135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0700 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0700  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  509  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0767  hypothetical protein  49.81 
 
 
263 aa  217  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1835  hypothetical protein  42.35 
 
 
267 aa  184  9e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3633  hypothetical protein  44.64 
 
 
265 aa  184  1e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2020  hypothetical protein  44.54 
 
 
263 aa  184  1e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0076  hypothetical protein  40.77 
 
 
269 aa  184  1e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0298659  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7995  hypothetical protein  45.42 
 
 
263 aa  182  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138428  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2239  hypothetical protein  45.42 
 
 
263 aa  182  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255232  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0198  hypothetical protein  42.56 
 
 
268 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.68555 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2410  hypothetical protein  42.74 
 
 
265 aa  180  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0072  hypothetical protein  46.5 
 
 
263 aa  174  1e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0121  hypothetical protein  43.14 
 
 
266 aa  172  4e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3122  hypothetical protein  38.02 
 
 
268 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.859294  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1497  hypothetical protein  38.35 
 
 
267 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0286332 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2266  hypothetical protein  38.71 
 
 
272 aa  155  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.336185  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2153  hypothetical protein  38.71 
 
 
272 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0097  hypothetical protein  38.71 
 
 
272 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401085  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2190  hypothetical protein  38.71 
 
 
272 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5072  putative ABC transporter, inner membrane subunit  38.58 
 
 
267 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362537  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1069  hypothetical protein  38.71 
 
 
272 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.443958  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2321  hypothetical protein  38.71 
 
 
272 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1311  hypothetical protein  38.71 
 
 
272 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1798  hypothetical protein  38.71 
 
 
272 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.539315  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2104  hypothetical protein  39.91 
 
 
267 aa  153  3e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.399014  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6305  hypothetical protein  38.58 
 
 
267 aa  153  3e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1799  hypothetical protein  38.58 
 
 
267 aa  153  3e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.551052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1774  hypothetical protein  38.58 
 
 
267 aa  153  3e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.113625  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1713  hypothetical protein  37.64 
 
 
267 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1863  hypothetical protein  38.43 
 
 
268 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00500964  normal  0.0941942 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0165  hypothetical protein  41.78 
 
 
266 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.980165  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1685  hypothetical protein  37 
 
 
267 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1807  hypothetical protein  39.21 
 
 
265 aa  148  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162766  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2323  ABC transporter, inner membrane subunit  38.04 
 
 
268 aa  147  1e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2539  hypothetical protein  39.09 
 
 
266 aa  146  4e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0939059  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0279  hypothetical protein  35.94 
 
 
260 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2007  ABC-type transport system, permease component  42.65 
 
 
266 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089276  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0986  hypothetical protein  38.04 
 
 
268 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2510  hypothetical protein  37.76 
 
 
258 aa  140  2e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0764  hypothetical protein  38.03 
 
 
269 aa  139  4e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0571603 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0698  hypothetical protein  37.18 
 
 
269 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.217447 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1087  hypothetical protein  33.48 
 
 
263 aa  137  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3518  hypothetical protein  38.33 
 
 
257 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000832658  normal  0.16619 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0748  hypothetical protein  38.03 
 
 
272 aa  132  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0900  hypothetical protein  36.11 
 
 
258 aa  129  5e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1234  hypothetical protein  33.48 
 
 
261 aa  129  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1073  hypothetical protein  38.1 
 
 
263 aa  128  1e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.780627  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4303  hypothetical protein  34.75 
 
 
258 aa  128  1e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.121514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4241  hypothetical protein  34.87 
 
 
258 aa  127  2e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3461  hypothetical protein  34.45 
 
 
262 aa  126  4e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5176  hypothetical protein  34.69 
 
 
265 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4811  hypothetical protein  34.69 
 
 
265 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4653  hypothetical protein  34.69 
 
 
265 aa  125  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0534  hypothetical protein  35.53 
 
 
267 aa  125  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5084  hypothetical protein  34.69 
 
 
265 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5050  hypothetical protein  34.69 
 
 
265 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5079  hypothetical protein  34.69 
 
 
265 aa  125  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0161  hypothetical protein  34.69 
 
 
265 aa  125  8e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4673  hypothetical protein  34.69 
 
 
265 aa  125  8e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5081  hypothetical protein  34.69 
 
 
265 aa  125  8e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1218  hypothetical protein  32.81 
 
 
258 aa  122  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0080  ABC transporter permease  33.48 
 
 
266 aa  121  1e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0755  hypothetical protein  35.53 
 
 
262 aa  121  1e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  3.02353e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1804  hypothetical protein  36.21 
 
 
265 aa  121  1e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1348  hypothetical protein  30.66 
 
 
264 aa  121  1e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1139  hypothetical protein  33.16 
 
 
265 aa  121  1e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.529413 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0731  hypothetical protein  35.53 
 
 
262 aa  121  1e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  2.07096e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1437  hypothetical protein  35.83 
 
 
264 aa  121  1e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318799  normal  0.0549134 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01854  hypothetical protein  31.67 
 
 
266 aa  121  1e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0169  ABC transporter, permease protein, putative  33.9 
 
 
263 aa  120  2e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.645871  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04990  conserved hypothetical protein  31.82 
 
 
311 aa  120  2e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.804578  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0934  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30.89 
 
 
253 aa  120  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  7.94066e-09  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4760  hypothetical protein  33.67 
 
 
264 aa  119  4e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1058  hypothetical protein  33.64 
 
 
261 aa  119  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1171  hypothetical protein  32.74 
 
 
261 aa  118  8e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.739375  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0254  hypothetical protein  33.64 
 
 
251 aa  117  2e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.59378e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1727  hypothetical protein  35.43 
 
 
265 aa  117  2e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1309  hypothetical protein  32.37 
 
 
259 aa  117  2e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15630  conserved hypothetical protein TIGR00245  35.82 
 
 
260 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15102  predicted protein  31.2 
 
 
247 aa  116  4e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.763403  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003828  ABC-type uncharacterized transport system permease component  30.27 
 
 
270 aa  115  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2456  hypothetical protein  35.4 
 
 
261 aa  115  9e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2632  hypothetical protein  35.47 
 
 
261 aa  113  4e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0680234  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0426  hypothetical protein  30.62 
 
 
259 aa  113  4e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0595  hypothetical protein  30.62 
 
 
259 aa  112  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00447  hypothetical protein  30.62 
 
 
259 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3119  conserved hypothetical protein  30.62 
 
 
259 aa  112  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2859  hypothetical protein  36.29 
 
 
252 aa  112  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00442  predicted inner membrane protein  30.62 
 
 
259 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0570  hypothetical protein  30.62 
 
 
259 aa  112  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0540  hypothetical protein  30.62 
 
 
259 aa  112  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3125  hypothetical protein  30.62 
 
 
259 aa  112  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0530  hypothetical protein  30.62 
 
 
259 aa  112  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2290  hypothetical protein  35.59 
 
 
261 aa  108  7e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.47425e-05 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0552  hypothetical protein  30.16 
 
 
259 aa  108  9e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.417119  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0557  hypothetical protein  30.16 
 
 
259 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0567  hypothetical protein  30.16 
 
 
259 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0550  hypothetical protein  30.16 
 
 
259 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0611  hypothetical protein  30.16 
 
 
259 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2037  hypothetical protein  30.54 
 
 
258 aa  106  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.179883  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2942  hypothetical protein  33 
 
 
256 aa  106  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>