153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4086 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  100 
 
 
363 aa  743    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  59.44 
 
 
357 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  58.59 
 
 
357 aa  435  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3100  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  59.44 
 
 
357 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0254  N-acetylneuraminic acid synthase  58.59 
 
 
357 aa  434  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0169  N-acetylneuraminic acid synthase  58.59 
 
 
357 aa  434  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.922982  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  58.87 
 
 
359 aa  433  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  56.94 
 
 
359 aa  388  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  52.82 
 
 
333 aa  377  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  51.69 
 
 
334 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  50.99 
 
 
334 aa  367  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  50.28 
 
 
330 aa  364  1e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  50.84 
 
 
334 aa  360  2e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  50.98 
 
 
335 aa  358  7e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  50.7 
 
 
331 aa  352  4e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  49.58 
 
 
337 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  50.14 
 
 
333 aa  347  2e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0367  N-acetylneuraminate synthase  53.48 
 
 
360 aa  345  1e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  53.24 
 
 
333 aa  340  2.9999999999999998e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  52.99 
 
 
337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  47.18 
 
 
349 aa  331  1e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  48.59 
 
 
341 aa  330  2e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.66 
 
 
338 aa  328  8e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2396  NeuB, antifreeze-like protein  53.8 
 
 
371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  49.44 
 
 
347 aa  322  6e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  46.74 
 
 
334 aa  321  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  45.28 
 
 
346 aa  299  5e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  45.79 
 
 
334 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  45.79 
 
 
334 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  45.64 
 
 
348 aa  293  3e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  44.25 
 
 
340 aa  292  5e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  45.53 
 
 
333 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  46.2 
 
 
332 aa  290  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  43.38 
 
 
340 aa  286  5e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  42.22 
 
 
346 aa  286  5e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  43.73 
 
 
358 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14081  sialic acid synthase  42.86 
 
 
341 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.67 
 
 
350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.46 
 
 
350 aa  271  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01101  sialic acid synthase  41.57 
 
 
335 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  45.59 
 
 
354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  42.41 
 
 
349 aa  257  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  41.67 
 
 
342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  43.8 
 
 
350 aa  243  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4853  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.17 
 
 
352 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.63 
 
 
749 aa  236  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  39.83 
 
 
350 aa  231  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.43 
 
 
354 aa  226  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  37.15 
 
 
350 aa  219  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  37.46 
 
 
337 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  37.32 
 
 
332 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  36.54 
 
 
748 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  38.38 
 
 
338 aa  210  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.22 
 
 
350 aa  208  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.75 
 
 
338 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.41 
 
 
394 aa  206  7e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  34.75 
 
 
350 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.25 
 
 
351 aa  203  5e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  33.71 
 
 
338 aa  202  6e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  35.86 
 
 
349 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  34.29 
 
 
348 aa  199  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3448  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.81 
 
 
749 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2668  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.81 
 
 
749 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2221  N-acetylneuraminate synthase  39.13 
 
 
761 aa  193  4e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  36.57 
 
 
364 aa  193  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.28 
 
 
345 aa  192  5e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  37.12 
 
 
348 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.99 
 
 
358 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  33.61 
 
 
345 aa  189  5.999999999999999e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3681  N-acetylneuraminate synthase  34.63 
 
 
344 aa  189  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  36.44 
 
 
351 aa  186  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1894  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.79 
 
 
354 aa  185  9e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0010  n-acetylneuraminate synthase  36.33 
 
 
303 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124512  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  36.21 
 
 
350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1912  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.7 
 
 
365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000713145 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  35 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1204  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.18 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.44 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  33.14 
 
 
359 aa  183  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.03 
 
 
344 aa  183  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2407  N-acetylneuraminate synthase  35.99 
 
 
500 aa  182  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378262  normal  0.284066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  36.11 
 
 
672 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1664  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.95 
 
 
344 aa  181  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  33.6 
 
 
351 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  32.46 
 
 
349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.21 
 
 
350 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  30.11 
 
 
349 aa  177  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0910  N-acetylneuraminate synthase  36.3 
 
 
289 aa  177  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.497689  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  33.9 
 
 
349 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  35.71 
 
 
350 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  33.98 
 
 
343 aa  176  7e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2635  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.7 
 
 
352 aa  176  7e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0210  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.78 
 
 
349 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.803069  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1974  N-acetylneuraminate synthase  39.32 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1890  N-acetylneuraminate synthase  32.49 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000120962  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0797  N-acetylneuraminate synthase  33.97 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4303  N-acetylneuraminate synthase  35.23 
 
 
361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  33.99 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4334  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.69 
 
 
356 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.52 
 
 
762 aa  170  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.147767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>