More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4457 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4457  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 
212 aa  397  1e-110  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1176  peptidase M22, glycoprotease  53.4 
 
 
211 aa  161  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0451061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1487  peptidase M22, glycoprotease  52.17 
 
 
210 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1166  peptidase M22, glycoprotease  52.91 
 
 
211 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.533647 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1149  peptidase M22, glycoprotease  52.91 
 
 
211 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.745666  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6548  peptidase M22 glycoprotease  48.93 
 
 
232 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04630  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  47.27 
 
 
207 aa  154  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47382  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4931  peptidase M22, glycoprotease  50.24 
 
 
210 aa  152  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1714  peptidase M22 glycoprotease  47.69 
 
 
243 aa  151  6e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0883  peptidase M22 glycoprotease  49.51 
 
 
191 aa  147  1e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0111529  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1202  peptidase M22 glycoprotease  46.37 
 
 
248 aa  145  4e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1146  peptidase M22 glycoprotease  45.76 
 
 
227 aa  140  2e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1000  peptidase M22 glycoprotease  45.29 
 
 
218 aa  138  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13455  hypothetical protein  52.15 
 
 
215 aa  137  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00396413  hitchhiker  0.000602893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3663  peptidase M22, glycoprotease  44.2 
 
 
212 aa  134  1e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0614  peptidase M22 glycoprotease  43.09 
 
 
240 aa  130  1e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725915  normal  0.446641 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2604  hypothetical protein  43.64 
 
 
231 aa  128  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4243  peptidase M22 glycoprotease  44 
 
 
225 aa  128  8e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0145677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3853  peptidase M22, glycoprotease  43.3 
 
 
225 aa  127  2e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0358  peptidase M22, glycoprotease  41.3 
 
 
216 aa  125  4e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0837171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0562  peptidase M22 glycoprotease  45.02 
 
 
218 aa  125  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.849533  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0627  peptidase M22, glycoprotease  39.92 
 
 
254 aa  119  2e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0629  peptidase M22 glycoprotease  40 
 
 
229 aa  117  1e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147334  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4043  peptidase M22 glycoprotease  40.95 
 
 
225 aa  116  2e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4263  peptidase M22 glycoprotease  44.3 
 
 
230 aa  115  4e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6007  peptidase M22 glycoprotease  37.41 
 
 
287 aa  110  2e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.463097  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3071  peptidase M22 glycoprotease  44.62 
 
 
222 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.255887  normal  0.552992 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07480  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  39.82 
 
 
225 aa  104  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.308206  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  40.16 
 
 
241 aa  103  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29230  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  40 
 
 
224 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2598  peptidase M22 glycoprotease  47 
 
 
229 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0896201  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2604  peptidase M22 glycoprotease  37.9 
 
 
223 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23525e-06 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2894  peptidase M22, glycoprotease  38.77 
 
 
223 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0731  peptidase M22 glycoprotease  41.48 
 
 
225 aa  91.7  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0874562  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0035  peptidase M22 glycoprotease  34.19 
 
 
220 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  42.11 
 
 
229 aa  84  1e-15  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0037  peptidase M22 glycoprotease  37.27 
 
 
218 aa  84  2e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  1.50711e-06 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2015  peptidase M22, glycoprotease  44.2 
 
 
238 aa  82  6e-15  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.186434  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1344  peptidase M22 glycoprotease  41.88 
 
 
177 aa  81.6  7e-15  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309831  normal  0.0951172 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0915  peptidase M22, glycoprotease  29.1 
 
 
225 aa  80.1  2e-14  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  40.31 
 
 
223 aa  79.7  3e-14  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23140  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  35.05 
 
 
244 aa  78.2  9e-14  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4569  peptidase M22, glycoprotease  40.33 
 
 
260 aa  77.4  1e-13  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  32.38 
 
 
233 aa  77.4  1e-13  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  35.87 
 
 
232 aa  77  2e-13  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1673  peptidase M22, glycoprotease  33.08 
 
 
223 aa  77  2e-13  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0023  peptidase M22 glycoprotease  32.14 
 
 
220 aa  77  2e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  34.72 
 
 
234 aa  76.3  3e-13  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2294  peptidase M22 glycoprotease  45.11 
 
