More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0147 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  100 
 
 
338 aa  684  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  97.34 
 
 
338 aa  640  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  9.9426e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  83.43 
 
 
338 aa  555  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  76.63 
 
 
338 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  77.22 
 
 
338 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.12232e-08  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  70.12 
 
 
338 aa  458  1e-128  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  68.34 
 
 
338 aa  445  1e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  60.12 
 
 
426 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  2.64035e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  60.91 
 
 
356 aa  358  8e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.92 
 
 
417 aa  336  3e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  55.06 
 
 
353 aa  329  4e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  56.85 
 
 
432 aa  327  1e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  54.94 
 
 
346 aa  326  3e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.75 
 
 
336 aa  321  1e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  54.17 
 
 
428 aa  320  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  54.35 
 
 
423 aa  319  5e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  55.06 
 
 
428 aa  319  5e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  54.43 
 
 
387 aa  319  5e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  53.57 
 
 
427 aa  317  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  54.17 
 
 
428 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  54.17 
 
 
428 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  53.87 
 
 
428 aa  316  4e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  53.87 
 
 
428 aa  316  4e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  53.87 
 
 
428 aa  316  4e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  53.87 
 
 
428 aa  316  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  53.87 
 
 
428 aa  316  4e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  53.27 
 
 
428 aa  315  1e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  53.87 
 
 
428 aa  313  2e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.11 
 
 
482 aa  314  2e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  7.15993e-05  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  53.29 
 
 
419 aa  313  3e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.82 
 
 
425 aa  309  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.12054e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  53.71 
 
 
354 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  53.71 
 
 
354 aa  308  6e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  54.21 
 
 
450 aa  308  1e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  52.73 
 
 
430 aa  308  1e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  52.73 
 
 
430 aa  308  1e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.55 
 
 
425 aa  308  1e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  53.58 
 
 
424 aa  308  1e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  52.96 
 
 
427 aa  307  2e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  1.27765e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  53.68 
 
 
435 aa  306  4e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  53.68 
 
 
435 aa  306  4e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  53.41 
 
 
354 aa  306  4e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.73 
 
 
463 aa  306  4e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.02 
 
 
464 aa  304  1e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.47894e-05  hitchhiker  3.62877e-14 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  53.94 
 
 
347 aa  303  2e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  50.92 
 
 
341 aa  301  8e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.9 
 
 
369 aa  301  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.63 
 
 
333 aa  300  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.6 
 
 
458 aa  300  3e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  50.61 
 
 
341 aa  299  4e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  53.54 
 
 
454 aa  299  4e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  51.06 
 
 
370 aa  298  8e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.06 
 
 
517 aa  297  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.65 
 
 
452 aa  298  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  50.15 
 
 
430 aa  297  1e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  4.54316e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  51.98 
 
 
345 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  55.05 
 
 
348 aa  297  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  52.15 
 
 
372 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.23 
 
 
429 aa  297  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  52.45 
 
 
428 aa  296  3e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  52.45 
 
 
428 aa  296  3e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.39 
 
 
438 aa  296  3e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.77499e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  50.46 
 
 
408 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  54.27 
 
 
423 aa  296  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  52.15 
 
 
373 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  52.15 
 
 
373 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  52.13 
 
 
358 aa  296  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  50.46 
 
 
408 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  52.15 
 
 
372 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  52.15 
 
 
372 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  52.15 
 
 
372 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  52.15 
 
 
372 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  52.15 
 
 
372 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  52.15 
 
 
372 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  51.84 
 
 
372 aa  295  6e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.86 
 
 
434 aa  295  7e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  50.15 
 
 
408 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  52.42 
 
 
357 aa  294  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  52.15 
 
 
370 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5258  GTPase ObgE  50.78 
 
 
541 aa  294  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  50.61 
 
 
422 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2056  GTPase ObgE  51.06 
 
 
366 aa  294  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.520405  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  52.92 
 
 
358 aa  294  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  51.38 
 
 
370 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.98 
 
 
334 aa  294  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  50.61 
 
 
365 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  52.31 
 
 
493 aa  293  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  50.92 
 
 
365 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  51.34 
 
 
394 aa  293  4e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  51.21 
 
 
379 aa  293  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  51.34 
 
 
439 aa  292  5e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  51.66 
 
 
353 aa  292  7e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  51.82 
 
 
355 aa  291  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  49.85 
 
 
408 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.68 
 
 
464 aa  291  1e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  1.09453e-12 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.11 
 
 
491 aa  291  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  51.5 
 
 
337 aa  290  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  51.82 
 
 
345 aa  290  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  1.69157e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.94 
 
 
505 aa  290  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.52 
 
 
371 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>