More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2995 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2995  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  100 
 
 
331 aa  670    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00123098  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0771  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  66.97 
 
 
335 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.999993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0804  alcohol dehydrogenase  66.26 
 
 
334 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01969  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  63 
 
 
329 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2214  alcohol dehydrogenase  65.24 
 
 
331 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0181  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  62.27 
 
 
334 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0163  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  61.42 
 
 
335 aa  408  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1110  alcohol dehydrogenase  61.16 
 
 
331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.346069  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4497  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  58.31 
 
 
332 aa  401  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0178815  hitchhiker  0.00000000000130084 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0695  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  58.01 
 
 
332 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00215673  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0877  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  57.1 
 
 
332 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.128187  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0879  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.5 
 
 
332 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.85611e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0747  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  56.5 
 
 
332 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0681  alcohol dehydrogenase, zinc containing  56.5 
 
 
332 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0784  alcohol dehydrogenase  56.5 
 
 
332 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0841407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0947  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  55.29 
 
 
332 aa  384  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000079706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0839  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.1 
 
 
331 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000366963  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3461  putative oxidoreductase  57.36 
 
 
330 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40830  putative oxidoreductase  57.06 
 
 
330 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1307  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.06 
 
 
333 aa  363  2e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2529  alcohol dehydrogenase  55.52 
 
 
329 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.180197  normal  0.304132 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1784  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.45 
 
 
326 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0104845 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1510  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  53.47 
 
 
331 aa  352  7e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1356  putative NADPH:quinone reductase/ Zn-dependent oxidoreductase  52.57 
 
 
353 aa  346  4e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1264  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.08 
 
 
336 aa  346  4e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5875  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  52 
 
 
332 aa  335  5e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0754792  normal  0.429902 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0018  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.62 
 
 
334 aa  327  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000105442  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1341  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.48 
 
 
330 aa  326  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000434756  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0011  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  48.93 
 
 
334 aa  323  3e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2219  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.85 
 
 
588 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2957  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.67 
 
 
335 aa  308  9e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1586  alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 
330 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0178  YhdH/YhfP family quinone oxidoreductase  49.24 
 
 
326 aa  299  4e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000873043  normal  0.604397 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 
336 aa  298  7e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351283  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.48 
 
 
328 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18460  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.84 
 
 
327 aa  295  7e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0250  alcohol dehydrogenase  47.09 
 
 
326 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0254  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.79 
 
 
326 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000117637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  47.4 
 
 
328 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  49.38 
 
 
327 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6206  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.71 
 
 
328 aa  289  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  48.62 
 
 
332 aa  287  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4187  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.62 
 
 
332 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1314  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.15 
 
 
336 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0952218  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.83 
 
 
331 aa  287  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0252  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  47.09 
 
 
326 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3679  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.54 
 
 
326 aa  287  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0862676  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0249  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.93 
 
 
325 aa  286  4e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0608751  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1416  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.85 
 
 
336 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0260  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.93 
 
 
325 aa  285  7e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.93 
 
 
331 aa  285  8e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4334  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.31 
 
 
334 aa  285  8e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4413  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  47.24 
 
 
325 aa  285  9e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00493012  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0255  quinone oxidoreductase  46.18 
 
 
326 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3572  alcohol dehydrogenase  46.48 
 
 
326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1505  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  47.38 
 
 
330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.93 
 
 
328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227745  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1419  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.67 
 
 
328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2229  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.47 
 
 
327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.979693 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5289  quinone oxidoreductase  46.77 
 
 
327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574483  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1675  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.69 
 
 
327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509844  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4991  alcohol dehydrogenase  47.85 
 
 
328 aa  282  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0250  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.68 
 
 
327 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.68401  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.95 
 
 
329 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  44.95 
 
 
328 aa  281  9e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0752  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  46.18 
 
 
330 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534368  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1210  alcohol dehydrogenase  47.85 
 
 
328 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783737  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2475  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.32 
 
 
329 aa  280  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3530  alcohol dehydrogenase  46.18 
 
 
326 aa  280  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2154  alcohol dehydrogenase  46.48 
 
 
326 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.573953  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.42 
 
 
328 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0309  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.18 
 
 
328 aa  280  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1229  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.15 
 
 
342 aa  280  3e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.157055  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0065  alcohol dehydrogenase  48.64 
 
 
326 aa  280  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4744  alcohol dehydrogenase  46.46 
 
 
327 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3700  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  46.6 
 
 
327 aa  279  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2231  alcohol dehydrogenase  46.18 
 
 
326 aa  279  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499373  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3205  alcohol dehydrogenase  49.4 
 
 
331 aa  279  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4779  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.09 
 
 
325 aa  279  5e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279047  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.74 
 
 
328 aa  279  5e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.51 
 
 
345 aa  278  6e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3941  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  45.57 
 
 
326 aa  278  7e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1035  alcohol dehydrogenase  46.79 
 
 
326 aa  278  7e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3835  quinone oxidoreductase  48 
 
 
328 aa  278  9e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0272  quinone oxidoreductase  44.95 
 
 
326 aa  278  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2363  alcohol dehydrogenase  46.48 
 
 
329 aa  277  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.949479  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4477  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  43.87 
 
 
327 aa  276  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000206096 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2046  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.04 
 
 
333 aa  276  4e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24770  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  50 
 
 
328 aa  276  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.34 
 
 
328 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3346  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  46.97 
 
 
328 aa  276  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.584462  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2606  alcohol dehydrogenase  51.5 
 
 
328 aa  275  7e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.836492  hitchhiker  0.00218108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0808  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.24 
 
 
327 aa  275  8e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5461  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.68 
 
 
327 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5401  alcohol dehydrogenase  45.68 
 
 
327 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910947 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2493  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.18 
 
 
326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3408  alcohol dehydrogenase  44.79 
 
 
327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1073  alcohol dehydrogenase  48.17 
 
 
334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0271  alcohol dehydrogenase  45.57 
 
 
326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000478762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1223  quinone oxidoreductase  46.6 
 
 
328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>