122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1017 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1017  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 
142 aa  266  1e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000143879  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1623  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.43 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.093851  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  26.72 
 
 
169 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  26.72 
 
 
169 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  26.72 
 
 
169 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  30.37 
 
 
168 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  30.37 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  30.37 
 
 
168 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  30.37 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  30.37 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  30.37 
 
 
168 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  30.37 
 
 
168 aa  57.8  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  30.37 
 
 
168 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  30.37 
 
 
168 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2217  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.07 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.268099  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  30.37 
 
 
168 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  30.37 
 
 
168 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  31.93 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  31.93 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  31.91 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  31.65 
 
 
161 aa  54.7  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  32.61 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  29.41 
 
 
156 aa  53.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  29.23 
 
 
178 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  32.85 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  31.31 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  26.83 
 
 
175 aa  51.6  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2826  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.77 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  30.77 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  31.39 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  32.61 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  31.39 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  29.87 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  29.46 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  29.87 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  24.43 
 
 
171 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  30.66 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  30.66 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3648  F0F1 ATP synthase subunit B  32.47 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000138088  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  29.68 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  33.04 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  26.28 
 
 
175 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  27.27 
 
 
164 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  29.58 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  30.47 
 
 
156 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  30.47 
 
 
156 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  30.47 
 
 
156 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  30.43 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  29.03 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  31.25 
 
 
179 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  30.47 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  31.72 
 
 
165 aa  47  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  32.39 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  29.03 
 
 
156 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  29.69 
 
 
156 aa  45.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  28.7 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  25.38 
 
 
264 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3734  ATP synthase F0, B subunit  31.16 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.23986  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  23.61 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  29.03 
 
 
175 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  31.39 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  27.21 
 
 
175 aa  45.1  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3078  F0F1 ATP synthase subunit B  33.75 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0404416  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0510  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.03 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  25.18 
 
 
171 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0803  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.43 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  29.57 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  29.57 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  29.57 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  29.57 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  29.57 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3063  F0F1 ATP synthase subunit B  31.3 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  29.27 
 
 
167 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  29.57 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  29.57 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  29.57 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  29.57 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  29.57 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  29.57 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  29.57 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  29.57 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  29.57 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  29.57 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  29.57 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  29.25 
 
 
175 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  29.57 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  33.01 
 
 
156 aa  43.5  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  28.7 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  31.2 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  27.93 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1917  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.409248  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  26.5 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4466  ATP synthase F0, B subunit  29.03 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000198914  hitchhiker  0.0000000113501 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00426  F0F1 ATP synthase subunit B  30.61 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  28.7 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  33.05 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0133  ATP synthase F0, B subunit  32.2 
 
 
245 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  33.05 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>