31.59 
 
 
927 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1937  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  31.59 
 
 
927 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2296  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  31.59 
 
 
927 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200957  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2215  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  31.59 
 
 
927 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.360269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.55 
 
 
1806 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 
437 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  30.52 
 
 
425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  28.93 
 
 
425 aa  113  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  26.06 
 
 
414 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  24.23 
 
 
422 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05460  macrolide-efflux transmembrane protein  30.35 
 
 
450 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.810092  normal  0.114702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  27.62 
 
 
411 aa  103  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  28.13 
 
 
394 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  26.15 
 
 
417 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  25.95 
 
 
417 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  26.39 
 
 
415 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  25 
 
 
417 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  26.18 
 
 
415 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  27.58 
 
 
430 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  23.36 
 
 
422 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  22.89 
 
 
422 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1575  major facilitator transporter  28.27 
 
 
472 aa  98.2  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  25.8 
 
 
415 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  24.8 
 
 
422 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  23.31 
 
 
422 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  28.29 
 
 
425 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  25.86 
 
 
414 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 
415 aa  94.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  23.04 
 
 
422 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  25.57 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  23.04 
 
 
422 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  25.57 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  23.04 
 
 
422 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  22.76 
 
 
422 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 
453 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  23.66 
 
 
422 aa  92  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  25.13 
 
 
414 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
439 aa  90.9  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  22.76 
 
 
422 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
444 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 
405 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  24.73 
 
 
412 aa  87.8  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 
432 aa  87  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 
412 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  24.66 
 
 
412 aa  86.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 
426 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1086  major facilitator superfamily protein  35.07 
 
 
134 aa  83.6  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  27.87 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  27.79 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  27.79 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  28.07 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  25.41 
 
 
408 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  25.81 
 
 
408 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  27.79 
 
 
420 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  27.79 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  26.54 
 
 
397 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  25 
 
 
397 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  28.15 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0869  hypothetical protein  24.82 
 
 
427 aa  81.3  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0392797  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 
440 aa  80.5  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  25.92 
 
 
408 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  27.78 
 
 
420 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 
420 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  22.11 
 
 
405 aa  79.7  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1968  major facilitator transporter  29.19 
 
 
461 aa  79  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 
429 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>