 
175 aa  76.6  3e-13  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  30.84 
 
 
229 aa  76.6  3e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1775  peptidase M22, glycoprotease  31.9 
 
 
236 aa  76.3  4e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0438332  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  40.77 
 
 
231 aa  76.3  4e-13  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2898  peptidase M22 glycoprotease  45.86 
 
 
244 aa  75.9  4e-13  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400355  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  34.91 
 
 
232 aa  75.5  5e-13  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3738  peptidase M22 glycoprotease  37.12 
 
 
241 aa  75.9  5e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  34.44 
 
 
233 aa  75.5  6e-13  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  37.84 
 
 
233 aa  75.5  6e-13  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1052  peptidase M22 glycoprotease  35.34 
 
 
259 aa  74.7  9e-13  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.310661  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  37.4 
 
 
238 aa  74.7  1e-12  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0917  peptidase M22, glycoprotease  37.98 
 
 
228 aa  74.3  1e-12  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  37.04 
 
 
223 aa  74.7  1e-12  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  34.03 
 
 
231 aa  73.6  2e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  35.56 
 
 
223 aa  73.6  2e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  26.84 
 
 
236 aa  73.6  2e-12  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16700  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  40.36 
 
 
223 aa  73.9  2e-12  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.568455  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  34.03 
 
 
231 aa  73.6  2e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  34.03 
 
 
231 aa  73.6  2e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  38.51 
 
 
233 aa  73.9  2e-12  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1981  peptidase M22, glycoprotease  36.94 
 
 
229 aa  73.2  3e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.637689 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6394  peptidase M22 glycoprotease  31.65 
 
 
235 aa  72.8  3e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0429104  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  34.03 
 
 
231 aa  72.8  4e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  34.03 
 
 
231 aa  72.8  4e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  32.13 
 
 
231 aa  72.4  5e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0810  peptidase M22, glycoprotease  36.28 
 
 
223 aa  72  6e-12  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3199  peptidase M22 glycoprotease  34.51 
 
 
226 aa  70.9  1e-11  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150243  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  38.81 
 
 
233 aa  70.9  1e-11  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1786  peptidase M22, glycoprotease  35.62 
 
 
250 aa  71.2  1e-11  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0677325  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1241  glycoprotease family protein  26.72 
 
 
235 aa  71.2  1e-11  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2001  glycoprotease family protein  48.96 
 
 
252 aa  71.2  1e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.274689  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0800  peptidase M22 glycoprotease  28.82 
 
 
236 aa  71.2  1e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2150  protease, putative  28.75 
 
 
261 aa  70.9  1e-11  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  35.11 
 
 
233 aa  70.5  2e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  35.15 
 
 
233 aa  70.9  2e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2063  putative protease  28.75 
 
 
261 aa  70.5  2e-11  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.273267  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0432  hypothetical protein  32.9 
 
 
229 aa  70.1  2e-11  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0331052  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0161  peptidase M22 glycoprotease  23.45 
 
 
226 aa  70.1  2e-11  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.35469e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2146  peptidase M22 glycoprotease  39.85 
 
 
222 aa  70.5  2e-11  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.472287  hitchhiker  0.00199457 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2516  hypothetical protein  39.85 
 
 
222 aa  70.5  2e-11  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  35.88 
 
 
228 aa  70.9  2e-11  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3916  peptidase M22, glycoprotease  34.38 
 
 
225 aa  70.1  2e-11  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3523  peptidase M22 glycoprotease  34.2 
 
 
226 aa  69.7  3e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.0963127 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0347  peptidase M22 glycoprotease  32.85 
 
 
241 aa  69.7  3e-11  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  31.96 
 
 
231 aa  69.7  3e-11  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  37.4 
 
 
247 aa  69.7  3e-11  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  35.9 
 
 
239 aa  69.7  3e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1857  peptidase M22 glycoprotease  30.87 
 
 
227 aa  69.7  3e-11  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00567012  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  31.96 
 
 
231 aa  69.7  3e-11  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  31.96 
 
 
231 aa  69.7  3e-11  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1240  peptidase M22 glycoprotease  33.04 
 
 
246 aa  69.3  4e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  32.96 
 
 
235 aa  68.9  5e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>