More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2919 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  100 
 
 		 186 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  81.72 
 
 		 186 aa  315  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  76.34 
 
 		 186 aa  300  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  76.63 
 
 		 184 aa  296  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  67.39 
 
 		 184 aa  264  5e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  65.76 
 
 		 184 aa  264  5.999999999999999e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  60.77 
 
 		 185 aa  237  8e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  60.44 
 
 		 185 aa  236  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  60.77 
 
 		 185 aa  236  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  60.77 
 
 		 185 aa  236  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  60.77 
 
 		 185 aa  236  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  60.44 
 
 		 185 aa  236  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  60.77 
 
 		 185 aa  235  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  60.77 
 
 		 185 aa  235  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  60.22 
 
 		 185 aa  235  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  60.22 
 
 		 185 aa  235  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  60.33 
 
 		 185 aa  231  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  57.46 
 
 		 185 aa  230  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  58.06 
 
 		 186 aa  229  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  56.35 
 
 		 185 aa  221  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  59.12 
 
 		 185 aa  219  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  55.98 
 
 		 185 aa  219  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  58.47 
 
 		 185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  54.7 
 
 		 185 aa  217  7e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  58.05 
 
 		 185 aa  217  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  54.64 
 
 		 185 aa  216  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  55.98 
 
 		 186 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  54.35 
 
 		 185 aa  214  4e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  53.26 
 
 		 185 aa  214  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  58.99 
 
 		 182 aa  213  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  53.26 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  53.8 
 
 		 185 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  57.46 
 
 		 185 aa  211  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1557  ribosome recycling factor  55.98 
 
 		 185 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135969  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  51.61 
 
 		 186 aa  211  5.999999999999999e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  57.3 
 
 		 185 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  57.47 
 
 		 185 aa  211  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  54.24 
 
 		 184 aa  210  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  54.35 
 
 		 186 aa  211  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  56.52 
 
 		 185 aa  210  9e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  57.47 
 
 		 185 aa  210  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1275  ribosome recycling factor  53.26 
 
 		 185 aa  210  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00110727  normal  0.535196 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1252  ribosome recycling factor  57.07 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.538826  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  59.2 
 
 		 174 aa  209  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  54.35 
 
 		 186 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1351  ribosome recycling factor  57.07 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717676  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  57.46 
 
 		 185 aa  208  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  51.91 
 
 		 187 aa  208  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0356  ribosome recycling factor  55.49 
 
 		 173 aa  208  4e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0472189  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  52.17 
 
 		 184 aa  208  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  57.07 
 
 		 185 aa  207  5e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  56.82 
 
 		 186 aa  207  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  55.98 
 
 		 184 aa  207  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 185 aa  207  7e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  52.17 
 
 		 185 aa  207  7e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 185 aa  207  8e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  53.8 
 
 		 186 aa  206  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  52.72 
 
 		 184 aa  206  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  56.32 
 
 		 186 aa  206  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  53.93 
 
 		 185 aa  207  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  56.82 
 
 		 186 aa  206  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00170  ribosome releasing factor  60.67 
 
 		 185 aa  205  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148385  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3431  ribosome recycling factor  60.67 
 
 		 185 aa  205  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510427  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  55.43 
 
 		 185 aa  205  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0174  ribosome recycling factor  60.67 
 
 		 185 aa  205  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00802553  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0165  ribosome recycling factor  60.67 
 
 		 185 aa  205  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000948857  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  55.43 
 
 		 185 aa  205  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0183  ribosome recycling factor  60.67 
 
 		 185 aa  205  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.07548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1484  ribosome recycling factor  55.43 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000709639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00169  hypothetical protein  60.67 
 
 		 185 aa  205  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160878  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0176  ribosome recycling factor  60.67 
 
 		 185 aa  205  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000066149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0182  ribosome recycling factor  60.67 
 
 		 185 aa  205  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000723298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  55.43 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3488  ribosome recycling factor  60.67 
 
 		 185 aa  205  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730416  normal  0.367592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3158  ribosome recycling factor  57.87 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000691666  normal  0.144971 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  54.35 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1273  ribosome recycling factor  54.89 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235676  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1016  ribosome recycling factor  55.98 
 
 		 185 aa  204  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3432  ribosome recycling factor  55.98 
 
 		 185 aa  204  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000874312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1069  ribosome recycling factor  55.98 
 
 		 185 aa  204  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00702897  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  51.63 
 
 		 184 aa  204  5e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  57.3 
 
 		 185 aa  204  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01376  ribosome recycling factor  55.43 
 
 		 185 aa  204  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0186665  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  58.01 
 
 		 184 aa  204  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  56.74 
 
 		 185 aa  204  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  57.87 
 
 		 185 aa  204  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  58.43 
 
 		 185 aa  204  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  57.3 
 
 		 185 aa  204  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  57.14 
 
 		 185 aa  204  7e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2632  ribosome recycling factor  56.74 
 
 		 185 aa  204  8e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000751677  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2638  ribosome recycling factor  56.74 
 
 		 185 aa  204  8e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000456907  normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2705  ribosome recycling factor  56.74 
 
 		 185 aa  204  8e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000841959  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 192 aa  204  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  54.6 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  54.6 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0241  ribosome recycling factor  59.55 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.743934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0259  ribosome recycling factor  59.55 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00118776  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  54.6 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0611  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>