187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0016 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0016  acyltransferase 3  100 
 
 
515 aa  1013  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0330  acyltransferase 3  39.12 
 
 
397 aa  193  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.278208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3031  acyltransferase 3  35.03 
 
 
438 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3492  acyltransferase 3  30.96 
 
 
531 aa  130  5e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  31.74 
 
 
403 aa  103  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0251  acyltransferase 3  28.4 
 
 
394 aa  94  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  29.37 
 
 
403 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0420  acyltransferase 3  28.9 
 
 
401 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.58013  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0212  acyltransferase 3  29.37 
 
 
392 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.748195  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0232  acyltransferase 3  29.85 
 
 
392 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182056  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0222  acyltransferase 3  29.85 
 
 
392 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  27.79 
 
 
587 aa  84.3  4e-15  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1295  acyltransferase 3  39.6 
 
 
423 aa  83.6  7e-15  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.973222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1475  acyltransferase-like protein  28.4 
 
 
415 aa  82.8  1e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.536378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1056  acyltransferase 3  29.52 
 
 
561 aa  82  2e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10230  integral membrane acyltransferase  28.57 
 
 
407 aa  75.1  3e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.92754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  28.57 
 
 
665 aa  73.9  6e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3990  cyclic nucleotide-binding protein  29.46 
 
 
413 aa  73.2  1e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153067  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0809  acyltransferase 3  27.82 
 
 
434 aa  73.2  1e-11  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71976  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6951  acyltransferase-like protein  24.83 
 
 
435 aa  73.2  1e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  26.96 
 
 
684 aa  72  2e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1249  acyltransferase 3  28.81 
 
 
404 aa  72.4  2e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2458  putative acyltransferase  27.03 
 
 
424 aa  72.8  2e-11  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2226  acyltransferase 3  28.46 
 
 
396 aa  72.4  2e-11  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0267  acyltransferase 3  30.54 
 
 
439 aa  71.2  4e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0298  acyltransferase 3  30.22 
 
 
376 aa  70.9  5e-11  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1222  acyltransferase 3  27.81 
 
 
396 aa  70.5  7e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.821157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1239  acyltransferase 3  27.81 
 
 
396 aa  70.5  7e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.934207  normal  0.635143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4285  acyltransferase 3  28.96 
 
 
421 aa  69.3  2e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.186313 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4078  acyltransferase 3  30.15 
 
 
378 aa  68.9  2e-10  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4469  acyltransferase 3  27.81 
 
 
387 aa  68.2  4e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.551657 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  25.13 
 
 
690 aa  67.8  5e-10  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  22.89 
 
 
583 aa  65.9  2e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  25.99 
 
 
662 aa  65.5  3e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  28.95 
 
 
667 aa  65.5  3e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  26.97 
 
 
690 aa  65.1  3e-09  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  25.19 
 
 
354 aa  64.3  5e-09  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  26.76 
 
 
642 aa  63.5  8e-09  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  21.59 
 
 
603 aa  63.5  9e-09  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  29.55 
 
 
630 aa  62.8  1e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  27.27 
 
 
647 aa  62.8  2e-08  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2831  acyltransferase 3  25.43 
 
 
401 aa  62.4  2e-08  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  26.05 
 
 
695 aa  62.4  2e-08  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  25.93 
 
 
651 aa  62.4  2e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  27.27 
 
 
629 aa  61.6  3e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  27.14 
 
 
715 aa  61.6  3e-08  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  24.17 
 
 
656 aa  61.2  4e-08  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  25.14 
 
 
377 aa  61.2  4e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  25.87 
 
 
679 aa  60.8  5e-08  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  27.4 
 
 
396 aa  60.8  6e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  25.68 
 
 
695 aa  60.5  7e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  26.6 
 
 
710 aa  60.1  9e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  26.6 
 
 
710 aa  60.1  9e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  26.33 
 
 
645 aa  60.1  1e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  26.11 
 
 
634 aa  59.7  1e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0417  acyltransferase 3  28.54 
 
 
404 aa  58.2  3e-07  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0124  acyltransferase 3  26.84 
 
 
393 aa  58.2  4e-07  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  23.87 
 
 
643 aa  58.2  4e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0988  hypothetical protein  26.09 
 
 
359 aa  57.8  5e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152683  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0893  acyltransferase family protein  29.87 
 
 
378 aa  57.8  5e-07  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0030172  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  26.2 
 
 
632 aa  57.8  5e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4040  acyltransferase 3  27.38 
 
 
387 aa  57.4  6e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3966  acyltransferase 3  27.38 
 
 
387 aa  57.4  6e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3980  acyltransferase 3  27.38 
 
 
387 aa  57.4  7e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0204358  normal  0.0459477 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  23.31 
 
 
660 aa  57  8e-07  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4464  acyltransferase 3  33.55 
 
 
404 aa  56.6  9e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.578108  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  24.63 
 
 
658 aa  56.2  1e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  25.71 
 
 
636 aa  55.5  2e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  24.87 
 
 
607 aa  55.8  2e-06  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  25.8 
 
 
671 aa  55.1  3e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  26.18 
 
 
673 aa  55.1  3e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  23.24 
 
 
629 aa  55.1  3e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  25.27 
 
 
356 aa  55.1  3e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  23.04 
 
 
598 aa  54.7  4e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  26.13 
 
 
354 aa  54.7  4e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  26.89 
 
 
379 aa  54.7  4e-06  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  24.85 
 
 
640 aa  54.7  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  24.63 
 
 
656 aa  54.3  5e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  24.93 
 
 
690 aa  54.3  5e-06  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2821  acyltransferase 3  26.23 
 
 
728 aa  54.3  6e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  26.49 
 
 
662 aa  53.9  7e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11280  acyltransferase  26.71 
 
 
383 aa  53.5  9e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.795947  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  24.87 
 
 
377 aa  53.1  1e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  23.41 
 
 
683 aa  53.1  1e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  25.68 
 
 
435 aa  52.8  1e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0431  acyltransferase 3  27.9 
 
 
357 aa  53.1  1e-05  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0932564  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  24.46 
 
 
716 aa  53.5  1e-05  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  24.24 
 
 
395 aa  52  2e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  26.32 
 
 
681 aa  52.4  2e-05  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  26.23 
 
 
671 aa  52  2e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3768  acyltransferase 3  25.43 
 
 
675 aa  52.4  2e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0162791 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  20.9 
 
 
603 aa  51.6  3e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  20.9 
 
 
603 aa  51.6  3e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10660  predicted acyltransferase  28.17 
 
 
710 aa  52  3e-05  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.307211  normal  0.545399 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  32.63 
 
 
688 aa  52  3e-05  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  26.75 
 
 
629 aa  51.2  4e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4745  acyltransferase 3  28.64 
 
 
398 aa  50.8  5e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0151092  normal  0.0124888 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  23.68 
 
 
604 aa  50.8  6e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  23.68 
 
 
604 aa  50.8  6e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  23.65 
 
 
734 aa  50.4  8e-05  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>