More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1564 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1564  aminotransferase class I and II  100 
 
 
400 aa  808    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  80.83 
 
 
399 aa  636    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  76.1 
 
 
392 aa  590  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  62.02 
 
 
409 aa  486  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  39.34 
 
 
412 aa  259  6e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  38.54 
 
 
404 aa  245  9e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  41.71 
 
 
367 aa  243  5e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  37.28 
 
 
386 aa  242  7e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  34.54 
 
 
398 aa  239  5.999999999999999e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  37.08 
 
 
393 aa  238  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  32.39 
 
 
375 aa  237  3e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  34.79 
 
 
398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  34.28 
 
 
398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  38.61 
 
 
370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  32.82 
 
 
388 aa  233  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  35.95 
 
 
396 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  36.25 
 
 
394 aa  231  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3133  aminotransferase  37.8 
 
 
370 aa  228  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.475875 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  35.29 
 
 
385 aa  228  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  36.15 
 
 
387 aa  226  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  37.92 
 
 
405 aa  225  8e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  34.62 
 
 
396 aa  225  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  37.28 
 
 
410 aa  223  6e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1200  aminotransferase, class I and II  36.55 
 
 
371 aa  223  7e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162477  normal  0.0266801 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  34.7 
 
 
396 aa  222  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  36.09 
 
 
389 aa  222  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  34.27 
 
 
390 aa  222  8e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  35.14 
 
 
402 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  34.86 
 
 
396 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  31.76 
 
 
395 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  35.86 
 
 
399 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  34.59 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  34.13 
 
 
399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  35.14 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  34.59 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  34.59 
 
 
396 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  34.59 
 
 
396 aa  220  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  34.59 
 
 
396 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  34.59 
 
 
396 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  31.17 
 
 
388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  34.59 
 
 
396 aa  219  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1589  aminotransferase class I and II  34.95 
 
 
388 aa  219  6e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.570274  normal  0.997375 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  37.08 
 
 
379 aa  218  1e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  31.9 
 
 
397 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  31.9 
 
 
397 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  31.3 
 
 
375 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  36.86 
 
 
388 aa  217  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  33.5 
 
 
396 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  36.59 
 
 
401 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  34.02 
 
 
386 aa  216  8e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  31.02 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  31.02 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  31.02 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  31.02 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  31.02 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  32.54 
 
 
375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  36 
 
 
392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  36.76 
 
 
386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  32.56 
 
 
391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  33.51 
 
 
395 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  33.85 
 
 
375 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  30.86 
 
 
395 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  36.44 
 
 
387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  35.87 
 
 
401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  34.62 
 
 
400 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  34.28 
 
 
388 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  31.02 
 
 
395 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  31.83 
 
 
390 aa  212  9e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  31.94 
 
 
387 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  32.91 
 
 
390 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  31.94 
 
 
387 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  30.77 
 
 
395 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  31.68 
 
 
387 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  38.73 
 
 
444 aa  210  3e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  33.68 
 
 
400 aa  210  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  35.24 
 
 
393 aa  210  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  34.91 
 
 
397 aa  210  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  30.27 
 
 
395 aa  210  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  35.47 
 
 
379 aa  210  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  30.79 
 
 
375 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  34.36 
 
 
380 aa  209  5e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  31.41 
 
 
387 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1274  aspartate aminotransferase  31.83 
 
 
392 aa  209  7e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.175604  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  31.97 
 
 
400 aa  209  9e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  38.07 
 
 
393 aa  209  9e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  30.6 
 
 
395 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  31.97 
 
 
407 aa  208  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  34.52 
 
 
393 aa  208  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  35.64 
 
 
393 aa  208  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  31.15 
 
 
387 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  35.87 
 
 
402 aa  207  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  31.61 
 
 
386 aa  208  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  34 
 
 
393 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  35.61 
 
 
409 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  32.56 
 
 
393 aa  207  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  32.17 
 
 
394 aa  207  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  30.89 
 
 
387 aa  207  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2805  aminotransferase class I and II  35.9 
 
 
393 aa  207  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1506  aminotransferase, class I and II  36.88 
 
 
368 aa  206  4e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  30.63 
 
 
387 aa  206  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>