More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6454 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  63.37 
 
 
631 aa  791    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
705 aa  1358    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  55.17 
 
 
534 aa  271  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  51.21 
 
 
703 aa  263  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  54.76 
 
 
468 aa  254  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  50.74 
 
 
525 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  52.29 
 
 
596 aa  249  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  52.78 
 
 
776 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  51.91 
 
 
419 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  54.72 
 
 
528 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  50.57 
 
 
675 aa  242  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2069  serine/threonine protein kinase  50.74 
 
 
501 aa  241  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.832371  normal  0.49505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  47.62 
 
 
418 aa  240  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  50.79 
 
 
446 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  48.61 
 
 
659 aa  239  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  50.57 
 
 
460 aa  238  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  50.38 
 
 
632 aa  238  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  51.15 
 
 
766 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  50 
 
 
678 aa  235  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  52.47 
 
 
411 aa  234  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.28 
 
 
521 aa  231  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  47.78 
 
 
674 aa  230  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2136  serine/threonine protein kinase  51.39 
 
 
660 aa  230  7e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701308  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  48.47 
 
 
422 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  48.29 
 
 
487 aa  227  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  50.38 
 
 
468 aa  226  8e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  50.38 
 
 
668 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.53 
 
 
659 aa  224  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  45.33 
 
 
525 aa  221  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
461 aa  219  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  46.64 
 
 
595 aa  218  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
503 aa  217  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2140  serine/threonine protein kinase  49.64 
 
 
532 aa  216  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  45.82 
 
 
543 aa  216  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  46.18 
 
 
501 aa  216  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  46.42 
 
 
470 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  49.01 
 
 
535 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0726  serine/threonine protein kinase  49.24 
 
 
556 aa  215  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3969  serine/threonine protein kinase  52.36 
 
 
575 aa  212  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  45.28 
 
 
509 aa  212  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.86 
 
 
531 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6521  serine/threonine protein kinase  48.05 
 
 
553 aa  210  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  52.11 
 
 
621 aa  209  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  52.11 
 
 
638 aa  208  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  48.5 
 
 
563 aa  207  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  42.61 
 
 
562 aa  207  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  47.62 
 
 
855 aa  206  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  45.66 
 
 
695 aa  206  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2134  serine/threonine protein kinase  46.27 
 
 
564 aa  206  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26171  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  47.2 
 
 
377 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  46.1 
 
 
605 aa  206  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  44.87 
 
 
493 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  44 
 
 
554 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  42.14 
 
 
575 aa  200  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  48.81 
 
 
674 aa  200  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05660  serine/threonine protein kinase  45.39 
 
 
419 aa  195  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  46.18 
 
 
1029 aa  194  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  44.81 
 
 
493 aa  193  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5900  serine/threonine protein kinase  48.47 
 
 
476 aa  192  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377642  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0144  serine/threonine protein kinase  47.39 
 
 
650 aa  191  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  43.49 
 
 
466 aa  190  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  50.7 
 
 
507 aa  190  9e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16830  serine/threonine protein kinase  45.05 
 
 
559 aa  190  9e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.753908  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.82 
 
 
532 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  47.39 
 
 
391 aa  187  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  45.06 
 
 
571 aa  187  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  46.64 
 
 
617 aa  187  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  44.24 
 
 
345 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3106  serine/threonine protein kinase  51.7 
 
 
538 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  46.04 
 
 
583 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  40.96 
 
 
385 aa  182  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  43.51 
 
 
673 aa  181  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1744  Serine/threonine protein kinase-related protein  40.97 
 
 
405 aa  180  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.679027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5882  serine/threonine protein kinase  41.79 
 
 
296 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0086799  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  44.52 
 
 
581 aa  171  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.44 
 
 
512 aa  170  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5881  serine/threonine protein kinase  45 
 
 
264 aa  168  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00553777  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1248  serine/threonine protein kinase  39.41 
 
 
543 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.987546  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1978  protein kinase  44.44 
 
 
482 aa  165  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1137  serine/threonine protein kinase  45.21 
 
 
962 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3516  serine/threonine protein kinase  40.23 
 
 
481 aa  162  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  37.36 
 
 
612 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.43 
 
 
747 aa  159  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  38.95 
 
 
721 aa  157  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.69 
 
 
650 aa  157  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  39.45 
 
 
596 aa  154  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  37.55 
 
 
425 aa  152  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  41.22 
 
 
1655 aa  152  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5247  serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 
498 aa  152  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592329 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  36.76 
 
 
457 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  37.6 
 
 
557 aa  148  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  41.22 
 
 
468 aa  147  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3705  protein kinase  39.08 
 
 
449 aa  147  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.424517  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  38.08 
 
 
666 aa  147  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  36.51 
 
 
646 aa  145  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  41.86 
 
 
636 aa  144  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  33.02 
 
 
692 aa  144  6e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3561  serine/threonine protein kinase  36.3 
 
 
585 aa  144  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326118  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.74 
 
 
642 aa  144  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.83 
 
 
658 aa  143  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>