More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0504 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0504  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 267 aa  545  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0630883  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5206  beta-lactamase domain-containing protein  57.58 
 
 		 259 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3933  beta-lactamase domain protein  55.02 
 
 		 276 aa  281  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.997989  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4819  beta-lactamase-like protein  56.82 
 
 		 259 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4905  beta-lactamase domain-containing protein  56.82 
 
 		 259 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38972 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1370  beta-lactamase domain-containing protein  55.13 
 
 		 257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.157662 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5436  beta-lactamase domain-containing protein  55.13 
 
 		 257 aa  264  8.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13708  hydrolase  54.96 
 
 		 264 aa  254  8e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0451158 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2265  beta-lactamase domain protein  53.53 
 
 		 275 aa  231  7.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000365974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0248  beta-lactamase domain protein  50.38 
 
 		 266 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0330  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478372  normal  0.100644 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36150  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  47.53 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2528  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 260 aa  211  9e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00565773  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4284  beta-lactamase-like  47.16 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  46.69 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0716  beta-lactamase domain protein  50.76 
 
 		 270 aa  195  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  46.54 
 
 		 264 aa  185  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  46.88 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  44.66 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19280  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  47.43 
 
 		 271 aa  178  7e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0116  putative hydrolase  45.7 
 
 		 284 aa  176  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4788  beta-lactamase domain-containing protein  44.83 
 
 		 275 aa  176  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5314  beta-lactamase domain protein  43.7 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  45.31 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0338  beta-lactamase domain-containing protein  44.53 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4347  beta-lactamase domain-containing protein  45.02 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1063  beta-lactamase domain-containing protein  41.04 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1854  beta-lactamase domain protein  39.85 
 
 		 272 aa  145  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1997  beta-lactamase domain-containing protein  38.82 
 
 		 268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0801  beta-lactamase domain-containing protein  32.37 
 
 		 301 aa  132  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0425  beta-lactamase domain protein  38.19 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  34.78 
 
 		 297 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4749  beta-lactamase domain protein  35.82 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0671  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  31.18 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  31.54 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2452  putative Beta-lactamase  32.62 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 568 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 568 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  31.9 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26240  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.74 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.810697  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  32.64 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  31.45 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  32.4 
 
 		 566 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  31.18 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 544 aa  106  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  34.97 
 
 		 233 aa  105  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  31.6 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  32.51 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  32.97 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  37.08 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2731  beta-lactamase domain-containing protein  31.56 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 		 556 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  30.86 
 
 		 556 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0613  beta-lactamase-like  30.82 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  36.48 
 
 		 500 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4296  beta-lactamase-like  30.47 
 
 		 308 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.0768999 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2717  beta-lactamase domain-containing protein  31.99 
 
 		 278 aa  99.4  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  30.74 
 
 		 557 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  30.39 
 
 		 310 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  27.05 
 
 		 316 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  30.63 
 
 		 317 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 		 310 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0552  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 		 302 aa  96.3  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0754  beta-lactamase-like  30.57 
 
 		 315 aa  95.9  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  30.86 
 
 		 550 aa  95.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2470  beta-lactamase domain-containing protein  29.93 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708378 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  33.61 
 
 		 497 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  34.02 
 
 		 497 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  28.9 
 
 		 545 aa  93.2  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06001  metallo-beta-lactamase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G00120)  34.84 
 
 		 309 aa  92.4  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355889  normal  0.401572 
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  27.3 
 
 		 301 aa  92.4  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1127  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.58 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  27.3 
 
 		 306 aa  92.8  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05524  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12940)  31.23 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  30.04 
 
 		 566 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  30.91 
 
 		 559 aa  91.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 		 315 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  31.14 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  29.6 
 
 		 562 aa  89.4  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1276  beta-lactamase domain protein  34.13 
 
 		 290 aa  89.4  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0675547  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4714  beta-lactamase domain-containing protein  29.28 
 
 		 312 aa  89  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1832  beta-lactamase-like  34.67 
 
 		 294 aa  85.9  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930975  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0361  beta-lactamase-like protein  30.74 
 
 		 306 aa  85.5  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1837  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 		 303 aa  85.5  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1920  hypothetical protein  30.88 
 
 		 301 aa  85.5  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000181581  hitchhiker  0.000000000000329346 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  28.52 
 
 		 307 aa  85.5  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0204  metallo-beta-lactamase family protein  29.97 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1441  beta-lactamase domain-containing protein  29.97 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.610229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1541  beta-lactamase domain protein  32.81 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  27.92 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  31.4 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  29 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  31.79 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07070  conserved hypothetical protein  29.35 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0787298 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  31.69 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  31.98 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>