174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4431 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  100 
 
 		 113 aa  230  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  53.1 
 
 		 116 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  51.33 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  36.79 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  39.66 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  37.84 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  34.58 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  36.63 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  38.71 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  40.23 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  37.63 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  40.57 
 
 		 240 aa  64.7  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  33.05 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  36.59 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  31.82 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  36.36 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3155  ribonuclease P protein component  42.11 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0217012  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03587  ribonuclease P  35.71 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.201936  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4221  ribonuclease P  35.71 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4071  ribonuclease P  35.71 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00679811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  32.71 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  35.71 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  41.25 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5134  ribonuclease P  35.71 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130238  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03531  hypothetical protein  35.71 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.118507  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  33.02 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3917  ribonuclease P  35.71 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4214  ribonuclease P  35.71 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  30.97 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  31.43 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  36.61 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  35.05 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  35.71 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0167  ribonuclease P  34.29 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00183081  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0030  ribonuclease P  34.82 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00687472  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3317  ribonuclease P  32.17 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4175  ribonuclease P  34.82 
 
 		 119 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.936833  normal  0.955569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4053  ribonuclease P  34.82 
 
 		 119 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000316737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4232  ribonuclease P  34.82 
 
 		 119 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000722418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4068  ribonuclease P  34.82 
 
 		 119 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000599062  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2390  ribonuclease P protein component  25.66 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102633  hitchhiker  0.0000000753131 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4125  ribonuclease P  34.82 
 
 		 119 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00333224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  38.55 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  34.82 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  34.62 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4486  ribonuclease P protein component  28.7 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000175876  hitchhiker  0.00000000129187 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  30.84 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3615  ribonuclease P protein component  38.16 
 
 		 385 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  27.52 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  31.53 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2602  ribonuclease P protein component  30.63 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.201057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  28.16 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  31.43 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  32.53 
 
 		 118 aa  50.8  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6522  ribonuclease P protein  36.9 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2760  ribonuclease P  33.77 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000461705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  39.39 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  39.39 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  32.08 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  29.29 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5052  ribonuclease P protein component  29.51 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  28.57 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  37.97 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  26.67 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  26.67 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  28.57 
 
 		 115 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  32.73 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  31.43 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  28.57 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  28.57 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  28.57 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  28.57 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  31.52 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  32.73 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3563  hypothetical protein  50 
 
 		 51 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  30.36 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  28.57 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3156  ribonuclease P protein component  36.9 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3217  ribonuclease P protein component  36.9 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  28.57 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  32.73 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  28.57 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  27 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0302  ribonuclease P protein component  36.9 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  35 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  29.52 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0105  ribonuclease P protein component  36.9 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3100  ribonuclease P protein component  38.16 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456921 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  29.46 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4262  ribonuclease P protein component  33.66 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117782  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3399  ribonuclease P protein component  36.9 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2551  ribonuclease P protein component  35.71 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3165  ribonuclease P protein component  35.71 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46639  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2239  ribonuclease P protein component  36.9 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0091  ribonuclease P protein component  36.9 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3552  ribonuclease P protein component  36.9 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4508  ribonuclease P protein component  36.92 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>