More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0682 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  79.85 
 
 		 531 aa  901    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 530 aa  1100    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1402  AMP-dependent synthetase and ligase  46.97 
 
 		 532 aa  474  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4009  AMP-dependent synthetase and ligase  45.88 
 
 		 540 aa  456  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3355  AMP-dependent synthetase and ligase  45.57 
 
 		 537 aa  457  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1369  AMP-dependent synthetase and ligase  45.44 
 
 		 541 aa  455  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00896755  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5356  AMP-dependent synthetase and ligase  45.54 
 
 		 523 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0820  AMP-dependent synthetase and ligase  44.72 
 
 		 538 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.594452 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0606  AMP-dependent synthetase and ligase  45.23 
 
 		 560 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2165  AMP-dependent synthetase and ligase  42.03 
 
 		 511 aa  413  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2795  acyl-CoA synthetase  42.26 
 
 		 548 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0588  AMP-dependent synthetase and ligase  41.65 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204195  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2052  AMP-dependent synthetase and ligase  41.86 
 
 		 523 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8058  AMP-dependent synthetase and ligase  40.89 
 
 		 514 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2369  acyl-CoA synthetase  42.56 
 
 		 540 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35940  acyl-CoA synthetase  41.45 
 
 		 548 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0629004  hitchhiker  4.55863e-16 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25250  acyl-CoA synthetase  43.13 
 
 		 540 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0900  acyl-CoA synthetase  42.83 
 
 		 540 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0183173  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  40.82 
 
 		 511 aa  395  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2093  acyl-CoA synthetase  43.59 
 
 		 542 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100174  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3553  acyl-CoA synthetase  42.56 
 
 		 540 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.817597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2221  acyl-CoA synthetase  42.56 
 
 		 540 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0056  AMP-dependent synthetase and ligase  41.12 
 
 		 517 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3817  acyl-CoA synthetase  42.03 
 
 		 539 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09660  acyl-CoA synthetase  42.64 
 
 		 540 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00865902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2009  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 		 521 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.11837  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2709  acyl-CoA synthetase  42.69 
 
 		 549 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1658  acyl-CoA synthetase  43.21 
 
 		 542 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.125326  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2684  acyl-CoA synthetase  41.22 
 
 		 549 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5939  AMP-dependent synthetase and ligase  42.45 
 
 		 559 aa  382  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.812118  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2329  AMP-dependent synthetase and ligase  41.79 
 
 		 521 aa  378  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.247287  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4911  AMP-dependent synthetase and ligase  40.92 
 
 		 550 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2720  acyl-CoA synthetase  41.03 
 
 		 549 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120351  normal  0.897048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2139  AMP-dependent synthetase and ligase  40.64 
 
 		 510 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00340714  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6506  AMP-dependent synthetase and ligase  41.97 
 
 		 545 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00389964  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3250  AMP-dependent synthetase and ligase  41.2 
 
 		 545 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0550813  normal  0.598947 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4096  acyl-CoA synthetase  40.73 
 
 		 547 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3119  acyl-CoA synthetase  40.65 
 
 		 549 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186561  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0030  AMP-dependent synthetase and ligase  39.73 
 
 		 541 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4913  AMP-dependent synthetase and ligase  41.2 
 
 		 545 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3590  AMP-dependent synthetase and ligase  40.84 
 
 		 547 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2005  acyl-CoA synthetase  40.54 
 
 		 547 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0857661  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2483  AMP-dependent synthetase and ligase  39.54 
 
 		 548 aa  364  2e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3136  AMP-dependent synthetase and ligase  39.62 
 
 		 545 aa  363  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6221  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 		 550 aa  363  5.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4259  AMP-binding protein  39.81 
 
 		 541 aa  363  6e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3660  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.49 
 
 		 537 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00222723  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1291  AMP-dependent synthetase and ligase  40.75 
 
 		 550 aa  360  3e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0896483  normal  0.0414381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  41.06 
 
 		 542 aa  359  8e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.656252  hitchhiker  0.0000000000010579 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3649  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.3 
 
