More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2367 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2367  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  100 
 
 
372 aa  748    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153158  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  58.31 
 
 
357 aa  388  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0638959  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10708  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  47.14 
 
 
378 aa  309  4e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11224  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1854  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  47.98 
 
 
376 aa  303  2.0000000000000002e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  48.16 
 
 
310 aa  287  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  47.55 
 
 
310 aa  272  6e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  45.76 
 
 
310 aa  271  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2391  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  46.69 
 
 
322 aa  237  3e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1482  peptidylprolyl isomerase  49.17 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  52.98 
 
 
164 aa  164  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4444  peptidylprolyl isomerase  50.88 
 
 
175 aa  160  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0124  peptidylprolyl isomerase  50.88 
 
 
175 aa  159  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671624  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3069  peptidylprolyl isomerase  51.48 
 
 
174 aa  159  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00667109  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0518  Peptidylprolyl isomerase  50.69 
 
 
172 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1136  Peptidylprolyl isomerase  51.92 
 
 
161 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2561  peptidylprolyl isomerase  57.14 
 
 
176 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  50.99 
 
 
164 aa  152  7e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0486  peptidylprolyl isomerase  48.8 
 
 
164 aa  152  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2820  peptidylprolyl isomerase  61.07 
 
 
206 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400749  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3601  Peptidylprolyl isomerase  49.38 
 
 
241 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.840173  hitchhiker  0.00334322 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5243  Peptidylprolyl isomerase  51.2 
 
 
174 aa  149  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0323546  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2912  Peptidylprolyl isomerase  49.31 
 
 
172 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1936  hypothetical protein  53.16 
 
 
188 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0949  Peptidylprolyl isomerase  57.33 
 
 
197 aa  146  7.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.436598  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  50 
 
 
201 aa  145  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00512404  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00710  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  57.58 
 
 
176 aa  145  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1946  hypothetical protein  56.03 
 
 
188 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1652  peptidylprolyl isomerase  55.21 
 
 
168 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0817  peptidylprolyl isomerase  52.05 
 
 
181 aa  143  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104667  normal  0.714543 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2219  peptidylprolyl isomerase  43.59 
 
 
254 aa  142  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0017  peptidylprolyl isomerase  48.21 
 
 
187 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6492  Peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
287 aa  142  9e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2580  peptidylprolyl isomerase  53.47 
 
 
266 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0028  Peptidylprolyl isomerase  53.42 
 
 
177 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1026  Peptidylprolyl isomerase  54.43 
 
 
167 aa  140  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0789  Peptidylprolyl isomerase  50.33 
 
 
163 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.191731  normal  0.0671641 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2294  Peptidylprolyl isomerase  54.66 
 
 
168 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0333378  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1485  peptidylprolyl isomerase  51.32 
 
 
141 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2206  Peptidylprolyl isomerase  54.66 
 
 
168 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2157  peptidylprolyl isomerase  53.37 
 
 
168 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0018  Peptidylprolyl isomerase  49.69 
 
 
179 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0105  Peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
178 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268329  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0893  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  51.97 
 
 
178 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0013  Peptidylprolyl isomerase  45.81 
 
 
181 aa  134  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000477678 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3780  Peptidylprolyl isomerase  52.73 
 
 
228 aa  133  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3720  peptidylprolyl isomerase  53.75 
 
 
163 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.392854  normal  0.0282412 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1859  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  45.64 
 
 
197 aa  132  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000317427  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0729  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  56.38 
 
 
167 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  47.9 
 
 
629 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  47.17 
 
 
202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308143  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2216  peptidylprolyl isomerase  43.86 
 
 
254 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000598862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0012  peptidylprolyl isomerase  46.37 
 
 
181 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00130  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  47.34 
 
 
179 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  48.59 
 
 
174 aa  130  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00260  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  51.18 
 
 
182 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.06558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3653  Peptidylprolyl isomerase  46 
 
 
247 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000157501  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  49.65 
 
 
657 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0013  Peptidylprolyl isomerase  49.7 
 
 
182 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0059  peptidylprolyl isomerase  43.86 
 
 
176 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.958253  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3544  peptidylprolyl isomerase  52.5 
 
 
163 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0928419  normal  0.154699 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0019  Peptidylprolyl isomerase  45.76 
 
 
173 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567765  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14660  predicted protein  49.29 
 
 
178 aa  127  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14434  predicted protein  37.14 
 
 
533 aa  127  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191518  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1591  Peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
179 aa  126  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0105  Peptidylprolyl isomerase  52.17 
 
 
172 aa  126  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1396  peptidylprolyl isomerase  46.98 
 
 
141 aa  126  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1004  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  43.53 
 
 
195 aa  126  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00627317  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0010  peptidylprolyl isomerase  56.03 
 
 
175 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0017  peptidylprolyl isomerase  55.86 
 
 
170 aa  126  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0498338  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0018  peptidylprolyl isomerase  56.03 
 
 
175 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0010  peptidylprolyl isomerase  56.03 
 
 
175 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0068  Peptidylprolyl isomerase  52.32 
 
 
178 aa  125  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0109  Peptidylprolyl isomerase  48.82 
 
 
182 aa  126  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0070  peptidylprolyl isomerase  49.66 
 
 
194 aa  125  9e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1769  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  46.71 
 
 
141 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.995524  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10009  iron-regulated peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase A ppiA  56.82 
 
 
182 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0504  peptidylprolyl isomerase  50.7 
 
 
181 aa  125  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0057  Peptidylprolyl isomerase  48.82 
 
 
176 aa  124  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40159  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  46.81 
 
 
629 aa  123  5e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1981  Peptidylprolyl isomerase  49.29 
 
 
222 aa  122  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0045  Peptidylprolyl isomerase  43.88 
 
 
193 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0011  Peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
179 aa  122  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0022  Peptidylprolyl isomerase  52.94 
 
 
177 aa  122  9e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.721658  normal  0.0469829 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38525  predicted protein  40.46 
 
 
665 aa  119  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1534  peptidylprolyl isomerase  42.55 
 
 
197 aa  119  7e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.861621  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4996  peptidylprolyl isomerase  44.57 
 
 
176 aa  119  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120878  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23164  predicted protein  52.55 
 
 
489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.137553  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1711  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  43.6 
 
 
195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.756281  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06894  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 2 (PPIase)(Rotamase)(EC 5.2.1.8)(Cyclophilin-60)(Cyclophilin-like protein Cyp-60) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXT6]  50.38 
 
 
580 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.242482 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00200  conserved hypothetical protein  44.97 
 
 
573 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0125915  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  46.81 
 
 
571 aa  117  3.9999999999999997e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0294  Peptidylprolyl isomerase  47.62 
 
 
170 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0164  Peptidylprolyl isomerase  51.57 
 
 
179 aa  116  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0891  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  43.51 
 
 
164 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1255  peptidylprolyl isomerase  44.37 
 
 
174 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43430  predicted protein  45.99 
 
 
184 aa  116  6.9999999999999995e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00586531  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4201  peptidylprolyl isomerase  47.93 
 
 
171 aa  116  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.231436  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1165  peptidylprolyl isomerase  45.59 
 
 
156 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0022  Peptidylprolyl isomerase  55.71 
 
 
177 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.424958  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-binding  43.62 
 
 
143 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00742073  normal  0.1669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>