146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2564 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2564  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 
167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000228315  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2645  phosphohistidine phosphatase, SixA  67.68 
 
 
167 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0878  phosphohistidine phosphatase, SixA  44.03 
 
 
182 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2562  phosphohistidine phosphatase SixA  43.42 
 
 
161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1996  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  43.11 
 
 
173 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03624e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2231  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  46.04 
 
 
173 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.571995  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2131  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.01 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.71 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0590  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.74 
 
 
170 aa  79  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0423  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.96 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.762465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4293  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.14 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0542365  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4278  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.48 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.54 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.74 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0305  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.22 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1872  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.78 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.322395  normal  0.942928 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.19 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0135  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482904  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4088  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
165 aa  61.6  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17830  phosphoglycerate mutase family protein  30.43 
 
 
160 aa  61.6  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1034  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.86 
 
 
176 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.691963 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2712  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.48 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.409858  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2414  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.62 
 
 
162 aa  59.3  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30 
 
 
167 aa  58.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.681319 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1196  phosphohistidine phosphatase SixA  32.61 
 
 
157 aa  58.2  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1376  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
165 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1407  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
165 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1547  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.03 
 
 
177 aa  57.8  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.023949  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26931  phosphohistidine phosphatase SixA  32.8 
 
 
175 aa  57.8  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1082  phosphohistidine phosphatase SixA  29.13 
 
 
170 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.396252  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0942  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.41 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.574003  normal  0.218126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3490  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.2 
 
 
168 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2758  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.34 
 
 
164 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.3 
 
 
174 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  29.41 
 
 
160 aa  55.5  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.58 
 
 
161 aa  55.1  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0613  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.04 
 
 
162 aa  54.7  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.639252  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2932  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.92 
 
 
170 aa  54.7  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2108  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.29 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0168  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.99 
 
 
168 aa  54.7  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25.79 
 
 
161 aa  54.3  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0881  phosphohistidine phosphatase SixA  28.33 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2799  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.82 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545604  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1020  phosphohistidine phosphatase SixA  28.46 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0327299  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  30.77 
 
 
151 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2024  phosphohistidine phosphatase SixA  31.62 
 
 
151 aa  52  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469683  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.6 
 
 
152 aa  51.2  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0582  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
146 aa  50.8  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.016347  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1418  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.57 
 
 
171 aa  50.8  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2314  phosphohistidine phosphatase SixA  33.33 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.889503  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1955  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.187267  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0787  phosphohistidine phosphatase SixA  27.69 
 
 
170 aa  50.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.107498  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1261  phosphoglycerate mutase family protein  30.33 
 
 
165 aa  50.4  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.542103  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3096  phosphoglycerate mutase domain-containing protein  25.66 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.897971  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0198  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.08 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1244  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.43 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1581  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.3 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.511675 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2173  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25.77 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1502  phosphohistidine phosphatase SixA  28.57 
 
 
152 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1532  phosphohistidine phosphatase SixA  28.57 
 
 
152 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2814  phosphohistidine phosphatase  27.87 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1450  phosphohistidine phosphatase  27.87 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.51 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1703  phosphohistidine phosphatase SixA  27.92 
 
 
218 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.412618  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1288  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.93 
 
 
165 aa  48.1  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  25.16 
 
 
161 aa  47.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1295  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.83 
 
 
154 aa  47.4  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3007  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.94 
 
 
153 aa  47.4  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1276  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.8 
 
 
152 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2342  phosphohistidine phosphatase  28.37 
 
 
175 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  25.16 
 
 
161 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  25.16 
 
 
161 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  31.82 
 
 
154 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1088  phosphoglycerate mutase family protein  25.62 
 
 
164 aa  47.4  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  25.16 
 
 
161 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  25.16 
 
 
161 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0829  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.14 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.78 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1310  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.14 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593656  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0561  phosphohistidine phosphatase SixA  27.92 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820244  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7090  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.23 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0609334  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02694  Phosphohistidine phosphatase SixA (RX6)  28 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0471403  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1292  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.14 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.9 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0796  phosphohistidine phosphatase SixA  27.92 
 
 
152 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1309  phosphohistidine phosphatase SixA  27.92 
 
 
152 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0591  phosphohistidine phosphatase SixA  27.92 
 
 
152 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  24.84 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1402  phosphohistidine phosphatase  30.16 
 
 
163 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.78 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1215  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.63 
 
 
150 aa  45.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2096  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.48 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0001187  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0380  phosphohistidine phosphatase  30.16 
 
 
163 aa  45.4  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0142  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.47 
 
 
155 aa  45.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.124831  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0099  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.83 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.239035  normal  0.0377722 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.5 
 
 
152 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3078  Phosphoglycerate mutase  27.56 
 
 
167 aa  45.1  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800804 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1270  Phosphoglycerate mutase  29.2 
 
 
166 aa  45.1  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2162  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.08 
 
 
170 aa  44.7  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  32.82 
 
 
157 aa  44.7  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>