25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0086 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0086  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  361  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.176439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2504  hypothetical protein  39.18 
 
 		 178 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2422  hypothetical protein  41.18 
 
 		 159 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3998  hypothetical protein  41.18 
 
 		 159 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00055728  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0905  hypothetical protein  39.53 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0333285  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1923  hypothetical protein  39.53 
 
 		 160 aa  99  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00139334  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3788  ERCC4 domain-containing protein  39.53 
 
 		 160 aa  99  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4379  ERCC4  33.77 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03490  hypothetical protein  28.12 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  29.41 
 
 		 749 aa  53.9  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0877  ERCC4 domain-containing protein  34.26 
 
 		 246 aa  48.1  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0376  ERCC4 domain-containing protein  27.55 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5359  cyclic nucleotide-binding protein  33.87 
 
 		 321 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0363  ERCC4 domain-containing protein  27.55 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  33.88 
 
 		 829 aa  46.2  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  25.45 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.76 
 
 		 756 aa  45.4  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  33.06 
 
 		 820 aa  45.1  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5189  ERCC4 domain-containing protein  35.4 
 
 		 325 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0365  ERCC4 domain-containing protein  25 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12549  hypothetical protein  27.27 
 
 		 463 aa  42.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0306994 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  27.85 
 
 		 836 aa  42.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  26.53 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0083  ERCC4 domain-containing protein  28.57 
 
 		 230 aa  41.2  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.131653  hitchhiker  0.0000430873 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  29.52 
 
 		 833 aa  41.2  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>