More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1858 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1858  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 		 320 aa  621  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  61.8 
 
 		 322 aa  376  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2364  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.22 
 
 		 321 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180992  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4894  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  63.04 
 
 		 323 aa  362  3e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1864  alcohol dehydrogenase  55.86 
 
 		 324 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1382  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.42 
 
 		 324 aa  325  7e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4503  alcohol dehydrogenase  54.63 
 
 		 324 aa  317  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13162  NADPH quinone oxidoreductase fadB4  54.94 
 
 		 323 aa  315  6e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1523  alcohol dehydrogenase  58.02 
 
 		 333 aa  298  6e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0659671  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1554  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.02 
 
 		 333 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1577  alcohol dehydrogenase  58.02 
 
 		 333 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0130  alcohol dehydrogenase  55.76 
 
 		 320 aa  287  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4574  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.58 
 
 		 331 aa  279  4e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.750038  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.65 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0082  alcohol dehydrogenase  50 
 
 		 321 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0092  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0101  alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0992812 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.23 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  41.54 
 
 		 325 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  41.54 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.23 
 
 		 325 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.74 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  40.92 
 
 		 325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  40.66 
 
 		 325 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  39.69 
 
 		 325 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  40.18 
 
 		 326 aa  229  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0740  alcohol dehydrogenase  44.58 
 
 		 320 aa  228  9e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  40 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  38.89 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0107  alcohol dehydrogenase  47.06 
 
 		 322 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  45.48 
 
 		 323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  42.28 
 
 		 324 aa  216  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  42.55 
 
 		 324 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.81 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  42.04 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  41.85 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.18 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.67 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.18 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0644  alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.815744 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.18 
 
 		 324 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  41.49 
 
 		 324 aa  209  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  38.2 
 
 		 324 aa  208  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.68 
 
 		 324 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  38.55 
 
 		 333 aa  206  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10150  quinone oxidoreductase  43.79 
 
 		 322 aa  206  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40 
 
 		 324 aa  205  7e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  39.06 
 
 		 324 aa  205  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  42.28 
 
 		 331 aa  203  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.68 
 
 		 361 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  37.77 
 
 		 327 aa  202  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.46 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 		 323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.73 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  39.13 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.61 
 
 		 324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.77 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.62 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.55 
 
 		 326 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  42.55 
 
 		 326 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  39.44 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  39.13 
 
 		 324 aa  195  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  37.27 
 
 		 334 aa  195  9e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.51 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.04 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0958  alcohol dehydrogenase  39.75 
 
 		 324 aa  193  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  37.61 
 
 		 326 aa  192  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.46 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  41.3 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  39.94 
 
 		 340 aa  189  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.22 
 
 		 335 aa  189  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.89 
 
 		 324 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.2 
 
 		 326 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.93 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.56 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  38.39 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5243  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.37 
 
 		 329 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  42.55 
 
 		 326 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40 
 
 		 324 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0870  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.27 
 
 		 319 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3207  alcohol dehydrogenase  40.44 
 
 		 324 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  36.53 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.57 
 
 		 328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.1 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1667  alcohol dehydrogenase  41.91 
 
 		 329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.367647  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  41.56 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  38.94 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2911  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  39.94 
 
 		 333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128316  hitchhiker  0.0057385 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.97 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  41.88 
 
 		 326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  35.49 
 
 		 336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.22 
 
 		 324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3201  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  38.15 
 
 		 324 aa  182  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.73 
 
 		 325 aa  182  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1855  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.14 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4830  alcohol dehydrogenase  38.51 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 		 324 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.98 
 
 		 324 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1079  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.68 
 
 		 324 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.738268  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5263  putative oxidoreductase  41.43 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.305573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>