More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2522 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2522  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
221 aa  441  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000136868  normal  0.0316786 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1541  TrkA-N domain protein  76.96 
 
 
221 aa  338  4e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0566  potassium uptake protein TrkA, putative  65.9 
 
 
218 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0630  TrkA-N domain protein  51.58 
 
 
219 aa  227  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.208337  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1353  TrkA-N domain protein  49.07 
 
 
217 aa  206  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1793  TrkA-N domain protein  42.25 
 
 
220 aa  188  6e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  37.16 
 
 
220 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  35.07 
 
 
221 aa  140  1e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  35.45 
 
 
221 aa  140  2e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  35.45 
 
 
221 aa  140  2e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  35.45 
 
 
221 aa  140  2e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  35.45 
 
 
221 aa  140  2e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  35.45 
 
 
221 aa  140  2e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  35.45 
 
 
221 aa  140  2e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  35.45 
 
 
221 aa  140  2e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  35.45 
 
 
221 aa  140  2e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  35.45 
 
 
221 aa  140  2e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  35.45 
 
 
221 aa  140  2e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  34.6 
 
 
221 aa  138  5e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  35 
 
 
221 aa  137  9e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  3.38081e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  34.72 
 
 
227 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  33.8 
 
 
218 aa  135  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  35.51 
 
 
215 aa  134  7e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  2.26197e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  33.49 
 
 
231 aa  135  7e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  34.42 
 
 
220 aa  134  1e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  32.09 
 
 
232 aa  134  1e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  34.42 
 
 
220 aa  134  1e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  34.42 
 
 
219 aa  133  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01407  hypothetical protein  33.02 
 
 
220 aa  133  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  32.23 
 
 
215 aa  132  4e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004055  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  33.02 
 
 
220 aa  132  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248543  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  34.88 
 
 
231 aa  130  1e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4804  TrkA-N  36.11 
 
 
231 aa  130  2e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  31.75 
 
 
217 aa  129  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  32.72 
 
 
220 aa  127  2e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.00527e-08  hitchhiker  1.67844e-14 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 
223 aa  126  2e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  37.13 
 
 
219 aa  126  2e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0443  TrkA domain-containing protein  38.6 
 
 
222 aa  125  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103493 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  35.65 
 
 
222 aa  125  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  33.02 
 
 
220 aa  125  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  35.65 
 
 
222 aa  125  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  33.96 
 
 
221 aa  124  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0214  TrkA-N  35.78 
 
 
224 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0372  TrkA domain-containing protein  37.98 
 
 
222 aa  122  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.849541  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  30.92 
 
 
218 aa  121  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  32.08 
 
 
233 aa  121  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0728  TrkA-N domain protein  32.72 
 
 
221 aa  121  1e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.439731  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  33.49 
 
 
229 aa  120  2e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  33.49 
 
 
229 aa  120  2e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  34.13 
 
 
223 aa  120  2e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  33.65 
 
 
224 aa  119  4e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0428  TrkA-N domain protein  36.57 
 
 
225 aa  119  5e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  32.24 
 
 
217 aa  119  5e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.38787e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  35.07 
 
 
218 aa  118  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  36.27 
 
 
224 aa  118  8e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  36.02 
 
 
223 aa  117  2e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  35.96 
 
 
224 aa  116  2e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1557  TrkA domain-containing protein  31.34 
 
 
222 aa  117  2e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.176981  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  30.88 
 
 
217 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18040  K+ transport system, NAD-binding component  36.46 
 
 
225 aa  115  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  34.43 
 
 
222 aa  114  1e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
224 aa  113  2e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2747  TrkA-N domain protein  33.17 
 
 
235 aa  114  2e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0359063  hitchhiker  7.19315e-05 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24350  K+ transport system, NAD-binding component  35.89 
 
 
221 aa  113  2e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2828  TrkA-N domain protein  31.94 
 
 
250 aa  113  2e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3145  TrkA-N domain protein  32.69 
 
 
228 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.436065 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  29.95 
 
 
219 aa  112  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3347  TrkA domain-containing protein  32.69 
 
 
228 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3574  TrkA domain-containing protein  32.68 
 
 
230 aa  112  4e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.458769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  35.07 
 
 
224 aa  112  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0505  TrkA-N domain protein  33.97 
 
 
254 aa  111  8e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0590826 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0055  TrkA domain-containing protein  39.29 
 
 
232 aa  110  1e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  8.27601e-06 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  31.25 
 
 
221 aa  111  1e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0050  TrkA domain-containing protein  39.29 
 
 
232 aa  110  2e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  34.43 
 
 
222 aa  110  2e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0058  potassium uptake protein, putative  36.53 
 
 
232 aa  109  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06980  K+ transport system, NAD-binding component  32.21 
 
 
232 aa  108  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6144  TrkA-N  35.24 
 
 
220 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674267  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0054  TrkA-N domain protein  31.14 
 
 
232 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4304  TrkA domain-containing protein  31.14 
 
 
232 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.333456  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0375  K+ transporter  37.76 
 
 
220 aa  107  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.506643  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  33.81 
 
 
220 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  29.19 
 
 
217 aa  106  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.30553e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  33.65 
 
 
213 aa  106  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  29.58 
 
 
216 aa  106  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1392  TrkA-N domain protein  28.83 
 
 
227 aa  105  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643107  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0952  TrkA-N domain protein  30.43 
 
 
217 aa  105  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3270  TrkA-N domain protein  35.15 
 
 
230 aa  105  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0050  TrkA domain-containing protein  37.14 
 
 
232 aa  104  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0058  TrkA domain-containing protein  37.14 
 
 
232 aa  104  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.70567e-07 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4480  TrkA domain-containing protein  38.57 
 
 
217 aa  104  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.27966e-09 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0052  TrkA domain-containing protein  37.14 
 
 
232 aa  104  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  1.56349e-06 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0459  TrkA-N domain protein  33.5 
 
 
231 aa  104  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.821137  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0047  TrkA domain-containing protein  36.43 
 
 
232 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0750  TrkA domain-containing protein  39.16 
 
 
217 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.803573  normal  0.253071 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0529  hypothetical protein  28.91 
 
 
217 aa  103  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  28.3 
 
 
217 aa  103  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001288  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  37.14 
 
 
217 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.91889  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0796  Trk-type K+ transport systems membrane component  30.43 
 
 
220 aa  102  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14840  K+ transport system, NAD-binding component  30.19 
 
 
229 aa  102  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.289305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>