 		 537 aa  359  9e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3738  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.11 
 
 		 537 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739742  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  37.74 
 
 		 537 aa  356  5e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000368323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1579  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.11 
 
 		 537 aa  356  5e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000333435  normal  0.0479837 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6026  AMP-dependent synthetase and ligase  39.77 
 
 		 550 aa  356  5e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3421  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.11 
 
 		 537 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000306697  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3332  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.11 
 
 		 537 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000121528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3641  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.11 
 
 		 537 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3690  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.11 
 
 		 537 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281571  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5782  AMP-dependent synthetase and ligase  40.11 
 
 		 550 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3382  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.11 
 
 		 537 aa  355  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971977  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0063  AMP-dependent synthetase and ligase  41.3 
 
 		 550 aa  354  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.488746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2463  AMP-dependent synthetase and ligase  42.07 
 
 		 542 aa  354  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591871  normal  0.469505 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2273  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 533 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0159  AMP-dependent synthetase and ligase  40.6 
 
 		 544 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.109446  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2536  acyl-CoA synthetase  39.2 
 
 		 558 aa  352  7e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0019  acyl-CoA synthetase  40.8 
 
 		 544 aa  352  8.999999999999999e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0511  AMP-dependent synthetase and ligase  39.81 
 
 		 551 aa  352  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0799  putative acyl-CoA synthetase  37.55 
 
 		 546 aa  352  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0930157  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0024  acyl-CoA synthetase  40.8 
 
 		 544 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  38.06 
 
 		 549 aa  350  4e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4191  acyl-CoA synthetase  41.38 
 
 		 550 aa  349  8e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6109  AMP-dependent synthetase and ligase  41.78 
 
 		 558 aa  348  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.649133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3533  acyl-CoA synthetase  39.96 
 
 		 546 aa  347  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.8024  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5768  acyl-CoA synthetase  40.61 
 
 		 544 aa  348  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.915964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1565  AMP-dependent synthetase and ligase  39.2 
 
 		 543 aa  347  4e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0226  acyl-CoA synthetase  41.14 
 
 		 545 aa  346  5e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0683  AMP-dependent synthetase and ligase  39.85 
 
 		 550 aa  346  5e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000214245  normal  0.363431 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3713  acyl-CoA synthetase  41 
 
 		 550 aa  346  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1724  acyl-CoA synthetase  40.96 
 
 		 556 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0277595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5039  AMP-dependent synthetase and ligase  39.54 
 
 		 548 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.05602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4308  acyl-CoA synthetase  40.04 
 
 		 544 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.458975  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5439  medium-chain-fatty-acid-CoA ligase  37.24 
 
 		 545 aa  344  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2080  AMP-dependent synthetase and ligase  40.42 
 
 		 543 aa  343  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2076  AMP-dependent synthetase and ligase  38.43 
 
 		 556 aa  343  5e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0086171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5711  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.2 
 
 		 546 aa  343  5e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1570  acyl-CoA synthetase  41.71 
 
 		 549 aa  343  5.999999999999999e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3283  AMP-dependent synthetase and ligase  37.13 
 
 		 553 aa  342  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5421  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.01 
 
 		 546 aa  341  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4295  acyl-CoA synthetase  40.77 
 
 		 550 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3222  acyl-CoA synthetase  40.77 
 
 		 550 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.831142  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4071  acyl-CoA synthetase  40.77 
 
 		 550 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5332  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.01 
 
 		 546 aa  341  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.7188  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5172  AMP-dependent synthetase and ligase  35.82 
 
 		 549 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.569954  normal  0.858795 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  39.54 
 
 		 548 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  38.45 
 
 		 544 aa  340  2.9999999999999998e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1686  acyl-CoA synthetase  41.03 
 
 		 553 aa  339  9e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6424  AMP-dependent synthetase and ligase  41.68 
 
 		 551 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  37.2 
 
 		 544 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.513748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0180  AMP-dependent synthetase and ligase family protein  38.52 
 
 		 554 aa  338  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.115712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3306  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.21 
 
 		 545 aa  336  5e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135648  normal  0.0145757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>