More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0795 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0795  primosomal protein DnaI  100 
 
 		 313 aa  651    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2663  primosomal protein DnaI  76.05 
 
 		 312 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.150188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3264  primosomal protein DnaI  58.25 
 
 		 311 aa  401  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0423883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0550  primosomal protein DnaI  57.69 
 
 		 312 aa  393  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000173374  unclonable  3.70822e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4474  primosomal protein DnaI  57.37 
 
 		 312 aa  388  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4309  primosomal protein DnaI  57.37 
 
 		 312 aa  388  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0309734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4320  primosomal protein DnaI  57.37 
 
 		 312 aa  388  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4693  primosomal protein DnaI  57.37 
 
 		 312 aa  388  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.23235e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4822  primosomal protein DnaI  57.37 
 
 		 312 aa  388  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4703  primosomal protein DnaI  57.37 
 
 		 312 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000143247  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4709  primosomal protein DnaI  56.73 
 
 		 312 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4688  primosomal protein DnaI  57.05 
 
 		 312 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000410016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4409  primosomal protein DnaI  56.41 
 
 		 312 aa  381  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0232524  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1242  replicative DNA helicase loader DnaI  44.86 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118645  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1741  primosomal protein DnaI  40.54 
 
 		 306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1775  primosomal protein DnaI  40.54 
 
 		 306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1247  primosomal protein DnaI  38.85 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.126779  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1416  primosomal protein DnaI  34.95 
 
 		 299 aa  209  3e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0273394  hitchhiker  0.000000000000115155 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0796  primosomal protein DnaI  36.25 
 
 		 293 aa  199  6e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0358  primosomal protein DnaI  36.62 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1621  primosomal protein DnaI  36.33 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0122  primosomal protein DnaI  33.96 
 
 		 337 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0444634  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0531  replicative DNA helicase loader DnaI  31.51 
 
 		 315 aa  170  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296741  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0678  replicative DNA helicase loader DnaI  32.52 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0633  hypothetical protein  28.68 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0700177  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl579  chromosomal replication initiator protein  25.77 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1803  DNA replication protein-like protein  27.06 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.810263  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  36.99 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  31.28 
 
 		 275 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  38.18 
 
 		 266 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  34.07 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  31.62 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  30 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  30.73 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  31.69 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  33.87 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  26.51 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2467  hypothetical protein  30.77 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  28.38 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  31.82 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  30.34 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0311  hypothetical protein  28.21 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  30.28 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  30.28 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  30.28 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  30.28 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2615  DNA replication protein-like protein  31.16 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00158711  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  30.72 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  25.11 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  38.1 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  29.63 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0524  IstB ATP binding domain-containing protein  34.55 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0785  IstB domain protein ATP-binding protein  28.4 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.910617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0503  hypothetical protein  37.84 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000358381  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  28.29 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  31.18 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1254  DNA replication protein DnaC  24.88 
 
 		 242 aa  67  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.014499  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02920  hypothetical protein  30.06 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000406909  hitchhiker  2.4308e-42 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0538  Chromosomal replication initiator DnaA  29.29 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  35.78 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  27.67 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  27.67 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  27.67 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  27.67 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4137  IstB ATP binding domain-containing protein  26.09 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  27.81 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  27.67 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  25.79 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  25.79 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  25.79 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  25.79 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  25.79 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  25.79 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  25.79 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  25.79 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  26.36 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  25.79 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6259  IstB-like ATP-binding protein  24.84 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1327  IstB ATP binding domain-containing protein  25.69 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3709  DNA replication protein-like protein  28.78 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0552  DNA replication protein DnaC  29.17 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000116033  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  22.5 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  22.5 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  27.95 
 
 		 250 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2292  IstB domain protein ATP-binding protein  29.25 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2088  IstB domain protein ATP-binding protein  29.25 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0259  IstB domain protein ATP-binding protein  29.25 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3654  DNA replication protein-like protein  29 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3728  DNA replication protein-like protein  29 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1939  IstB-like ATP-binding protein  25.43 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3309  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.06 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.06 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000132407  decreased coverage  0.000453889 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  25.45 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2290  IstB ATP binding domain-containing protein  25.32 
 
 		 249 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4797  IstB ATP binding domain-containing protein  25.32 
 
 		 249 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4289  IstB ATP binding domain-containing protein  23.11 
 
 		 243 aa  57  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.991819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4397  IstB ATP binding domain-containing protein  23.11 
 
 		 243 aa  57  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.101635  normal  0.403377 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4787  IstB ATP binding domain-containing protein  23.11 
 
 		 243 aa  57  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>