54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2907 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2907  SpoOM  100 
 
 		 259 aa  515  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2305  SpoOM family protein  87.26 
 
 		 259 aa  458  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.983136  normal  0.530714 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2353  SpoOM family protein  58.69 
 
 		 259 aa  295  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174228  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0063  SpoOM family protein  57.36 
 
 		 259 aa  277  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.656988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1589  SpoOM family protein  48.75 
 
 		 317 aa  236  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.724743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1549  SpoOM family protein  49.17 
 
 		 316 aa  234  9e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0376095  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1597  SpoOM family protein  45.98 
 
 		 261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3762  SpoOM family protein  44.36 
 
 		 376 aa  215  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.548375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2980  putative SpoOM-related protein  43.24 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.771223 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1250  hypothetical protein  46.67 
 
 		 324 aa  211  9e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2575  SpoOM family protein  45.8 
 
 		 261 aa  210  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0270  SpoOM family protein  42.91 
 
 		 262 aa  210  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4556  SpoOM family protein  42.47 
 
 		 330 aa  199  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20360  sporulation control protein  43.53 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5804  Sporulation control protein-like protein  45.11 
 
 		 323 aa  191  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0466499  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0951  SpoOM family protein  41.7 
 
 		 397 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.779484  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4403  SpoOM family protein  40.54 
 
 		 256 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0409  SpoOM family protein  41.41 
 
 		 335 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311537  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4400  SpoOM family protein  39.26 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4399  SpoOM family protein  37.74 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1370  SpoOM family protein  35.22 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1506  SpoOM family protein  34.87 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118009  hitchhiker  0.00241219 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003718  putative SpoOM-related protein  32.93 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02077  hypothetical protein  33.48 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1761  putative sporulation-control protein  32.05 
 
 		 248 aa  125  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0034341  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1236  SpoOM family protein  31.97 
 
 		 254 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3153  SpoOM family protein  31.1 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0145478  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1411  SpoOM family protein  33.33 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.271045 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1337  SpoOM family protein  35.97 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3034  putative sporulation-control protein Spo0M  29.51 
 
 		 251 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2289  putative sporulation-control protein Spo0M  29.8 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1458  SpoOM family protein  31.02 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2125  SpoOM family protein  29.6 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.359088  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2662  SpoOM family protein  31.67 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2729  SpoOM family protein  31.67 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.863876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2416  putative sporulation-control protein Spo0M  29.39 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2836  SpoOM family protein  31.67 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2091  sporulation-control protein  28.98 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00354659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2087  sporulation-control protein  28.98 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2153  sporulation-control protein Spo0M  29.15 
 
 		 252 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0500171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2308  sporulation-control protein Spo0M  29.15 
 
 		 252 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2333  putative sporulation-control protein Spo0M  28.57 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2848  SpoOM-related protein  27.73 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0048  putative sporulation-control protein  30.12 
 
 		 261 aa  99  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0812821  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2480  SpoOM-related protein  29.63 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00398  sporulation control protein  29.74 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1070  SpoOM family protein  30.62 
 
 		 327 aa  92.8  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002050  putative transcriptional regulator  29.22 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3245  SpoOM family protein  28.64 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0420  SpoOM family protein  26.36 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0185  SpoOM family protein  26.98 
 
 		 318 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1266  SpoOM family protein  31.91 
 
 		 132 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000350591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2148  SpoOM family protein  30.56 
 
 		 133 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0764  hypothetical protein  34.02 
 
 		 228 aa  48.9  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>