104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0084 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0084  protein of unknown function DUF480  100 
 
 
215 aa  427  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.39751e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0102  protein of unknown function DUF480  95.35 
 
 
215 aa  411  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.09835e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0277  hypothetical protein  62.56 
 
 
219 aa  249  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.521102  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2903  hypothetical protein  57.73 
 
 
219 aa  242  2e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.159439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0233  hypothetical protein  59.82 
 
 
219 aa  239  3e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.363081  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0262  hypothetical protein  57.08 
 
 
219 aa  236  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.404279  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3445  hypothetical protein  54.34 
 
 
219 aa  229  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00496877  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0194  protein of unknown function DUF480  47.11 
 
 
226 aa  198  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3645  hypothetical protein  51.21 
 
 
214 aa  192  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.784319  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3715  hypothetical protein  50.47 
 
 
230 aa  191  7e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0176  protein of unknown function DUF480  44.89 
 
 
226 aa  186  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12356e-11 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3509  protein of unknown function DUF480  47.2 
 
 
225 aa  185  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05349  hypothetical protein  48.84 
 
 
217 aa  185  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000539  hypothetical protein  46.51 
 
 
216 aa  175  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.755702  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2066  hypothetical protein  46.92 
 
 
222 aa  173  2e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124636 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1804  hypothetical protein  45.54 
 
 
211 aa  171  7e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817852  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1581  hypothetical protein  47.17 
 
 
216 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1622  hypothetical protein  46.19 
 
 
218 aa  170  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.138254 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1644  hypothetical protein  44.83 
 
 
221 aa  169  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1629  hypothetical protein  45.41 
 
 
222 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.039164 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1265  hypothetical protein  45.97 
 
 
215 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.143853 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1280  hypothetical protein  45.97 
 
 
215 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.48257 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2020  hypothetical protein  45.97 
 
 
215 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2204  hypothetical protein  45.97 
 
 
215 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0185732 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1554  hypothetical protein  44.91 
 
 
222 aa  168  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1236  hypothetical protein  45.97 
 
 
215 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.159536 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0605  hypothetical protein  43.06 
 
 
221 aa  167  9e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.209579  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1867  hypothetical protein  45.7 
 
 
222 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1905  hypothetical protein  46.01 
 
 
215 aa  166  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0011352  hitchhiker  0.00151074 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3392  hypothetical protein  46.86 
 
 
225 aa  166  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.473482 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2274  hypothetical protein  43.93 
 
 
214 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1190  hypothetical protein  44.5 
 
 
215 aa  166  3e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1190  hypothetical protein  44.5 
 
 
215 aa  166  3e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2533  hypothetical protein  44.5 
 
 
215 aa  166  3e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.477556  normal  0.117101 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2579  protein of unknown function DUF480  44.5 
 
 
215 aa  166  3e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2062  hypothetical protein  44.5 
 
 
215 aa  166  3e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.174673 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01071  hypothetical protein  44.5 
 
 
215 aa  166  3e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01063  hypothetical protein  44.5 
 
 
215 aa  166  3e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2730  protein of unknown function DUF480  46.38 
 
 
225 aa  165  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.395206  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2520  protein of unknown function DUF480  44.2 
 
 
223 aa  165  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.60784  normal  0.805512 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1765  hypothetical protein  44.2 
 
 
223 aa  164  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.76394  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2055  hypothetical protein  43.66 
 
 
219 aa  164  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0305732  normal  0.0543921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1802  hypothetical protein  44.2 
 
 
223 aa  164  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.694493 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2259  hypothetical protein  44.5 
 
 
215 aa  164  1e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1446  hypothetical protein  44.02 
 
 
215 aa  163  2e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585817  hitchhiker  0.00180396 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2081  hypothetical protein  43.4 
 
 
212 aa  163  2e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.781105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2482  hypothetical protein  46.63 
 
 
216 aa  162  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256196  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1696  hypothetical protein  42.65 
 
 
217 aa  162  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2048  hypothetical protein  49.15 
 
 
233 aa  162  4e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2178  hypothetical protein  42.47 
 
