More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0019 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  99.58 
 
 
238 aa  484  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
238 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
238 aa  486  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4192  GntR family transcriptional regulator  99.58 
 
 
238 aa  483  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
238 aa  486  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
238 aa  486  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  99.16 
 
 
238 aa  482  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  78.39 
 
 
248 aa  394  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
239 aa  178  7e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
232 aa  177  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
232 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  36.73 
 
 
235 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 
237 aa  134  1e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  31.25 
 
 
240 aa  130  2e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  31.25 
 
 
240 aa  130  2e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  31.25 
 
 
240 aa  130  2e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  31.25 
 
 
240 aa  130  2e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  31.25 
 
 
240 aa  130  2e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 
240 aa  130  2e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  31.25 
 
 
240 aa  129  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 
243 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 
237 aa  122  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
243 aa  118  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
243 aa  118  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
243 aa  118  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
243 aa  118  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
248 aa  117  1e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
249 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.27927e-05  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 
249 aa  115  8e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 
249 aa  114  2e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
243 aa  114  2e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
256 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 
247 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 
256 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 
256 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 
261 aa  111  1e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 
261 aa  111  1e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
225 aa  111  1e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 
248 aa  109  4e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
256 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
256 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 
258 aa  108  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 
260 aa  108  7e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
256 aa  108  8e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
238 aa  107  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  1.3898e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
233 aa  105  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0191  transcriptional regulator  30.14 
 
 
241 aa  105  6e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.168496 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
238 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  28.31 
 
 
239 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  2.22084e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 
244 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 
239 aa  103  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  26.41 
 
 
240 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3424  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
245 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014089  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  26.41 
 
 
240 aa  101  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3183  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
245 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.529781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3424  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 
245 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3111  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
245 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3204  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
245 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264865  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
236 aa  100  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3458  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
245 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 
247 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
263 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  1.97182e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 
245 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 
244 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3436  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 
245 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3412  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 
245 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.44012e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
245 aa  99.8  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  27.36 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 
195 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 
252 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  6.5866e-05  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  30.11 
 
 
195 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  30.11 
 
 
195 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  28.91 
 
 
244 aa  96.7  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2301  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
242 aa  95.5  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1687  GntR family transcriptional regulator  23.87 
 
 
243 aa  95.5  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 
242 aa  95.5  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0054  transcriptional regulator, GntR family  29.71 
 
 
242 aa  95.1  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  24.66 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  24.66 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  24.66 
 
 
265 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  24.66 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  24.66 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  24.66 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  24.66 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  24.66 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1435  transcriptional regulator  25.85 
 
 
244 aa  93.6  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.851115  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4840  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 
270 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  25.34 
 
 
242 aa  93.2  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
241 aa  93.2  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
241 aa  92.8  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  26.4 
 
 
233 aa  92.8  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  25.44 
 
 
242 aa  92  7e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
241 aa  92  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0213  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  28.5 
 
 
244 aa  91.7  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4033  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  28.5 
 
 
244 aa  91.7  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  26.79 
 
 
243 aa  91.7  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 
232 aa  91.7  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>