292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1339 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1339  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 129 aa  259  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1906  preprotein translocase, YajC subunit  64.29 
 
 		 116 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0068  preprotein translocase, YajC subunit  56.03 
 
 		 116 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.95541  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0068  preprotein translocase, YajC subunit  56.9 
 
 		 116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  41.98 
 
 		 109 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  46.34 
 
 		 109 aa  83.6  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  38.54 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0391  preprotein translocase, YajC subunit  43.37 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000430502  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  39.6 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  41.3 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  40.96 
 
 		 93 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  43.37 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  36.17 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  37.38 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  38.89 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  34.29 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  41.11 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  39.13 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  37.89 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  39.22 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  38.2 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  34 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  36.11 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  36.11 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0629  preprotein translocase subunit YajC  41.18 
 
 		 90 aa  72  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  40.96 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  40.96 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  35.92 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1237  preprotein translocase subunit YajC  41.18 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.371648  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  39.74 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  30.48 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  35.48 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  40.96 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  39.08 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1112  preprotein translocase subunit YajC  41.18 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  35.19 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  35.19 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  35.19 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  32.26 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  35.92 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  35.19 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  36.63 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  32.26 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  32.26 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  32.26 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  32.26 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  36.63 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  32.26 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  32.26 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  36.59 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  35.16 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  38.55 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  31.18 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  36.05 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  32.04 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  32.04 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  32.04 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  32.04 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  34.09 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  32.04 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  32.04 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  32.04 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  32.04 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  36.46 
 
 		 103 aa  70.1  0.000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  31.58 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  36.25 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  36.25 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  38.64 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  34.21 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  37.35 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3122  preprotein translocase subunit YajC  33.01 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00795341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3383  preprotein translocase subunit YajC  33.01 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000227784  normal  0.514524 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0452  preprotein translocase subunit YajC  32.04 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.654019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  36.05 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3263  preprotein translocase subunit YajC  33.01 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000145315  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  38.64 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0506  preprotein translocase subunit YajC  32.04 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0445  preprotein translocase subunit YajC  32.04 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  34.41 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  45.07 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1117  preprotein translocase, YajC subunit  41.28 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.876099  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  32.04 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  38.64 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0446  preprotein translocase subunit YajC  32.04 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0326  preprotein translocase subunit YajC  31.07 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  28.57 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  37.35 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  37.8 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>