More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1872 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1872  acyltransferase 3  100 
 
 
422 aa  848    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.341977  normal  0.27235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4745  acyltransferase 3  27.76 
 
 
398 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0151092  normal  0.0124888 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.42 
 
 
616 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  28.78 
 
 
621 aa  84  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  27.91 
 
 
667 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  26.65 
 
 
629 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  26.74 
 
 
647 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0731  acyltransferase 3  27.55 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328082  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  23.1 
 
 
583 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  26.7 
 
 
671 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  24.74 
 
 
598 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  25.77 
 
 
695 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  23.17 
 
 
622 aa  73.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  26.52 
 
 
629 aa  73.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  25.06 
 
 
656 aa  73.6  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  25.07 
 
 
603 aa  73.6  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  25.07 
 
 
603 aa  73.6  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  27.08 
 
 
632 aa  73.6  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2132  O-antigen acetylase, putative  26.79 
 
 
760 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  25.65 
 
 
662 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1849  acyltransferases-like  29.05 
 
 
454 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  32.42 
 
 
673 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  22.88 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  34.12 
 
 
675 aa  71.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  30.2 
 
 
643 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  26.52 
 
 
695 aa  70.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  23.23 
 
 
603 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  23.64 
 
 
604 aa  70.5  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  25.53 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  23.64 
 
 
604 aa  70.5  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  23.18 
 
 
639 aa  70.5  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  26.55 
 
 
695 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  34.24 
 
 
716 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  34.62 
 
 
660 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  24.32 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  33.15 
 
 
374 aa  69.7  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  31.34 
 
 
688 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  26.45 
 
 
368 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  27.58 
 
 
629 aa  68.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0302  acyltransferase 3  28.26 
 
 
592 aa  67.8  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  24.67 
 
 
636 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  26.6 
 
 
681 aa  68.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  25.14 
 
 
641 aa  68.2  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  27.43 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  31.84 
 
 
742 aa  67.8  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  29.53 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  26.7 
 
 
656 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4314  acyltransferase 3  24.33 
 
 
394 aa  67  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  28.99 
 
 
675 aa  66.6  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  25.15 
 
 
652 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  31.58 
 
 
642 aa  66.2  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  33.73 
 
 
584 aa  66.6  0.0000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  29.29 
 
 
679 aa  66.6  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  28.18 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  28.37 
 
 
640 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  28.16 
 
 
683 aa  66.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2232  putative membrane-located cell surface O-antigen acetylase  26.93 
 
 
372 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  24.22 
 
 
346 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0993  acyltransferase 3  38.46 
 
 
371 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  30.22 
 
 
635 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  30.9 
 
 
393 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2227  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related membrane protein  26.65 
 
 
403 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  23.46 
 
 
690 aa  65.1  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  25.95 
 
 
415 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  29.69 
 
 
607 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  34.71 
 
 
360 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  25.32 
 
 
383 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  31.11 
 
 
435 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  25.86 
 
 
645 aa  64.3  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  26.15 
 
 
657 aa  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  26.39 
 
 
638 aa  63.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  30.99 
 
 
685 aa  63.5  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  24.79 
 
 
354 aa  63.5  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  28.81 
 
 
696 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  28.65 
 
 
658 aa  63.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2186  acyltransferase  24.74 
 
 
369 aa  63.5  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  31.82 
 
 
637 aa  63.2  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  24.82 
 
 
408 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  28.65 
 
 
658 aa  63.2  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3900  acyltransferase 3  26.5 
 
 
423 aa  63.2  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  28.33 
 
 
380 aa  63.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0412  acyltransferase 3  25 
 
 
621 aa  63.2  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00103488  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  35.67 
 
 
660 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  25.99 
 
 
671 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  27.3 
 
 
679 aa  62.4  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1409  acyltransferase 3  23.48 
 
 
695 aa  62.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000344331  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2409  hypothetical protein  25.73 
 
 
605 aa  62.8  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.372977  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  26.26 
 
 
718 aa  62.4  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  31.58 
 
 
635 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2879  hypothetical protein  23.78 
 
 
379 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  33.14 
 
 
690 aa  62  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  25.42 
 
 
393 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  29.12 
 
 
711 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  24.93 
 
 
690 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  26.07 
 
 
634 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2590  acyltransferase 3  26.77 
 
 
360 aa  61.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  22.26 
 
 
660 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  26.76 
 
 
645 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1071  acyltransferase 3  26.48 
 
 
366 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.710446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5497  acyltransferase 3  29.55 
 
 
977 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.114019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>