153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0472 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0472  cobalt transport protein CbiM  100 
 
 
225 aa  435  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  80.89 
 
 
251 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  82.73 
 
 
321 aa  362  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  72.89 
 
 
245 aa  332  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3892  cobalt transport protein CbiM  73.33 
 
 
256 aa  331  7.000000000000001e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.885543 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3205  cobalt transport protein CbiM  39.82 
 
 
229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2145  cobalt transport protein CbiM  38.57 
 
 
235 aa  170  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0808457  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1702  cobalamin biosynthesis protein CbiM  39.01 
 
 
231 aa  170  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.254913  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  39.11 
 
 
231 aa  169  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1293  cobalamin biosynthesis protein CbiM  37.33 
 
 
232 aa  170  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034572  normal  0.0275766 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2333  cobalt transport protein CbiM  40.35 
 
 
235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1216  cobalt transport protein CbiM  37.89 
 
 
231 aa  165  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1697  cobalt transport protein CbiM  45.18 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.30926 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0146  cobalt transport protein CbiM  40.09 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0185688  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0580  cobalt transport protein CbiM  40.62 
 
 
229 aa  160  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0323  cobalt transport protein CbiM  39.19 
 
 
249 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00019504  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1700  cobalt transport protein CbiM  37.39 
 
 
231 aa  155  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000112913  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1222  cobalt transport protein CbiM  40 
 
 
234 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.955789  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0531  cobalt transport protein CbiM  37.67 
 
 
230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0712  cobalamin biosynthesis protein CbiM  38.14 
 
 
235 aa  151  7e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0927  cobalamin biosynthesis protein CbiM  41.23 
 
 
250 aa  151  8e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2731  cobalamin biosynthesis protein CbiM  41.51 
 
 
250 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.480074  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0790  cobalt transport protein CbiM  38.5 
 
 
225 aa  149  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1193  cobalt transport protein CbiM  39.27 
 
 
225 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0725  cobalt transport protein CbiM  38.81 
 
 
225 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.145999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0560  cobalamin biosynthesis protein CbiM  40.81 
 
 
249 aa  149  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3736  cobalamin biosynthesis protein CbiM  39.64 
 
 
251 aa  148  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1276  cobalamin biosynthesis protein CbiM  41.9 
 
 
246 aa  148  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0097  cobalt transport protein CbiM  38.81 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1003  cobalamin biosynthesis protein CbiM  38.91 
 
 
236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0380  hypothetical protein  38.84 
 
 
259 aa  139  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2620  cobalt transport protein CbiM  41.92 
 
 
247 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1545  cobalt transport protein CbiM  37.79 
 
 
246 aa  138  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221341  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3660  cobalt transport protein CbiM  38.6 
 
 
225 aa  138  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3820  cobalt transport protein CbiM  42.93 
 
 
249 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1241  cobalt transport protein CbiM  42.79 
 
 
226 aa  136  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.335474  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1226  cobalt transport protein CbiM  42.79 
 
 
226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00004415  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  39.47 
 
 
599 aa  135  4e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2245  cobalt transport protein CbiM  40.93 
 
 
245 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.112187 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2199  cobalt transport protein CbiM  40.93 
 
 
245 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2358  cobalt transport protein CbiM  40.93 
 
 
245 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.372857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2145  cobalt transport protein CbiM  40.93 
 
 
245 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1709  cobalamin biosynthesis protein CbiM  38.81 
 
 
248 aa  135  7.000000000000001e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2192  cobalt transport protein CbiM  40.93 
 
 
245 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2601  cobalt transport protein CbiM  39.01 
 
 
246 aa  132  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1759  cobalt transport protein CbiM  40.44 
 
 
228 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2793  cobalt transport protein CbiM  41.41 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1060  cobalt transport protein CbiM  40.4 
 
 
254 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2595  cobalt transport protein CbiM  41.59 
 
 
226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0918235  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4719  cobalamin biosynthesis protein CbiM  39.11 
 
 
225 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0185  cobalt transport protein CbiM  33.63 
 
 
247 aa  121  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.878644  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0182  cobalt transport protein CbiM  33.63 
 
 
247 aa  121  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1266  cobalamin biosynthesis protein CbiM  36.57 
 
 
248 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0543  cobalamin biosynthesis protein CbiM  38.5 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1385  cobalamin biosynthesis protein CbiM  35.35 
 
 
250 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1861  cobalamin biosynthesis protein CbiM  40.72 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3589  cobalamin biosynthesis protein CbiM  40.51 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1480  cobalt transport protein CbiM  33.18 
 
 
213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2621  cobalt transport protein CbiM  31.65 
 
 
214 aa  106  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.78373  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0137  cobalt transport protein CbiM  31.25 
 
 
212 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0440058 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1766  cobalt transport protein CbiM  32.74 
 
 
212 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1402  cobalt transport protein CbiM  32.39 
 
 
212 aa  99.4  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0031  cobalt transport protein CbiM  31.56 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0090  cobalt transport protein CbiM  31.94 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1793  cobalt transport protein CbiM  30.36 
 
 
218 aa  89  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000128429  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2063  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.24 
 
 
232 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2109  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.24 
 
 
232 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494306  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2046  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.24 
 
 
232 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.79 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.79 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0391  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.43 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.026574  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2291  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.61 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.84 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4058  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.65 
 
 
235 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815174  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.44 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2134  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.63 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.19 
 
 
246 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2565  cobalt transport protein CbiM  29 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.779557  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1927  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.76 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1370  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.2 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.711039  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1116  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.46 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  34.27 
 
 
226 aa  77  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1767  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.73 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.113369  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0298  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.87 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306858  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  28.33 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1006  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.91 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0882  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.91 
 
 
421 aa  75.9  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0213  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.86 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.655003  normal  0.171707 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.19 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0681  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.61 
 
 
333 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1057  cobalt transport protein CbiM  27.78 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0330  cobalt transport protein CbiM  29.36 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.4 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347196  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1327  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.53 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.871033  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.76 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1351  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.69 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309906  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1755  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.22 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379762  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1637  cobalt transport protein CbiM  25.42 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000771093 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.77 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1803  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.72 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>