More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3055 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3055  flagellar biosynthetic protein FlhF, putative  100 
 
 		 441 aa  880    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0427  GTP-binding signal recognition particle  76.84 
 
 		 452 aa  671    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4110  GTP-binding signal recognition particle  55.73 
 
 		 447 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.963643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3285  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  52.68 
 
 		 441 aa  430  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3445  GTP-binding signal recognition particle  48.99 
 
 		 446 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3766  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  47.68 
 
 		 468 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3850  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  48.23 
 
 		 481 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000866601 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0589  flagellar biosynthetic protein FlhF  37.98 
 
 		 437 aa  252  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1161  flagellar GTP-binding protein  37.8 
 
 		 419 aa  243  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4133  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  34 
 
 		 412 aa  211  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.535146  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2023  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.22 
 
 		 400 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2152  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  39.3 
 
 		 372 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1314  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  44.81 
 
 		 402 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0486  GTP-binding signal recognition particle  39.84 
 
 		 403 aa  196  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1139  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  44.5 
 
 		 626 aa  196  9e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2030  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  35.04 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0705  flagellar biosynthesis regulator FlhF  48.09 
 
 		 438 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0870  hypothetical protein  30.59 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1672  GTP-binding signal recognition particle  35.4 
 
 		 341 aa  183  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1747  flagellar biosynthesis regulator FlhF  45.88 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1485  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  47.62 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0791  flagellar biosynthesis regulator FlhF  46.11 
 
 		 392 aa  180  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1414  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  46.19 
 
 		 466 aa  179  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.37115 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2028  flagellar biosynthetic protein FlhF  45.45 
 
 		 350 aa  177  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2694  GTP-binding signal recognition particle  36.5 
 
 		 404 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16670  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  34.28 
 
 		 356 aa  171  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1364  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.46 
 
 		 458 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.789112  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1297  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.46 
 
 		 458 aa  170  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113598  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3212  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.8 
 
 		 458 aa  169  8e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2921  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.41 
 
 		 460 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2911  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.41 
 
 		 460 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3053  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.41 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.432908  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1452  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.41 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2157  flagellar biosynthesis regulator FlhF  47.09 
 
 		 393 aa  168  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1357  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.81 
 
 		 458 aa  169  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592498  normal  0.109972 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0061  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.13 
 
 		 484 aa  166  6.9999999999999995e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0102  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.13 
 
 		 484 aa  166  8e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1341  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.65 
 
 		 462 aa  166  9e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2282  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.57 
 
 		 463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.451131  normal  0.682206 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0233  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.03 
 
 		 461 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0983  GTP-binding signal recognition particle  45.74 
 
 		 466 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10552 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1197  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.38 
 
 		 461 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.13 
 
 		 460 aa  164  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.287894  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0074  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.94 
 
 		 481 aa  162  7e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1376  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.12 
 
 		 470 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597735  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1633  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.59 
 
 		 467 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0994643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1381  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.65 
 
 		 474 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.286129 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0293  flagellar biosynthetic protein FlhF  37.28 
 
 		 423 aa  160  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0113568  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3051  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.91 
 
 		 464 aa  160  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.03242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1517  flagellar biosynthesis regulator FlhF  44.44 
 
 		 513 aa  160  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1437  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.44 
 
 		 373 aa  159  6e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1650  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  34.82 
 
 		 399 aa  159  7e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000418792  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0479  GTP-binding signal recognition particle  44.62 
 
 		 585 aa  159  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.530078  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0020  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.79 
 
 		 378 aa  158  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000398912  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0020  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.79 
 
 		 378 aa  158  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1131  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.7 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0367  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.13 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0407274  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2686  flagellar biosynthetic protein FlhF  30.18 
 
 		 446 aa  157  5.0000000000000005e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303629  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2292  flagellar biosynthesis regulator FlhF  44.62 
 
 		 484 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1508  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.83 
 
 		 435 aa  156  6e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0367  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.65 
 
 		 458 aa  156  9e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00655433  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1411  flagellar biosynthetic protein FlhF  40.65 
 
 		 381 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002830  flagellar biosynthesis protein FlhF  44.74 
 
 		 505 aa  154  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00231681  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1656  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.02 
 
 		 495 aa  154  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000227361  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03146  flagellar biosynthesis regulator FlhF  44.74 
 
 		 503 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1357  GTP-binding signal recognition particle  41.06 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0276  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.57 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2500  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  41.55 
 
 		 382 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0691788  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2596  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  41.55 
 
 		 380 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2391  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.5 
 
 		 405 aa  149  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0703  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.27 
 
 		 362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1399  GTP-binding signal recognition particle  41.18 
 
 		 438 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.93 
 
 		 379 aa  143  8e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.93 
 
 		 379 aa  142  8e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5617  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.02 
 
 		 804 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51958  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0180  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  40.66 
 
 		 657 aa  142  9e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000220728  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0745  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.78 
 
 		 388 aa  141  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1946  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.86 
 
 		 536 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3700  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.33 
 
 		 825 aa  140  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.528557  normal  0.0206253 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1336  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  42.33 
 
 		 424 aa  139  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.550768  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1392  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.6 
 
 		 615 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.70556  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1977  GTP-binding signal recognition particle  41.11 
 
 		 437 aa  137  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0715  flagellar biosynthetic protein FlhF  42.37 
 
 		 485 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.858547  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2936  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.46 
 
 		 489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0148742  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0741  flagellar biosynthesis regulator FlhF  43.89 
 
 		 487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3842  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.33 
 
 		 583 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0061  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.33 
 
 		 583 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3923  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.33 
 
 		 583 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3168  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.73 
 
 		 577 aa  134  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0196  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.36 
 
 		 588 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.625172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0183  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.36 
 
 		 588 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27900  flagellar biosynthesis protein  39.25 
 
 		 758 aa  133  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0457594  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2845  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.33 
 
 		 374 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1697  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.33 
 
 		 374 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3421  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.33 
 
 		 374 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2807  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.11 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4068  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.67 
 
 		 632 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4180  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.67 
 
 		 632 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1864  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.46 
 
 		 542 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.625266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3429  GTP-binding signal recognition particle  37.57 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.911214  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>