42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2375 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2375  surface antigen  100 
 
 		 291 aa  559  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  78.81 
 
 		 288 aa  202  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  42.31 
 
 		 1048 aa  94  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  51.81 
 
 		 227 aa  92.4  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  42.35 
 
 		 434 aa  89.4  7e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  45.68 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  27.14 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  38.14 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  46.81 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  47.83 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  33.33 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  33.33 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  43.01 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  39.29 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  44.44 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  38.46 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5947  hypothetical protein  40.54 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5545  hypothetical protein  40.54 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.092464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  46.25 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  30.07 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  41.94 
 
 		 682 aa  66.2  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  38.27 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  39.02 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  35.85 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0540  hypothetical protein  32.33 
 
 		 366 aa  52.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5762  hypothetical protein  44.3 
 
 		 322 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  36.11 
 
 		 216 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  37.63 
 
 		 251 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  37.63 
 
 		 251 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  35.58 
 
 		 370 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  37.63 
 
 		 251 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3390  hypothetical protein  26.52 
 
 		 356 aa  46.6  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  30.95 
 
 		 333 aa  46.2  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  23.94 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0414  hypothetical protein  35.23 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0423  hypothetical protein  35.23 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0402  hypothetical protein  35.23 
 
 		 199 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0472134  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0370  hypothetical protein  30.12 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4018  hypothetical protein  31.33 
 
 		 331 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1133  hypothetical protein  31.76 
 
 		 358 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  27.71 
 
 		 347 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11745  hypothetical protein  34.62 
 
 		 256 aa  43.1  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.409869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>