More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0177 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  76.66 
 
 		 468 aa  738    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  69.51 
 
 		 469 aa  666    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  100 
 
 		 469 aa  938    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  63.07 
 
 		 468 aa  588  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  62.42 
 
 		 468 aa  585  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  40.17 
 
 		 546 aa  361  2e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  40.17 
 
 		 546 aa  361  2e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  39.96 
 
 		 546 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  43.97 
 
 		 548 aa  346  4e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  39.91 
 
 		 546 aa  336  5e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  40.82 
 
 		 550 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  39.92 
 
 		 767 aa  317  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  38.87 
 
 		 467 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  39.57 
 
 		 767 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  38.71 
 
 		 475 aa  312  6.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  39.57 
 
 		 745 aa  309  6.999999999999999e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  38.45 
 
 		 503 aa  309  9e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  38.27 
 
 		 479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  37.93 
 
 		 464 aa  300  4e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  37.28 
 
 		 448 aa  300  5e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  37.47 
 
 		 479 aa  299  6e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  38.63 
 
 		 479 aa  296  8e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  37.04 
 
 		 453 aa  294  2e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.25653 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  37.53 
 
 		 550 aa  293  4e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  40.09 
 
 		 562 aa  293  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  37.29 
 
 		 551 aa  292  9e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  40.34 
 
 		 562 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  38.64 
 
 		 547 aa  288  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  38.64 
 
 		 547 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  37.26 
 
 		 552 aa  288  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  39.4 
 
 		 481 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0504  mercuric reductase  35.14 
 
 		 449 aa  286  4e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  40.48 
 
 		 562 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  38.9 
 
 		 560 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  39.65 
 
 		 468 aa  282  9e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  39.28 
 
 		 561 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  38.19 
 
 		 468 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  39.53 
 
 		 457 aa  279  6e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  38.75 
 
 		 541 aa  278  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3213  mercuric reductase  38.33 
 
 		 467 aa  277  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163863  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  38.57 
 
 		 561 aa  276  4e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5372  mercuric reductase  40.38 
 
 		 477 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4511  mercuric reductase  38.11 
 
 		 482 aa  274  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955631 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  38.05 
 
 		 565 aa  274  3e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1778  mercuric reductase  38.11 
 
 		 480 aa  274  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.3364  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  37.98 
 
 		 557 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  38.36 
 
 		 564 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  38.36 
 
 		 564 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  37.95 
 
 		 561 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  37.95 
 
 		 561 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  37.95 
 
 		 561 aa  272  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  37.95 
 
 		 561 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  37.95 
 
 		 561 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  37.95 
 
 		 561 aa  272  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  38.16 
 
 		 561 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  38.17 
 
 		 561 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  36.5 
 
 		 484 aa  270  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4269  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.42 
 
 		 462 aa  270  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170998  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  37.95 
 
 		 561 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1504  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.58 
 
 		 462 aa  268  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.515089  normal  0.0466141 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2847  mercuric reductase  36.68 
 
 		 484 aa  267  4e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4946  mercuric reductase  37.34 
 
 		 476 aa  266  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104965  decreased coverage  0.00400898 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.4 
 
 		 481 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  38.61 
 
 		 478 aa  263  4.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.95 
 
 		 484 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4465  mercuric reductase  37.16 
 
 		 476 aa  260  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4296  mercuric reductase  37.16 
 
 		 476 aa  260  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4196  mercuric reductase  37.16 
 
 		 476 aa  260  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.29 
 
 		 484 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.51 
 
 		 484 aa  259  8e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 		 459 aa  259  9e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.64 
 
 		 467 aa  258  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.4 
 
 		 473 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.42 
 
 		 467 aa  258  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.33 
 
 		 471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.86 
 
 		 464 aa  252  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.75 
 
 		 462 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06150  mercuric reductase  38.53 
 
 		 474 aa  251  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.31 
 
 		 462 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25620  mercuric reductase  38.32 
 
 		 474 aa  251  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.96 
 
 		 462 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  33.64 
 
 		 464 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  33.41 
 
 		 464 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2329  mercuric reductase  36.4 
 
 		 476 aa  249  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.85 
 
 		 466 aa  247  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  32.88 
 
 		 459 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  32.88 
 
 		 459 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  32.88 
 
 		 459 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.48 
 
 		 468 aa  247  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.25 
 
 		 460 aa  247  4e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  31.32 
 
 		 468 aa  246  6.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2009  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  37.01 
 
 		 471 aa  246  8e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2994  mercuric reductase  34.22 
 
 		 485 aa  246  8e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.62 
 
 		 463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.89 
 
 		 463 aa  244  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  33.33 
 
 		 459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  32.58 
 
 		 458 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.05 
 
 		 469 aa  243  6e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.05 
 
 		 468 aa  243  6e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  32.89 
 
 		 459 aa  243  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.429317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>