More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0507 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0507  membrane protein  100 
 
 
194 aa  370  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  70.62 
 
 
195 aa  275  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3020  membrane protein  75.26 
 
 
194 aa  256  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000130394  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  68.39 
 
 
193 aa  250  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  66.84 
 
 
193 aa  246  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  63.92 
 
 
194 aa  234  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  63.59 
 
 
198 aa  220  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  57.14 
 
 
196 aa  199  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1223  protein of unknown function DUF205  48.7 
 
 
192 aa  162  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.165062  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.56 
 
 
200 aa  160  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  47.45 
 
 
198 aa  154  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  40.31 
 
 
195 aa  154  8e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3015  protein of unknown function DUF205  47.8 
 
 
203 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.400755  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1999  protein of unknown function DUF205  42.57 
 
 
207 aa  149  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000645882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  43.41 
 
 
200 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  46.94 
 
 
203 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0104  membrane protein  42.11 
 
 
223 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.97 
 
 
215 aa  142  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  41.75 
 
 
198 aa  141  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  44.33 
 
 
214 aa  140  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  41.24 
 
 
198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1078  hypothetical protein  43.65 
 
 
216 aa  139  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1944  membrane protein  42.93 
 
 
242 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2989  hypothetical protein  43.75 
 
 
198 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2827  protein of unknown function DUF205  42.93 
 
 
217 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3272  protein of unknown function DUF205  42.93 
 
 
217 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2329  hypothetical protein  43.16 
 
 
197 aa  137  7.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4194  membrane protein  44.04 
 
 
201 aa  137  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1700  protein of unknown function DUF205  40.76 
 
 
204 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.202165  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0040  hypothetical protein  41.97 
 
 
197 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  42.27 
 
 
200 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0473  hypothetical protein  50 
 
 
201 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537999  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5952  protein of unknown function DUF205  41.21 
 
 
216 aa  136  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1594  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.56 
 
 
212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22068  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  44.26 
 
 
198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  44.27 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2581  membrane protein  37.07 
 
 
235 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.9 
 
 
203 aa  135  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0729  protein of unknown function DUF205  41.95 
 
 
220 aa  134  7.000000000000001e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.382163  normal  0.327374 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.49 
 
 
201 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.04 
 
 
203 aa  132  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  44 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0829  protein of unknown function DUF205  39.25 
 
 
220 aa  132  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0178  membrane protein  44.16 
 
 
327 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.945445  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2009  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.6 
 
 
196 aa  130  9e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401567 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1111  hypothetical protein  43.01 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0575  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.51 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0813  membrane protein  39.01 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.979835  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1321  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.9 
 
 
194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2284  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.99 
 
 
198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.278877  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0517  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.31 
 
 
202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0870487  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3809  hypothetical protein  44.33 
 
 
203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2175  membrane protein  38.1 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0155  protein of unknown function DUF205  43.01 
 
 
208 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.337449 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2417  membrane protein  36.17 
 
 
235 aa  129  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3380  membrane protein  40.41 
 
 
195 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000102812  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2113  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.93 
 
 
199 aa  129  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1643  protein of unknown function DUF205  46.81 
 
 
212 aa  128  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.17 
 
 
196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2058  membrane protein  36.8 
 
 
235 aa  128  6e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1851  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.74 
 
 
226 aa  128  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4339  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.21 
 
 
196 aa  127  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0924  membrane protein  40.11 
 
 
205 aa  127  7.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0172  membrane protein  41.03 
 
 
200 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4349  membrane protein  46.11 
 
 
201 aa  127  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2389  hypothetical protein  38.3 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000658646  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0125  protein of unknown function DUF205  46.39 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.765264  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  40.68 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0125  hypothetical protein  46.39 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2521  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.15 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.635021 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1323  hypothetical membrane spanning protein  42.16 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.143303  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2695  hypothetical protein  40.51 
 
 
224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4024  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.8 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1382  hypothetical protein  42.16 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1072  hypothetical protein  45.08 
 
 
198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.205087  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0724  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.5 
 
 
189 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1616  hypothetical protein  38.71 
 
 
202 aa  125  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0796  protein of unknown function DUF205  40.1 
 
 
214 aa  125  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348496  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4637  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.27 
 
 
192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.481632 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0221  hypothetical protein  43.75 
 
 
210 aa  124  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1811  hypothetical protein  41.45 
 
 
209 aa  124  7e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000443893  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2829  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40 
 
 
204 aa  124  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000278679  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2443  membrane protein  34.76 
 
 
235 aa  124  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2025  membrane protein  36.09 
 
 
234 aa  124  9e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3314  hypothetical protein  46.45 
 
 
202 aa  124  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1757  protein of unknown function DUF205  41.92 
 
 
198 aa  124  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07580  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.97 
 
 
189 aa  124  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0346741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1199  protein of unknown function DUF205  38.38 
 
 
215 aa  123  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5145  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.43 
 
 
189 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05631  membrane protein  39.8 
 
 
205 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2260  hypothetical protein  39.6 
 
 
226 aa  122  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2816  membrane protein  36.09 
 
 
235 aa  123  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4413  hypothetical protein  41.62 
 
 
204 aa  123  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3514  protein of unknown function DUF205  45.9 
 
 
202 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14881  membrane protein  36.6 
 
 
198 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3637  protein of unknown function DUF205  45.9 
 
 
202 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.646526 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3361  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.45 
 
 
198 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000818594  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0601  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.86 
 
 
201 aa  121  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4789  hypothetical protein  40.8 
 
 
226 aa  121  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.994064 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1269  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  40 
 
 
231 aa  121  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.747048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>