16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0080 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0080  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  247  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  48.44 
 
 
477 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  51.56 
 
 
379 aa  60.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  51.67 
 
 
377 aa  60.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  39.34 
 
 
305 aa  53.5  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  45.9 
 
 
416 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  41.27 
 
 
363 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  31.33 
 
 
400 aa  50.8  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  35.06 
 
 
379 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  35.06 
 
 
379 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  35 
 
 
392 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  35.71 
 
 
387 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  31 
 
 
416 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  33.93 
 
 
414 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  38.24 
 
 
463 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  41.51 
 
 
374 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>