98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0668 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0668  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 424 aa  871    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0514  helix-turn-helix domain-containing protein  27.65 
 
 		 426 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0725  transcriptional activator  27.71 
 
 		 419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0508  transcriptional activator (transcriptional regulator)  27.67 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0510  transcriptional activator (transcriptional regulator)  27.21 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.924451  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4702  transcriptional activator  27.63 
 
 		 419 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00084826 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0512  XRE family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 419 aa  123  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0636  transcriptional activator  25.58 
 
 		 423 aa  120  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0423  transcriptional regulator/TPR domain protein, putative  23.75 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0566  transcriptional regulator  25.06 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0597  transcriptional regulator  25.06 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0665  transcriptional regulator  25.71 
 
 		 425 aa  106  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0654  DNA-binding protein  24.71 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000206988 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3150  response regulator aspartate phosphatase  24.14 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3484  prophage LambdaBa01 TPR domain-containing protein  24.59 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0831404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3760  prophage LambdaBa01 TPR domain-containing protein  24.59 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2600  transcriptional regulator  20.92 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3530  tetratricopeptide domain protein  22.87 
 
 		 364 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.531812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3656  putative transcriptional regulator/TPR domain protein  22.9 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3223  response regulator aspartate phosphatase  21.98 
 
 		 364 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3523  response regulator, putative  21.7 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.552146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1096  RapA  22.19 
 
 		 362 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25717e-56 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  20.7 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2346  hypothetical protein  22.85 
 
 		 370 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0937  response regulator aspartate phosphatase  22.67 
 
 		 364 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000161233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2538  hypothetical protein  24.51 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.94583e-38 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2522  hypothetical protein  23.18 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0747  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  22.8 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  22.8 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2305  response regulator aspartate phosphatase  23.06 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.58434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2262  response regulator aspartate phosphatase  23.32 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.441755  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2838  hypothetical protein  22.37 
 
 		 366 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.225099  hitchhiker  0.000000000956364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1701  TPR domain protein  21.12 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.12385  hitchhiker  0.000000000000106418 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1055  RapA  22.88 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0938  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00566823  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1922  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.110519  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5495  response regulator aspartate phosphatase  22.79 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.117806  normal  0.0908941 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3531  TPR domain protein  21.33 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  22.42 
 
 		 782 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0335  response regulator aspartate phosphatase  22.17 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5701  response regulator aspartate phosphatase  22.75 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0468403 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3284  TPR domain-containing protein  20.59 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3050  TPR domain-containing protein  20.59 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.382615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3275  TPR domain protein  20.59 
 
 		 371 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1738  response regulator aspartate phosphatase  21.86 
 
 		 364 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0795874 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3275  response regulator aspartate phosphatase  22.89 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0103646  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0929  response regulator aspartate phosphatase  21.94 
 
 		 364 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00016582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3524  putative response regulator  20.87 
 
 		 364 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.305142 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3509  putative response regulator  20.87 
 
 		 364 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0853  ATPase  23.36 
 
 		 844 aa  53.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3738  response regulator aspartate phosphatase  21.66 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3287  tetratricopeptide domain protein  20.74 
 
 		 367 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0992  tetratricopeptide domain-containing protein  23.18 
 
 		 364 aa  50.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3548  tetratricopeptide domain protein  22.83 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3988  tetratricopeptide domain-containing protein  19.73 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4214  response regulator aspartate phosphatase  21.75 
 
 		 364 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0273315  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  21.9 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5049  transcriptional activator  26.8 
 
 		 285 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5033  transcription activator  26.8 
 
 		 285 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.191322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  27.84 
 
 		 285 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0335  helix-turn-helix domain protein  49.02 
 
 		 301 aa  47.4  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5477  tetratricopeptide domain-containing protein  21.86 
 
 		 364 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.131385  hitchhiker  0.00078785 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5443  putative transcriptional regulator PlcR  26.8 
 
 		 285 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3308  hypothetical protein  21.4 
 
 		 224 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3185  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 421 aa  47  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5199  transcriptional regulator, PlcR  26.8 
 
 		 213 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3222  TPR repeat-containing protein  21.11 
 
 		 370 aa  46.6  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.283929  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0319  tetratricopeptide repeat protein  23.56 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1998  TPR repeat-containing protein  20.74 
 
 		 364 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1596  response regulator aspartate phosphatase  21.64 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0110832  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  27.12 
 
 		 985 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4835  response regulator aspartate phosphatase  20.29 
 
 		 364 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5479  putative transcriptional regulator PlcR  27.84 
 
 		 285 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000111873  hitchhiker  1.75075e-16 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  27.52 
 
 		 1020 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5481  transcriptional regulator PlcR, putative  38.89 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1590  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 456 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5473  putative transcriptional regulator PlcR  24.74 
 
 		 285 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00043011  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3404  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  54.76 
 
 		 134 aa  44.7  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  44.44 
 
 		 175 aa  44.3  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2570  hypothetical protein  33.33 
 
 		 430 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258744  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  42.59 
 
 		 178 aa  44.3  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4243  RapA  19.61 
 
 		 364 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0000000283266 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3869  helix-turn-helix domain-containing protein  38.89 
 
 		 288 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00219461  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 117 aa  43.9  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2168  RapC  21 
 
 		 336 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0148  response regulator, putative  18.9 
 
 		 364 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.43 
 
 		 636 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 176 aa  43.9  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1747  transcriptional regulator, XRE family  33.96 
 
 		 436 aa  43.9  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0264  tetratricopeptide repeat domain protein  19.18 
 
 		 364 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  23.49 
 
 		 957 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1699  hypothetical protein  41.82 
 
 		 421 aa  43.5  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000791794  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 923 aa  43.1  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1433  hypothetical protein  41.82 
 
 		 421 aa  43.1  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>