More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1650 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 127 aa  255  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  78.74 
 
 		 127 aa  203  6e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  69.29 
 
 		 127 aa  181  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0787  glycine cleavage system H protein  61.29 
 
 		 128 aa  167  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1107  glycine cleavage system H protein  63.96 
 
 		 126 aa  154  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  58.62 
 
 		 125 aa  153  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  55.91 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 127 aa  150  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 127 aa  150  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 127 aa  150  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 127 aa  150  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 127 aa  150  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 127 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 127 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  57.72 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 127 aa  149  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  56.91 
 
 		 127 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  52.42 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  60.48 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  56.69 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  54.4 
 
 		 125 aa  143  8.000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  57.14 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  53.54 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  56.67 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  57.52 
 
 		 129 aa  138  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0177  glycine cleavage system protein H  56.49 
 
 		 129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  47.62 
 
 		 129 aa  137  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  55.12 
 
 		 129 aa  137  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  55.12 
 
 		 129 aa  137  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  55.12 
 
 		 129 aa  137  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  55.12 
 
 		 129 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  55.12 
 
 		 129 aa  137  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  55.12 
 
 		 129 aa  137  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  55.12 
 
 		 129 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  55.12 
 
 		 129 aa  137  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  55.12 
 
 		 129 aa  137  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  55.12 
 
 		 129 aa  137  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  55.12 
 
 		 129 aa  137  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  55.12 
 
 		 129 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  52.8 
 
 		 126 aa  137  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  55.12 
 
 		 129 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  55.12 
 
 		 129 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 126 aa  136  7.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 128 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  133  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 127 aa  133  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 128 aa  133  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 128 aa  133  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  50.4 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  54.55 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  54.69 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  49.61 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  57.55 
 
 		 127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 136 aa  130  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  53.17 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0030  glycine cleavage system protein H  53.77 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166486  normal  0.0193025 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0213  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 129 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12390  glycine cleavage system H protein  51.22 
 
 		 123 aa  130  6.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00556536  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  52.85 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  52.5 
 
 		 128 aa  127  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 		 128 aa  127  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  52.14 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 		 128 aa  127  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  52.14 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 		 128 aa  127  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0907  glycine cleavage H-protein  49.61 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  52.68 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  53.54 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  55.83 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  51.85 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  55.83 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  55.83 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 130 aa  127  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  49.61 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  46.28 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 		 129 aa  125  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  49.6 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  46.88 
 
 		 131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>