More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1379 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  100 
 
 
143 aa  294  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  87.32 
 
 
143 aa  262  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  82.52 
 
 
143 aa  247  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  81.82 
 
 
153 aa  244  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  80.42 
 
 
143 aa  243  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  69.57 
 
 
147 aa  206  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  64.96 
 
 
146 aa  200  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  62.04 
 
 
143 aa  180  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  54.41 
 
 
148 aa  157  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3769  ferric uptake regulator, Fur family  52.11 
 
 
151 aa  154  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  49.63 
 
 
152 aa  154  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 
144 aa  153  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  53.03 
 
 
167 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  53.03 
 
 
167 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  53.03 
 
 
167 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3662  ferric uptake regulator, Fur family  50.7 
 
 
151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  53.03 
 
 
176 aa  147  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  47.83 
 
 
165 aa  140  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  45.52 
 
 
144 aa  133  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  44.06 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  43.07 
 
 
151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  44.53 
 
 
156 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  44.53 
 
 
146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  45.52 
 
 
154 aa  122  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  43.8 
 
 
155 aa  122  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  41.61 
 
 
154 aa  120  6e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  43.07 
 
 
155 aa  120  7e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  40.44 
 
 
157 aa  118  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  40.44 
 
 
157 aa  118  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  40.44 
 
 
157 aa  118  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  40.16 
 
 
143 aa  117  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  41.18 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  44.09 
 
 
144 aa  114  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  42.64 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  37.23 
 
 
155 aa  111  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
144 aa  110  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  37.8 
 
 
144 aa  110  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  37.8 
 
 
144 aa  110  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
144 aa  110  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  37.8 
 
 
142 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  37.8 
 
 
142 aa  110  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  37.01 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  37.01 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  37.01 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  43.41 
 
 
137 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  47.2 
 
 
155 aa  107  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  42.86 
 
 
138 aa  107  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  42.42 
 
 
138 aa  107  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  35.71 
 
 
159 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  36.3 
 
 
147 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0342  ferric uptake regulator family protein  36.69 
 
 
237 aa  105  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.087099  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0435  ferric uptake regulator  44.88 
 
 
135 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  37.23 
 
 
152 aa  105  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  35.34 
 
 
150 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0932  ferric uptake regulator family protein  45 
 
 
137 aa  104  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  44.63 
 
 
139 aa  104  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  36.64 
 
 
145 aa  104  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  39.23 
 
 
146 aa  104  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  37.23 
 
 
152 aa  104  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  41.09 
 
 
143 aa  104  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  44.53 
 
 
143 aa  102  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3924  ferric uptake regulator family protein  41.79 
 
 
149 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  44.63 
 
 
137 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3272  ferric uptake regulator, Fur family  41.79 
 
 
138 aa  102  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.710175  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6009  ferric uptake regulator family protein  42.42 
 
 
155 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  42.86 
 
 
143 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3615  ferric uptake regulator family protein  44.63 
 
 
168 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  44.96 
 
 
144 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  44.26 
 
 
138 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2986  ferric uptake regulator, Fur family  45.53 
 
 
143 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.105319  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2576  ferric uptake regulator, Fur family  45.53 
 
 
143 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.710249  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  39.39 
 
 
139 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2747  ferric uptake transcriptional repressor transcription regulator protein  45.53 
 
 
143 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  42.75 
 
 
151 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  43.33 
 
 
137 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  44.19 
 
 
144 aa  101  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  43.33 
 
 
137 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  42.97 
 
 
143 aa  100  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1084  ferric uptake regulator, Fur family  40.5 
 
 
144 aa  100  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.784641  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0021  ferric uptake regulator, Fur family  41.94 
 
 
142 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0033  ferric uptake regulator, Fur family  41.94 
 
 
142 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.968997  normal  0.145253 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  44.53 
 
 
143 aa  100  7e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  33.08 
 
 
150 aa  100  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3767  ferric uptake regulator family protein  39.53 
 
 
140 aa  100  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  41.41 
 
 
167 aa  100  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0013  ferric uptake regulator family protein  42.98 
 
 
135 aa  100  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00124444  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5530  ferric uptake regulator family protein  40.91 
 
 
146 aa  100  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  33.83 
 
 
139 aa  100  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  42.4 
 
 
137 aa  99.8  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  40.46 
 
 
151 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4555  ferric uptake regulator family protein  40.91 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0159  ferric uptake regulator, Fur family  37.59 
 
 
176 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  40.46 
 
 
151 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  41.13 
 
 
140 aa  98.6  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  42.97 
 
 
143 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  42.97 
 
 
143 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  44.35 
 
 
149 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>