More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2645 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
309 aa  600  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.32 
 
 
291 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.46 
 
 
291 aa  318  6e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  45.61 
 
 
293 aa  243  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  42.81 
 
 
294 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  39.64 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  38.98 
 
 
297 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.55 
 
 
314 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  39.08 
 
 
301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.2 
 
 
314 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  41.84 
 
 
314 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  40.35 
 
 
310 aa  185  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  36.36 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  38.44 
 
 
303 aa  182  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  38.49 
 
 
311 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  34.28 
 
 
299 aa  179  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.21 
 
 
317 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  36.36 
 
 
310 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  38.15 
 
 
329 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.78 
 
 
301 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.24 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  35.69 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.94 
 
 
305 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.71 
 
 
305 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.52 
 
 
301 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  34.62 
 
 
309 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  36.08 
 
 
312 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  34.28 
 
 
345 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.01 
 
 
305 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.69 
 
 
310 aa  169  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  34.06 
 
 
294 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  35.17 
 
 
312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  35.17 
 
 
312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  35.17 
 
 
312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  35.17 
 
 
312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  35.17 
 
 
312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  35.17 
 
 
312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  34.86 
 
 
301 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  35.4 
 
 
331 aa  159  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  32.88 
 
 
341 aa  159  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.89 
 
 
298 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  34.81 
 
 
313 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  34.15 
 
 
324 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  32.86 
 
 
302 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  32.63 
 
 
325 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  32.86 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  33.1 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  32.51 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  32.51 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  33.22 
 
 
303 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  32.28 
 
 
303 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  32.16 
 
 
303 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  32.16 
 
 
303 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  32.75 
 
 
303 aa  145  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  32.53 
 
 
341 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  32.88 
 
 
301 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  32.75 
 
 
303 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  32.75 
 
 
303 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  33.8 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  31.39 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  29.55 
 
 
295 aa  138  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.42 
 
 
307 aa  137  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8133  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.67 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512786  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  31.8 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  35.34 
 
 
299 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3545  hypothetical protein  34.74 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
302 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.39 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  31.91 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  30.99 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  34.35 
 
 
300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  28.67 
 
 
299 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3902  hypothetical protein  33.8 
 
 
309 aa  125  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.773994  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  28.87 
 
 
293 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  28.87 
 
 
293 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0798  integral membrane protein  31.45 
 
 
298 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.252294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  31.43 
 
 
305 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2803  hypothetical protein  30.03 
 
 
297 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  29.23 
 
 
290 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.92 
 
 
297 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  32.41 
 
 
299 aa  122  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.92 
 
 
297 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3406  hypothetical protein  33.68 
 
 
300 aa  122  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  32.98 
 
 
341 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2741  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.8 
 
 
289 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3401  hypothetical protein  34.15 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0214667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3611  hypothetical protein  34.87 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0603638  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  28.98 
 
 
297 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1462  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 
333 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1524  hypothetical protein  33.22 
 
 
305 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1426  hypothetical protein  32.88 
 
 
302 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1230  hypothetical protein  32.17 
 
 
315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.112754 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0367  hypothetical protein  32.88 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2701  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.41 
 
 
312 aa  115  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  30.69 
 
 
289 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1415  integral membrane protein  32.28 
 
 
305 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.123619  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  32 
 
 
311 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  32.63 
 
 
300 aa  112  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2576  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.78 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160731  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.17 
 
 
292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>