More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1666 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1666  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  294  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.470727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2091  hypothetical protein  91.59 
 
 		 123 aa  202  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2448  hypothetical protein  81.13 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0276111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3304  hypothetical protein  81.37 
 
 		 140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2504  protein of unknown function DUF59  75.86 
 
 		 135 aa  171  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3077  hypothetical protein  81.19 
 
 		 138 aa  170  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.214528  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16180  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  64.14 
 
 		 134 aa  170  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2388  protein of unknown function DUF59  70.73 
 
 		 134 aa  169  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2914  protein of unknown function DUF59  72.17 
 
 		 117 aa  167  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2269  protein of unknown function DUF59  77.57 
 
 		 107 aa  164  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.787383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2070  protein of unknown function DUF59  75 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5148  protein of unknown function DUF59  71.19 
 
 		 131 aa  160  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657235  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1140  hypothetical protein  75.24 
 
 		 103 aa  159  9e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0364796 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2957  protein of unknown function DUF59  70.8 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2556  hypothetical protein  70.94 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1677  protein of unknown function DUF59  68.91 
 
 		 117 aa  157  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  70.09 
 
 		 117 aa  156  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11494  hypothetical protein  77.36 
 
 		 115 aa  154  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144171  normal  0.147777 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1146  protein of unknown function DUF59  72.12 
 
 		 109 aa  152  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1363  protein of unknown function DUF59  67.59 
 
 		 111 aa  152  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3672  hypothetical protein  67.23 
 
 		 119 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2477  hypothetical protein  72.64 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.628405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2441  hypothetical protein  72.64 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.310856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2486  hypothetical protein  72.64 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.357516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2334  protein of unknown function DUF59  70.19 
 
 		 143 aa  150  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.633871 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13400  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  70.48 
 
 		 108 aa  150  7e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0107382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2738  hypothetical protein  71.7 
 
 		 115 aa  149  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5981  metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  68.81 
 
 		 121 aa  148  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579625  normal  0.0823678 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2281  protein of unknown function DUF59  68.52 
 
 		 142 aa  147  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000601574  hitchhiker  0.00785585 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21890  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  68.32 
 
 		 121 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.904123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1981  hypothetical protein  66.67 
 
 		 120 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1966  hypothetical protein  64.04 
 
 		 136 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2107  hypothetical protein  61.9 
 
 		 110 aa  141  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521729  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11520  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  62.75 
 
 		 108 aa  140  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0389496  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14660  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  63.79 
 
 		 110 aa  140  9e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1849  protein of unknown function DUF59  58.72 
 
 		 110 aa  138  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125685 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0388  hypothetical protein  51.96 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.793437 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0601  putative metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  50.48 
 
 		 197 aa  107  6e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  44.64 
 
 		 118 aa  100  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  43.4 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  40.74 
 
 		 112 aa  89.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  40.78 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  47.47 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  42.86 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  46.67 
 
 		 238 aa  80.5  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  38.46 
 
 		 99 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0248  hypothetical protein  41.59 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1812  mrp protein  42.31 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0588494  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  37.76 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  42.06 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  42.06 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  44.21 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  40.22 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  42.55 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  42.55 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  36.63 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  42.55 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  42.55 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  42.55 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  42.55 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  37.62 
 
 		 113 aa  76.6  0.00000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0632  hypothetical protein  42.55 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.534801  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  36.75 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  42.2 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  41.12 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  38.78 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  41.05 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  37.25 
 
 		 200 aa  74.3  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  33.66 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2832  protein of unknown function DUF59  39.18 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  40.78 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  41.84 
 
 		 100 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1220  serine O-acetyltransferase  39.58 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  34.78 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  35.11 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  40.62 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  36.07 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  40.66 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  40.62 
 
 		 102 aa  72  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  38.95 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0327  hypothetical protein  41.05 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1389  protein of unknown function DUF59  39.6 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4281  hypothetical protein  38.14 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4725  hypothetical protein  36.13 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  37.89 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  37.76 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  36.73 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  35.64 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  36.08 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  36.08 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  34.75 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0453  serine O-acetyltransferase  41.41 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  36.73 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  38.71 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  36.84 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  32.85 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  37.5 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2885  protein of unknown function DUF59  36.63 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  36.54 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>