 
215 aa  161  8e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1758  hypothetical protein  43.75 
 
 
223 aa  161  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0676  multidrug resistance protein A  43.44 
 
 
216 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.545698  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1967  hypothetical protein  44.23 
 
 
210 aa  159  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.465185  normal  0.175017 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1617  hypothetical protein  46.41 
 
 
215 aa  159  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.397537  normal  0.0239474 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5328  protein of unknown function DUF480  51.85 
 
 
287 aa  159  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2794  hypothetical protein  46.41 
 
 
214 aa  157  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.127586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4077  protein of unknown function DUF480  45.97 
 
 
228 aa  156  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2611  hypothetical protein  40.72 
 
 
221 aa  154  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0461289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2078  protein of unknown function DUF480  43.06 
 
 
215 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.424148  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2426  hypothetical protein  42.79 
 
 
223 aa  153  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.374899  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2469  hypothetical protein  45.15 
 
 
213 aa  151  6e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.964701  normal  0.69032 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3509  hypothetical protein  42.33 
 
 
218 aa  151  6e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.688553 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1161  hypothetical protein  39.83 
 
 
230 aa  151  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0106  hypothetical protein  40.95 
 
 
221 aa  151  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1449  hypothetical protein  48.48 
 
 
233 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2282  hypothetical protein  41.67 
 
 
243 aa  149  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.102117  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3231  hypothetical protein  43.5 
 
 
235 aa  147  1e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.373258 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3844  hypothetical protein  41.15 
 
 
236 aa  146  2e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.368568  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2516  hypothetical protein  43.13 
 
 
205 aa  145  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.338314 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1648  hypothetical protein  42.65 
 
 
228 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0405293  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5373  hypothetical protein  40.89 
 
 
240 aa  142  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3438  hypothetical protein  46.63 
 
 
232 aa  142  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.333291 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2686  hypothetical protein  42.79 
 
 
221 aa  140  1e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4618  hypothetical protein  43.41 
 
 
236 aa  139  4e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685823  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3711  hypothetical protein  40.95 
 
 
216 aa  138  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0081  hypothetical protein  43.84 
 
 
235 aa  138  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1958  hypothetical protein  43.33 
 
 
255 aa  138  8e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473189  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5439  hypothetical protein  43.35 
 
 
236 aa  137  9e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.118943  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1866  hypothetical protein  43.33 
 
 
234 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.409237  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5610  hypothetical protein  42.93 
 
 
297 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.260426 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0399  hypothetical protein  43.33 
 
 
297 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0052  protein of unknown function DUF480  39.71 
 
 
216 aa  136  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.102804  normal  0.491736 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5265  protein of unknown function DUF480  47.56 
 
 
234 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.534627  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2419  hypothetical protein  40.57 
 
 
224 aa  135  7e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3223  hypothetical protein  41.23 
 
 
220 aa  134  1e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2442  hypothetical protein  39.34 
 
 
215 aa  134  2e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3531  hypothetical protein  38.86 
 
 
215 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0125316  normal  0.0563858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3184  hypothetical protein  37.14 
 
 
215 aa  132  4e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5360  hypothetical protein  43.94 
 
 
234 aa  132  4e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434043  normal  0.525827 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4889  hypothetical protein  41.87 
 
 
236 aa  131  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.022245 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3697  hypothetical protein  47.5 
 
 
243 aa  131  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0217939 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2102  hypothetical protein  37.8 
 
 
240 aa  130  1e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.59809  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0990  hypothetical protein  45.78 
 
 
234 aa  130  1e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2627  hypothetical protein  40.95 
 
 
216 aa  128  7e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04790  hypothetical protein  41.55 
 
 
223 aa  128  8e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.02558  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3252  hypothetical protein  40.91 
 
 
214 aa  128  8e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1356  hypothetical protein  47.56 
 
 
236 aa  127  1e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0108358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19450  hypothetical protein  40.85 
 
 
221 aa  126  2e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1674  hypothetical protein  40.38 
 
 
221 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164971  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4455  hypothetical protein  46.58 
 
 
234 aa  121  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>