More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4612 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  100 
 
 
340 aa  687    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  67.67 
 
 
345 aa  463  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  66.37 
 
 
343 aa  449  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  66.67 
 
 
343 aa  432  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0266  aldo/keto reductase  65.2 
 
 
344 aa  427  1e-118  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  62.28 
 
 
349 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  58.82 
 
 
343 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  61.81 
 
 
344 aa  419  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  60.12 
 
 
341 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  61.47 
 
 
341 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  64.09 
 
 
342 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  62.46 
 
 
368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  60.98 
 
 
345 aa  404  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  58.24 
 
 
339 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  56.36 
 
 
348 aa  382  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  60.29 
 
 
341 aa  381  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  55.52 
 
 
349 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  54.71 
 
 
339 aa  364  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  54.71 
 
 
339 aa  364  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  54.71 
 
 
339 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  55.46 
 
 
344 aa  351  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  54.3 
 
 
339 aa  349  3e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  54.89 
 
 
344 aa  348  7e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3948  aldo/keto reductase  52.84 
 
 
357 aa  339  5e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0477  aldo/keto reductase  51.88 
 
 
348 aa  331  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  51.24 
 
 
333 aa  300  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  50.93 
 
 
333 aa  296  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  46.3 
 
 
341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1898  aldo/keto reductase  46.58 
 
 
332 aa  261  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116625 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  45.77 
 
 
327 aa  259  6e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  46.39 
 
 
352 aa  256  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  41.98 
 
 
325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  43.24 
 
 
337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  46.18 
 
 
313 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  46.32 
 
 
335 aa  250  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  44.97 
 
 
338 aa  250  3e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  45.71 
 
 
313 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0520  aldo/keto reductase  43.37 
 
 
335 aa  249  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  43.64 
 
 
334 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  45.11 
 
 
313 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2297  aldo/keto reductase  42.3 
 
 
339 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0919281  normal  0.745376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1656  aldo/keto reductase  46.25 
 
 
328 aa  245  9e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.702563 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  41.99 
 
 
339 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  45.57 
 
 
313 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  44.06 
 
 
350 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  46.3 
 
 
346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  43.03 
 
 
337 aa  242  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  44.1 
 
 
332 aa  241  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  42.46 
 
 
335 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  43.71 
 
 
337 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5053  aldo/keto reductase  43.41 
 
 
335 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  45.64 
 
 
336 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  46.46 
 
 
325 aa  239  6.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  43.17 
 
 
343 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.49 
 
 
335 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  41.86 
 
 
333 aa  238  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0471  aldo/keto reductase  40.3 
 
 
337 aa  238  1e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00023215  normal  0.05091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  41.62 
 
 
329 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0430  aldo/keto reductase  40.74 
 
 
326 aa  237  2e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.542765  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  41.1 
 
 
334 aa  237  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4528  aldo/keto reductase  42.81 
 
 
335 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.153462  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  43.56 
 
 
326 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  41.77 
 
 
322 aa  236  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  43.12 
 
 
349 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  42.64 
 
 
326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  44.51 
 
 
330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5659  aldo/keto reductase  40.18 
 
 
353 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184034  normal  0.516333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  43.29 
 
 
343 aa  235  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3890  aldo/keto reductase  43.04 
 
 
319 aa  235  6e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872462  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3286  aldo/keto reductase  44.48 
 
 
323 aa  236  6e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  43.49 
 
 
332 aa  235  7e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  41.72 
 
 
334 aa  235  7e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1746  putative oxidoreductase  45.83 
 
 
327 aa  235  7e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0734648  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  43.56 
 
 
317 aa  235  8e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3544  aldo/keto reductase  42.95 
 
 
326 aa  235  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.889794  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
331 aa  235  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2362  aldo/keto reductase  41.67 
 
 
324 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.167956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  41.98 
 
 
326 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  42.68 
 
 
343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1578  aldo/keto reductase  47.81 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0491792  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1464  aldo/keto reductase  42.19 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000207795  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  42.28 
 
 
358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4717  aldo/keto reductase  42.46 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0823  aldo/keto reductase  45.34 
 
 
322 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  41.14 
 
 
352 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  41.95 
 
 
349 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7188  aldo/keto reductase  40.79 
 
 
349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  42.11 
 
 
328 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  43.43 
 
 
326 aa  233  5e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
338 aa  233  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  41.98 
 
 
349 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  42.24 
 
 
343 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  41.98 
 
 
349 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  41.69 
 
 
349 aa  232  7.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  42.15 
 
 
326 aa  232  8.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  40.74 
 
 
351 aa  232  8.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0927  aldo/keto reductase  43.41 
 
 
342 aa  232  9e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320709  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  41.98 
 
 
349 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  40.19 
 
 
315 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0434  aldo/keto reductase  43.52 
 
 
323 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>