54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00956 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.76204e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  99.45 
 
 
187 aa  366  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.40203e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  99.45 
 
 
187 aa  366  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  2.51515e-06  hitchhiker  2.97897e-06 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  99.45 
 
 
187 aa  366  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.85697e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  4.61465e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  99.45 
 
 
187 aa  366  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.27636e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  98.9 
 
 
187 aa  364  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  98.9 
 
 
187 aa  364  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  4.2581e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  97.8 
 
 
187 aa  360  5e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.82452e-07  normal  0.394753 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  83.52 
 
 
187 aa  315  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  83.52 
 
 
187 aa  315  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  83.52 
 
 
187 aa  315  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  83.52 
 
 
187 aa  315  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.48477e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  82.97 
 
 
187 aa  313  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  77.05 
 
 
188 aa  288  3e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.57242e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  61.02 
 
 
185 aa  218  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  3.70009e-07 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1991  putative lipoprotein  58.38 
 
 
192 aa  218  5e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2548  putative lipoprotein  57.84 
 
 
192 aa  215  3e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00417943  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2637  hypothetical protein  57.84 
 
 
192 aa  215  3e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.2573  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  58.05 
 
 
182 aa  208  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  58.05 
 
 
182 aa  208  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2068  protein of unknown function DUF330  57.87 
 
 
188 aa  204  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  54.7 
 
 
188 aa  197  8e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  48.86 
 
 
186 aa  158  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1653  protein of unknown function DUF330  45.93 
 
 
185 aa  140  1e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  82  5e-15  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2112  hypothetical protein  34.24 
 
 
197 aa  80.5  1e-14  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.178277  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  34.5 
 
 
189 aa  77.8  7e-14  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1866  hypothetical protein  35.12 
 
 
197 aa  77.8  8e-14  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  33.9 
 
 
199 aa  77.8  8e-14  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2009  hypothetical protein  28.65 
 
 
221 aa  77.4  1e-13  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  32.02 
 
 
192 aa  75.5  4e-13  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02657  hypothetical protein  26.59 
 
 
202 aa  74.3  9e-13  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2931  hypothetical protein  27.87 
 
 
198 aa  58.2  6e-08  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2075  hypothetical protein  26.82 
 
 
191 aa  55.1  6e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00929812  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1353  putative lipoprotein  29.88 
 
 
192 aa  54.7  7e-07  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  1.61061e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  22.7 
 
 
195 aa  53.5  2e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  25.55 
 
 
241 aa  53.5  2e-06  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  28.37 
 
 
197 aa  52.4  4e-06  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  25.17 
 
 
241 aa  52.4  4e-06  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  26.2 
 
 
201 aa  49.7  3e-05  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  24.71 
 
 
212 aa  48.5  5e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  24.46 
 
 
203 aa  47.8  9e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  28.03 
 
 
201 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  28.36 
 
 
208 aa  47  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  33.33 
 
 
222 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  26.56 
 
 
204 aa  45.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  32.22 
 
 
222 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3078  putative lipoprotein  26.78 
 
 
186 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  27.5 
 
 
194 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  26.87 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  25.74 
 
 
200 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  28.17 
 
 
212 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  24.46 
 
 
211 aa  41.6  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>