More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0448 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 148 aa  293  4e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  56.25 
 
 		 149 aa  167  7e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  45.64 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 209 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  40 
 
 		 201 aa  124  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  43.06 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 151 aa  123  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  38.89 
 
 		 167 aa  122  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  43.66 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  38.89 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  39.31 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 190 aa  120  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 193 aa  120  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 149 aa  120  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 190 aa  120  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 190 aa  120  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 148 aa  120  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 189 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 194 aa  119  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 204 aa  118  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 189 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  38.19 
 
 		 194 aa  117  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 189 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 189 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 189 aa  117  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  38.89 
 
 		 167 aa  117  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  44.83 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  43.15 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 151 aa  115  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  38.19 
 
 		 160 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 148 aa  114  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 190 aa  114  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0083  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 202 aa  113  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  43.66 
 
 		 191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 		 168 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0738  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 191 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823068  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2593  50S ribosomal protein L9  43.28 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0267673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1620  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 211 aa  110  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0645747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 148 aa  110  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1414  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 199 aa  110  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  40.56 
 
 		 174 aa  110  7.000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3185  ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 146 aa  110  9e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 189 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  37.76 
 
 		 170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  35.86 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4634  50S ribosomal protein L9  43.28 
 
 		 189 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269406  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  38.19 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 179 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  40.94 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  40.82 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1918  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 196 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 189 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  35.95 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1210  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 		 209 aa  107  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0873917  normal  0.750153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2007  ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  38.3 
 
 		 151 aa  107  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 178 aa  107  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 189 aa  107  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  38.89 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  35.17 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1516  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 191 aa  107  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 147 aa  105  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_482  ribosomal protein L9  37.59 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1361  ribosomal protein L9  40 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  39.46 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>